MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019435	GAAAA	2	10	13869	13878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019435	CTTAA	2	10	25458	25467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019435	AAGTC	2	10	25599	25608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019435	CAAAA	2	10	27759	27768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019435	TAATC	2	10	36486	36495	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019435	AGTAA	2	10	37544	37553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019435	AGTTT	2	10	50519	50528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019435	GTCTT	2	10	51565	51574	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019435	CAAAT	2	10	53998	54007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019435	TACTA	2	10	59595	59604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019435	AATAT	2	10	60345	60354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019435	TGAAA	2	10	62969	62978	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019435	TTAGA	2	10	69362	69371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019435	ATTTT	2	10	76201	76210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019435	GTAAA	2	10	76776	76785	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019435	TCTTT	2	10	78956	78965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019435	TTGCT	2	10	79257	79266	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019435	ATAAA	2	10	88366	88375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019435	ATAGA	2	10	90234	90243	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019435	TATGA	2	10	97554	97563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019435	TTATA	2	10	98774	98783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019435	TATTC	2	10	108755	108764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019435	AATAA	2	10	111870	111879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019435	ATTTG	2	10	117589	117598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019435	GCTCC	2	10	117892	117901	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_019435	TAAAA	2	10	117965	117974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019435	TTTTA	2	10	123974	123983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019435	TTTAC	2	10	127525	127534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019435	TTGTT	2	10	128472	128481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019435	TAACA	2	10	134650	134659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019435	AAAAC	2	10	142847	142856	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019435	TGTTT	2	10	142880	142889	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019435	GAAAA	2	10	144922	144931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019435	TAATT	2	10	145264	145273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019435	TTTTA	2	10	160214	160223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019435	AATAA	2	10	165226	165235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019435	ATTTA	2	10	170564	170573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019435	TATAA	2	10	173497	173506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019435	AGGAA	2	10	187423	187432	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019435	TAAAA	2	10	190147	190156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019435	AAAGT	2	10	192368	192377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019435	ATTTG	2	10	220879	220888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019435	TTGAC	2	10	220937	220946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019435	TTTTC	2	10	236002	236011	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019435	AAAAT	2	10	236260	236269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019435	ATAAG	2	10	236298	236307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019435	TTAAT	2	10	236853	236862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019435	ATAAA	2	10	237111	237120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019435	ACCAA	2	10	238142	238151	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019435	CAGTT	2	10	238298	238307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019435	CAGGT	2	10	238693	238702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019435	GATTG	2	10	238910	238919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019435	TTTGG	2	10	240098	240107	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019435	TGAAT	2	10	242554	242563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019435	TTTTA	2	10	245475	245484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019435	TTGAT	2	10	249778	249787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019435	AAAAT	2	10	250132	250141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019435	TCATG	2	10	250426	250435	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019435	GCTAT	2	10	251846	251855	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019435	TATTT	2	10	253184	253193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019435	AAAAT	2	10	254211	254220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019435	AGAAA	2	10	254683	254692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019435	AGACA	2	10	259161	259170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019435	ATAGA	2	10	269528	269537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019435	CAAAG	2	10	274753	274762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019435	TCTTT	2	10	282353	282362	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019435	CTTTC	2	10	282418	282427	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019435	GAAAA	2	10	282473	282482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019435	TCACT	2	10	282570	282579	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019435	TCAAC	2	10	284095	284104	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_019435	AAATA	2	10	289858	289867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019435	AAAAG	2	10	293622	293631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019435	AATGA	2	10	294910	294919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019435	GCAAG	2	10	297953	297962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019435	AAATA	2	10	303743	303752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019435	AAAGA	2	10	308617	308626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019435	ATTGA	2	10	312620	312629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019435	CTTAT	2	10	314869	314878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019435	TTTCA	2	10	322982	322991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019435	TAAAA	2	10	324920	324929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019435	TTTTG	2	10	345843	345852	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019435	TAAAA	2	10	353897	353906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019435	TAAAT	2	10	364777	364786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019435	TAAAA	2	10	371809	371818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019435	ATATA	2	10	372760	372769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019435	CTTTC	2	10	379110	379119	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_019435	ATTAA	2	10	383544	383553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019435	TATAA	2	10	385287	385296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019435	AATTT	2	10	388566	388575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019435	ATCAT	2	10	390544	390553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019435	ATTTT	2	10	392516	392525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019435	CTTTG	2	10	396891	396900	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019435	TTTTA	2	10	398789	398798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019435	TAAAA	2	10	405001	405010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019435	TTATA	2	10	418829	418838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019435	AAATC	2	10	429788	429797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019435	TTTTA	2	10	431628	431637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019435	CCATT	2	10	432770	432779	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019435	AAAAG	2	10	448168	448177	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019435	CTTAT	2	10	448261	448270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019435	AGGTT	2	10	459259	459268	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019435	AAACA	2	10	468632	468641	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019435	AATTA	2	10	468945	468954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019435	ATAAA	2	10	469279	469288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019435	GTTTT	2	10	469753	469762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019435	TGGAA	2	10	471287	471296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019435	TAAAT	2	10	473223	473232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019435	TTAAA	2	10	479414	479423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019435	CAATT	2	10	485073	485082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019435	CTTTT	2	10	485399	485408	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019435	TTCAG	2	10	485809	485818	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019435	TAAAT	2	10	486510	486519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019435	TTTAG	2	10	486559	486568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019435	TCAGT	2	10	487847	487856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019435	CAAAC	2	10	489928	489937	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_019435	CTATT	2	10	496613	496622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019435	TTTGA	2	10	498420	498429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019435	GCTTG	2	10	499343	499352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019435	CTAAT	2	10	502649	502658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019435	TATAG	2	10	503122	503131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019435	CTATT	2	10	504877	504886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019435	AAAAT	2	10	505267	505276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019435	TAATT	2	10	505280	505289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019435	ATTTT	2	10	512793	512802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019435	TTTTG	2	10	515967	515976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019435	AGGAT	2	10	518623	518632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019435	AAATG	2	10	535241	535250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019435	CTAAG	2	10	536781	536790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019435	AGGAG	2	10	542070	542079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019435	TCGTG	2	10	542480	542489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019435	AGGGA	2	10	545988	545997	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019435	TGTAG	2	10	546465	546474	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019435	ATTTT	2	10	547752	547761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019435	TTATG	2	10	553690	553699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019435	TAAAA	2	10	556059	556068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019435	AATGA	2	10	560514	560523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019435	ACAAA	2	10	564261	564270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019435	TTATT	2	10	568532	568541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019435	AGAAA	2	10	570570	570579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019435	AATTT	2	10	573946	573955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019435	AATTT	2	10	586053	586062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019435	TCGAC	2	10	594624	594633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_019435	CTATT	2	10	595931	595940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019435	TTTGT	2	10	596578	596587	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019435	AATTC	2	10	598044	598053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019435	AAATT	2	10	598505	598514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019435	AGTAA	2	10	599230	599239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019435	ATTCA	2	10	599659	599668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_019435	GCTTA	2	10	610290	610299	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_019435	ATTTT	2	10	738178	738187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_019435	AATAT	2	10	739659	739668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_019435	CTATT	2	10	1970700	1970709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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