MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	TAAAAT	2	12	38816	38827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019435	GGGAAT	2	12	79351	79362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019435	AATAGC	2	12	110366	110377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019435	AATCAA	2	12	113489	113500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019435	TAAAAA	2	12	134139	134150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019435	TTATTT	2	12	169263	169274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019435	TTGAAT	2	12	218648	218659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019435	TAACCC	2	12	218966	218977	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019435	TAAAAA	2	12	221592	221603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019435	AAATAG	2	12	226425	226436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019435	TACTCT	2	12	239906	239917	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019435	GAAAGG	2	12	240205	240216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019435	TAAAAA	2	12	242440	242451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019435	TGATTG	2	12	254841	254852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019435	ATTCTA	2	12	264619	264630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019435	AAAACA	2	12	269386	269397	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019435	TTTGAT	2	12	283076	283087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019435	TTTTTC	2	12	283128	283139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019435	TTTAAA	2	12	297474	297485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019435	AAGTTT	2	12	327260	327271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019435	TTGTTT	2	12	327699	327710	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019435	TTGCTT	2	12	335376	335387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019435	ATGATT	2	12	336509	336520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019435	GAAAAT	2	12	336617	336628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019435	ATTTTT	2	12	346779	346790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019435	TAAAAT	2	12	393594	393605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019435	TAAAAA	2	12	413548	413559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019435	GTCAAC	2	12	438352	438363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019435	AGAATT	2	12	438754	438765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019435	ATGAAA	2	12	439137	439148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019435	TTTTTA	2	12	443973	443984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019435	TTGAAA	2	12	444502	444513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019435	TTTTAA	2	12	449618	449629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019435	ACACCG	2	12	449711	449722	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019435	AAAACG	2	12	457963	457974	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019435	GTTCAA	2	12	473630	473641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019435	ATTGAA	2	12	474506	474517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019435	GGCTAG	2	12	475392	475403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019435	TATTGA	2	12	480844	480855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019435	ATATCT	2	12	485192	485203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019435	TGTTTT	2	12	492337	492348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019435	AAAATA	2	12	504954	504965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019435	TTATTT	2	12	505300	505311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019435	GAAAAA	2	12	519087	519098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019435	ATCAAA	2	12	519139	519150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019435	TGGAAG	2	12	546094	546105	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019435	GAAAAA	2	12	551425	551436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019435	TAAAAA	2	12	551469	551480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019435	TGGAAA	2	12	564390	564401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019435	GGAGAA	2	12	577806	577817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019435	GGTTAA	2	12	614934	614945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019435	TGTTAA	2	12	625122	625133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019435	GAATAA	2	12	647035	647046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019435	TAATTT	2	12	651859	651870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019435	ACTTGC	2	12	652369	652380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019435	GAAAAA	2	12	662364	662375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019435	AAGAAA	2	12	666117	666128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019435	AATGGA	2	12	682783	682794	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019435	GAATCA	2	12	700722	700733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019435	AAAAAT	2	12	712528	712539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019435	ATTTAT	2	12	717403	717414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019435	TATCAA	2	12	717995	718006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019435	TAGACT	2	12	733502	733513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019435	AATAAA	2	12	745739	745750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019435	GTTTTT	2	12	754071	754082	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019435	AATAAA	2	12	760987	760998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019435	CCTAAG	2	12	761564	761575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019435	ATTTGA	2	12	772892	772903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019435	TTATTT	2	12	777171	777182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019435	TCGCAA	2	12	789215	789226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019435	GTCATG	2	12	794413	794424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019435	AAAATC	2	12	822932	822943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019435	AAAATA	2	12	841773	841784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019435	AGTAAC	2	12	873657	873668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019435	AATCAA	2	12	887741	887752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019435	AATTTA	2	12	894006	894017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019435	AAGCTT	2	12	895187	895198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019435	AATTTT	2	12	895779	895790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019435	AGCTTC	2	12	896067	896078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019435	CTTCGG	2	12	897039	897050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019435	AATTTA	2	12	898349	898360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019435	CGCGTG	2	12	917631	917642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019435	TATAAA	2	12	925127	925138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019435	ATAACC	2	12	931352	931363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019435	TTTCTT	2	12	932450	932461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019435	TTAGAA	2	12	935115	935126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019435	GAAAAA	2	12	939272	939283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019435	ATCAAA	2	12	939324	939335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019435	ATTTTG	2	12	951626	951637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019435	GCTTTA	2	12	953617	953628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019435	TTTGAT	2	12	973546	973557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019435	TTTTTC	2	12	973598	973609	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019435	TATAAG	2	12	1004903	1004914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019435	AGCGGA	2	12	1026353	1026364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019435	GAAAAA	2	12	1027227	1027238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019435	ATCAAA	2	12	1027279	1027290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019435	ATAAAA	2	12	1036931	1036942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019435	TTATTT	2	12	1037218	1037229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019435	ACTTTT	2	12	1037980	1037991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019435	TTAAAA	2	12	1051995	1052006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019435	CTTTTC	2	12	1054534	1054545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019435	TTTTCC	2	12	1109310	1109321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019435	ATAAAA	2	12	1117188	1117199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019435	TCTTTT	2	12	1117222	1117233	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019435	CTTTTT	2	12	1167161	1167172	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019435	TCATAT	2	12	1168173	1168184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019435	TTTTGT	2	12	1176665	1176676	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019435	ATTAAA	2	12	1180456	1180467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019435	CAAAAT	2	12	1183307	1183318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019435	AAATAA	2	12	1193675	1193686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019435	TAAAAA	2	12	1221996	1222007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019435	ATATTG	2	12	1226165	1226176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019435	ATTTCT	2	12	1240815	1240826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019435	TATAAA	2	12	1241782	1241793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019435	ATAATC	2	12	1258672	1258683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019435	TTCCTT	2	12	1259320	1259331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019435	AAACCA	2	12	1265567	1265578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019435	ATAAAA	2	12	1268990	1269001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019435	TTTTTC	2	12	1293412	1293423	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019435	ATAATG	2	12	1308373	1308384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019435	ATTTTA	2	12	1326745	1326756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019435	TAAAAA	2	12	1338398	1338409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019435	CTTTTT	2	12	1348093	1348104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019435	TCAAAT	2	12	1389315	1389326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019435	TTTTTA	2	12	1396202	1396213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019435	ATTTAT	2	12	1397428	1397439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019435	TTTGAT	2	12	1412934	1412945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019435	TTTTTC	2	12	1412986	1412997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019435	TTCAAT	2	12	1419910	1419921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.