MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073324
2	NC_019435	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
3	NC_019435	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073325
4	NC_019435	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073326
5	NC_019435	TCAAAA	2	12	7004	7015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073327
6	NC_019435	AAAATG	2	12	7155	7166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073327
7	NC_019435	AAAGAT	2	12	11231	11242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073330
8	NC_019435	TAAAAA	2	12	12750	12761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073332
9	NC_019435	TTGACA	2	12	16732	16743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073334
10	NC_019435	AAATCA	2	12	20105	20116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073338
11	NC_019435	GCGTGA	2	12	24081	24092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073341
12	NC_019435	ATCTTC	2	12	24242	24253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414073341
13	NC_019435	TGTTTG	2	12	35043	35054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073349
14	NC_019435	GATAAT	2	12	36641	36652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073350
15	NC_019435	TCAGAG	2	12	36860	36871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073350
16	NC_019435	AAGGAA	2	12	36919	36930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073350
17	NC_019435	TTCACC	2	12	41580	41591	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414073354
18	NC_019435	CTTCAA	2	12	45840	45851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073357
19	NC_019435	TATAAA	2	12	46740	46751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073358
20	NC_019435	GGTCAG	2	12	49802	49813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073362
21	NC_019435	TTGCTT	2	12	51756	51767	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073364
22	NC_019435	TTGTTT	2	12	52065	52076	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	414073364
23	NC_019435	TCCAAG	2	12	55634	55645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073367
24	NC_019435	AGAACA	2	12	55664	55675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073367
25	NC_019435	ACAAGA	2	12	57803	57814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073368
26	NC_019435	TAGGCT	2	12	57932	57943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073369
27	NC_019435	AGCGAT	2	12	68538	68549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073379
28	NC_019435	TCAGAT	2	12	70526	70537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073382
29	NC_019435	ATTCAG	2	12	70716	70727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073382
30	NC_019435	ATTTTT	2	12	72586	72597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414073385
31	NC_019435	ATTTGC	2	12	78211	78222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073391
32	NC_019435	AAGCAA	2	12	78315	78326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073391
33	NC_019435	ATCAAA	2	12	81451	81462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073393
34	NC_019435	TTTTCG	2	12	82440	82451	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073394
35	NC_019435	AAAACC	2	12	85097	85108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073397
36	NC_019435	TGGACG	2	12	85588	85599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073397
37	NC_019435	TGGGAC	2	12	87803	87814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073401
38	NC_019435	CAGTTG	2	12	88665	88676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073402
39	NC_019435	AGCTGA	2	12	92060	92071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073404
40	NC_019435	TTTATC	2	12	94848	94859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073406
41	NC_019435	TGAACT	2	12	100207	100218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073412
42	NC_019435	TATGGG	2	12	105585	105596	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414073415
43	NC_019435	TTCATA	2	12	124123	124134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073432
44	NC_019435	ATTGCT	2	12	126150	126161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073434
45	NC_019435	TGCAGC	2	12	126233	126244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073434
46	NC_019435	TCATAA	2	12	129273	129284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073440
47	NC_019435	CAAAAG	2	12	129764	129775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073441
48	NC_019435	GTTTAA	2	12	130455	130466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073442
49	NC_019435	CAAACC	2	12	133333	133344	50 %	0 %	0 %	50 %	414073445
50	NC_019435	ATTAAT	2	12	138699	138710	50 %	50 %	0 %	0 %	414073450
51	NC_019435	TATAAT	2	12	139134	139145	50 %	50 %	0 %	0 %	414073450
52	NC_019435	GTGACT	2	12	144163	144174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073451
53	NC_019435	TAACTT	2	12	144534	144545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073451
54	NC_019435	ACCTGG	2	12	145488	145499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073453
55	NC_019435	ATAATT	2	12	154905	154916	50 %	50 %	0 %	0 %	414073461
56	NC_019435	TTGCTT	2	12	161255	161266	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073468
57	NC_019435	GCTTAT	2	12	162628	162639	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073469
58	NC_019435	GTAAAG	2	12	166537	166548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073471
59	NC_019435	GAATAC	2	12	169353	169364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073477
60	NC_019435	ATGAAA	2	12	169481	169492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073477
61	NC_019435	TTTGAA	2	12	169804	169815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073477
62	NC_019435	ATAAAA	2	12	173926	173937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073481
63	NC_019435	TTCGGC	2	12	174127	174138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073482
64	NC_019435	ATTGGG	2	12	175128	175139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414073482
65	NC_019435	AAATAG	2	12	177623	177634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073484
66	NC_019435	TCGTAA	2	12	178380	178391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073485
67	NC_019435	CTTTTT	2	12	182157	182168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414073489
68	NC_019435	ATGTTG	2	12	187559	187570	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073493
69	NC_019435	AGCAAT	2	12	188630	188641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073494
70	NC_019435	AGAAGT	2	12	188660	188671	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073494
71	NC_019435	AACTTT	2	12	188735	188746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073494
72	NC_019435	TTGGAA	2	12	191084	191095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073497
73	NC_019435	GAAGGT	2	12	194072	194083	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414073502
74	NC_019435	GAAAAC	2	12	194615	194626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073502
75	NC_019435	AGCAAA	2	12	195909	195920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073504
76	NC_019435	AAAAGC	2	12	195951	195962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073504
77	NC_019435	TGATAA	2	12	200271	200282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073509
78	NC_019435	TTGCTT	2	12	200400	200411	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073509
79	NC_019435	ATTTTA	2	12	201059	201070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073509
80	NC_019435	AGATGA	2	12	214198	214209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073521
81	NC_019435	GGGAGC	2	12	214477	214488	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	414073521
82	NC_019435	AAAAAT	2	12	214555	214566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073521
83	NC_019435	TGTTGC	2	12	215134	215145	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073521
84	NC_019435	AGTTTG	2	12	215771	215782	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073522
85	NC_019435	ACTAAT	2	12	217148	217159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073522
86	NC_019435	TGAAAA	2	12	223333	223344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073525
87	NC_019435	GAGTTA	2	12	226258	226269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073527
88	NC_019435	TGAAGA	2	12	227720	227731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073530
89	NC_019435	CTGACC	2	12	232118	232129	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414073536
90	NC_019435	GATGAC	2	12	232363	232374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073536
91	NC_019435	ACGTAA	2	12	237751	237762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073542
92	NC_019435	ACGTAA	2	12	237775	237786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073542
93	NC_019435	TGGAAT	2	12	244522	244533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073546
94	NC_019435	AAGCTC	2	12	251989	252000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073554
95	NC_019435	GTCATT	2	12	256947	256958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073556
96	NC_019435	AAGGCC	2	12	262148	262159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073559
97	NC_019435	TAACGA	2	12	263502	263513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073560
98	NC_019435	TGGCAT	2	12	264412	264423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073561
99	NC_019435	TTTGAT	2	12	266051	266062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073563
100	NC_019435	CTTAAC	2	12	268234	268245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073567
101	NC_019435	TTTAAC	2	12	269179	269190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073567
102	NC_019435	ATTTCC	2	12	276313	276324	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414073573
103	NC_019435	TGTATC	2	12	276925	276936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073573
104	NC_019435	TGATAT	2	12	277259	277270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073573
105	NC_019435	TGGTGC	2	12	284688	284699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414073578
106	NC_019435	GGCTCA	2	12	284803	284814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073578
107	NC_019435	AAAAAC	2	12	290042	290053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	414073583
108	NC_019435	GTCTTG	2	12	290186	290197	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073583
109	NC_019435	CTTGGT	2	12	292406	292417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073584
110	NC_019435	TCTTTT	2	12	295167	295178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414073587
111	NC_019435	ATTTTT	2	12	304973	304984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414073598
112	NC_019435	CCAACA	2	12	312050	312061	50 %	0 %	0 %	50 %	414073603
113	NC_019435	AACATC	2	12	313864	313875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414073605
114	NC_019435	AGGGAT	2	12	315842	315853	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414073607
115	NC_019435	TTGCTG	2	12	329875	329886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073619
116	NC_019435	TAATTA	2	12	330476	330487	50 %	50 %	0 %	0 %	414073619
117	NC_019435	GATTTT	3	18	334275	334292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073623
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227	NC_019435	TTGAAG	2	12	635468	635479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073878
228	NC_019435	CGTTTT	2	12	639093	639104	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073881
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230	NC_019435	TTGGAC	2	12	650912	650923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073889
231	NC_019435	TTTCAC	2	12	658830	658841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414073894
232	NC_019435	GGGCAA	2	12	667867	667878	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414073900
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334	NC_019435	GGAGCA	2	12	934734	934745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414074129
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337	NC_019435	AGGAGA	2	12	940993	941004	50 %	0 %	50 %	0 %	414074134
338	NC_019435	AGTTTT	2	12	946034	946045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414074139
339	NC_019435	TCAATC	2	12	955787	955798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414074147
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342	NC_019435	AGTTTC	2	12	959759	959770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414074150
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