MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 1259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	414073326
2	NC_019435	GTCTT	2	10	4633	4642	0 %	60 %	20 %	20 %	414073326
3	NC_019435	ATGGT	2	10	12734	12743	20 %	40 %	40 %	0 %	414073332
4	NC_019435	ATTTT	2	10	15134	15143	20 %	80 %	0 %	0 %	414073334
5	NC_019435	TGCGA	2	10	16389	16398	20 %	20 %	40 %	20 %	414073334
6	NC_019435	TACTT	2	10	17034	17043	20 %	60 %	0 %	20 %	414073334
7	NC_019435	TGATT	2	10	19101	19110	20 %	60 %	20 %	0 %	414073337
8	NC_019435	TTTGG	2	10	22455	22464	0 %	60 %	40 %	0 %	414073340
9	NC_019435	TGGTA	2	10	24399	24408	20 %	40 %	40 %	0 %	414073341
10	NC_019435	TGGCT	2	10	26398	26407	0 %	40 %	40 %	20 %	414073342
11	NC_019435	ATTTT	2	10	26493	26502	20 %	80 %	0 %	0 %	414073342
12	NC_019435	AGAGA	2	10	27411	27420	60 %	0 %	40 %	0 %	414073342
13	NC_019435	GAAGA	2	10	30163	30172	60 %	0 %	40 %	0 %	414073344
14	NC_019435	TCTTT	2	10	31561	31570	0 %	80 %	0 %	20 %	414073345
15	NC_019435	TGGAT	2	10	34632	34641	20 %	40 %	40 %	0 %	414073348
16	NC_019435	AAAAG	2	10	35097	35106	80 %	0 %	20 %	0 %	414073349
17	NC_019435	TCAAA	2	10	35265	35274	60 %	20 %	0 %	20 %	414073349
18	NC_019435	GTGAG	2	10	36841	36850	20 %	20 %	60 %	0 %	414073350
19	NC_019435	TTTAT	2	10	37882	37891	20 %	80 %	0 %	0 %	414073351
20	NC_019435	AATTA	2	10	38256	38265	60 %	40 %	0 %	0 %	414073351
21	NC_019435	ATTAT	2	10	38529	38538	40 %	60 %	0 %	0 %	414073351
22	NC_019435	AATCA	2	10	40369	40378	60 %	20 %	0 %	20 %	414073353
23	NC_019435	TTTAA	2	10	40964	40973	40 %	60 %	0 %	0 %	414073353
24	NC_019435	GCTTG	2	10	44050	44059	0 %	40 %	40 %	20 %	414073356
25	NC_019435	TCCAT	2	10	44401	44410	20 %	40 %	0 %	40 %	414073356
26	NC_019435	AAAAT	2	10	48312	48321	80 %	20 %	0 %	0 %	414073360
27	NC_019435	ATTAA	2	10	51294	51303	60 %	40 %	0 %	0 %	414073363
28	NC_019435	CAAGC	2	10	56481	56490	40 %	0 %	20 %	40 %	414073367
29	NC_019435	CCATT	2	10	58722	58731	20 %	40 %	0 %	40 %	414073369
30	NC_019435	ACAAG	2	10	59945	59954	60 %	0 %	20 %	20 %	414073371
31	NC_019435	TCCAA	2	10	60101	60110	40 %	20 %	0 %	40 %	414073371
32	NC_019435	TGAGT	2	10	62453	62462	20 %	40 %	40 %	0 %	414073373
33	NC_019435	ATTGA	2	10	65793	65802	40 %	40 %	20 %	0 %	414073375
34	NC_019435	ATTTT	2	10	67316	67325	20 %	80 %	0 %	0 %	414073378
35	NC_019435	ATTTG	2	10	69175	69184	20 %	60 %	20 %	0 %	414073380
36	NC_019435	AATTC	2	10	69692	69701	40 %	40 %	0 %	20 %	414073381
37	NC_019435	TTCAA	2	10	70459	70468	40 %	40 %	0 %	20 %	414073382
38	NC_019435	GAAAT	2	10	71690	71699	60 %	20 %	20 %	0 %	414073383
39	NC_019435	ACTTT	2	10	73275	73284	20 %	60 %	0 %	20 %	414073385
40	NC_019435	TTATT	2	10	77770	77779	20 %	80 %	0 %	0 %	414073391
41	NC_019435	ACGAG	2	10	80588	80597	40 %	0 %	40 %	20 %	414073392
42	NC_019435	TGAGT	2	10	80631	80640	20 %	40 %	40 %	0 %	414073392
43	NC_019435	GCAGA	2	10	81246	81255	40 %	0 %	40 %	20 %	414073393
44	NC_019435	TTTTA	2	10	84809	84818	20 %	80 %	0 %	0 %	414073397
45	NC_019435	AAGCT	2	10	84982	84991	40 %	20 %	20 %	20 %	414073397
46	NC_019435	TGGAT	2	10	85977	85986	20 %	40 %	40 %	0 %	414073398
47	NC_019435	CAAGA	2	10	89363	89372	60 %	0 %	20 %	20 %	414073403
48	NC_019435	AAAGA	2	10	93851	93860	80 %	0 %	20 %	0 %	414073405
49	NC_019435	AGAGT	2	10	94261	94270	40 %	20 %	40 %	0 %	414073406
50	NC_019435	TGGTT	3	15	94933	94947	0 %	60 %	40 %	0 %	414073406
51	NC_019435	TTGAT	2	10	94948	94957	20 %	60 %	20 %	0 %	414073406
52	NC_019435	ATTTG	2	10	95278	95287	20 %	60 %	20 %	0 %	414073407
53	NC_019435	TCGTA	2	10	98009	98018	20 %	40 %	20 %	20 %	414073409
54	NC_019435	GATTT	2	10	101862	101871	20 %	60 %	20 %	0 %	414073412
55	NC_019435	TCAAA	2	10	104292	104301	60 %	20 %	0 %	20 %	414073415
56	NC_019435	TCGCA	2	10	107921	107930	20 %	20 %	20 %	40 %	414073419
57	NC_019435	TTTTA	2	10	110929	110938	20 %	80 %	0 %	0 %	414073421
58	NC_019435	CTCTA	2	10	112086	112095	20 %	40 %	0 %	40 %	414073422
59	NC_019435	GAAAA	2	10	114064	114073	80 %	0 %	20 %	0 %	414073424
60	NC_019435	TGGAT	2	10	118093	118102	20 %	40 %	40 %	0 %	414073426
61	NC_019435	GAAGG	2	10	118172	118181	40 %	0 %	60 %	0 %	414073426
62	NC_019435	AATTA	2	10	119074	119083	60 %	40 %	0 %	0 %	414073426
63	NC_019435	ATTTT	2	10	119980	119989	20 %	80 %	0 %	0 %	414073427
64	NC_019435	TTTTC	2	10	121284	121293	0 %	80 %	0 %	20 %	414073428
65	NC_019435	CCAAA	2	10	121829	121838	60 %	0 %	0 %	40 %	414073428
66	NC_019435	TGGCT	2	10	122793	122802	0 %	40 %	40 %	20 %	414073430
67	NC_019435	CAAAT	2	10	123372	123381	60 %	20 %	0 %	20 %	414073431
68	NC_019435	TTTTA	2	10	123644	123653	20 %	80 %	0 %	0 %	414073431
69	NC_019435	CAGGT	2	10	125845	125854	20 %	20 %	40 %	20 %	414073434
70	NC_019435	GTTTG	2	10	125906	125915	0 %	60 %	40 %	0 %	414073434
71	NC_019435	TTATT	2	10	127005	127014	20 %	80 %	0 %	0 %	414073436
72	NC_019435	TAAAA	2	10	128852	128861	80 %	20 %	0 %	0 %	414073439
73	NC_019435	CTCTA	2	10	135453	135462	20 %	40 %	0 %	40 %	414073447
74	NC_019435	TTAAC	2	10	137740	137749	40 %	40 %	0 %	20 %	414073450
75	NC_019435	AAACA	2	10	138496	138505	80 %	0 %	0 %	20 %	414073450
76	NC_019435	GAAAT	2	10	139252	139261	60 %	20 %	20 %	0 %	414073450
77	NC_019435	TTCAC	2	10	141622	141631	20 %	40 %	0 %	40 %	414073450
78	NC_019435	AAGAA	2	10	142405	142414	80 %	0 %	20 %	0 %	414073450
79	NC_019435	AATAT	2	10	144098	144107	60 %	40 %	0 %	0 %	414073451
80	NC_019435	AAAGA	2	10	144235	144244	80 %	0 %	20 %	0 %	414073451
81	NC_019435	AAATA	2	10	144485	144494	80 %	20 %	0 %	0 %	414073451
82	NC_019435	CTTCC	2	10	145062	145071	0 %	40 %	0 %	60 %	414073452
83	NC_019435	ATGGA	2	10	147773	147782	40 %	20 %	40 %	0 %	414073455
84	NC_019435	TACAG	2	10	148108	148117	40 %	20 %	20 %	20 %	414073455
85	NC_019435	ATTTT	2	10	154015	154024	20 %	80 %	0 %	0 %	414073460
86	NC_019435	TAATT	2	10	158513	158522	40 %	60 %	0 %	0 %	414073465
87	NC_019435	TACAA	2	10	159454	159463	60 %	20 %	0 %	20 %	414073466
88	NC_019435	TGATT	2	10	161832	161841	20 %	60 %	20 %	0 %	414073468
89	NC_019435	GATTG	2	10	163224	163233	20 %	40 %	40 %	0 %	414073469
90	NC_019435	TGGTT	2	10	163362	163371	0 %	60 %	40 %	0 %	414073469
91	NC_019435	AGCCA	2	10	165328	165337	40 %	0 %	20 %	40 %	414073471
92	NC_019435	TTGGC	2	10	166223	166232	0 %	40 %	40 %	20 %	414073471
93	NC_019435	AAAGT	2	10	167098	167107	60 %	20 %	20 %	0 %	414073473
94	NC_019435	AATTT	2	10	167257	167266	40 %	60 %	0 %	0 %	414073473
95	NC_019435	TTCTC	2	10	173060	173069	0 %	60 %	0 %	40 %	414073479
96	NC_019435	TTGGC	2	10	173840	173849	0 %	40 %	40 %	20 %	414073481
97	NC_019435	GTAAA	2	10	174558	174567	60 %	20 %	20 %	0 %	414073482
98	NC_019435	AAATT	2	10	175710	175719	60 %	40 %	0 %	0 %	414073483
99	NC_019435	ATTCG	2	10	177267	177276	20 %	40 %	20 %	20 %	414073484
100	NC_019435	ATTTT	2	10	178794	178803	20 %	80 %	0 %	0 %	414073486
101	NC_019435	TCACA	2	10	179188	179197	40 %	20 %	0 %	40 %	414073486
102	NC_019435	TTGGT	2	10	180334	180343	0 %	60 %	40 %	0 %	414073487
103	NC_019435	CAAGA	2	10	181498	181507	60 %	0 %	20 %	20 %	414073488
104	NC_019435	AATTG	2	10	181899	181908	40 %	40 %	20 %	0 %	414073489
105	NC_019435	ACAAT	2	10	184474	184483	60 %	20 %	0 %	20 %	414073491
106	NC_019435	AAATA	2	10	185635	185644	80 %	20 %	0 %	0 %	414073491
107	NC_019435	TCGAT	2	10	185706	185715	20 %	40 %	20 %	20 %	414073491
108	NC_019435	AAACC	2	10	189091	189100	60 %	0 %	0 %	40 %	414073494
109	NC_019435	TGGAA	2	10	196602	196611	40 %	20 %	40 %	0 %	414073505
110	NC_019435	TGATT	2	10	196681	196690	20 %	60 %	20 %	0 %	414073505
111	NC_019435	AATTA	2	10	197573	197582	60 %	40 %	0 %	0 %	414073506
112	NC_019435	TAAAT	2	10	200151	200160	60 %	40 %	0 %	0 %	414073508
113	NC_019435	ATAAA	2	10	204177	204186	80 %	20 %	0 %	0 %	414073510
114	NC_019435	TCTTA	2	10	204586	204595	20 %	60 %	0 %	20 %	414073510
115	NC_019435	TAAAA	2	10	209638	209647	80 %	20 %	0 %	0 %	414073515
116	NC_019435	TTCAT	2	10	210436	210445	20 %	60 %	0 %	20 %	414073517
117	NC_019435	AAAAT	2	10	210733	210742	80 %	20 %	0 %	0 %	414073517
118	NC_019435	ATAAA	2	10	211785	211794	80 %	20 %	0 %	0 %	414073518
119	NC_019435	AAAAG	2	10	213719	213728	80 %	0 %	20 %	0 %	414073520
120	NC_019435	TCATT	2	10	214524	214533	20 %	60 %	0 %	20 %	414073521
121	NC_019435	TTAGA	2	10	216441	216450	40 %	40 %	20 %	0 %	414073522
122	NC_019435	GAAGC	2	10	223491	223500	40 %	0 %	40 %	20 %	414073525
123	NC_019435	TCAAA	2	10	225046	225055	60 %	20 %	0 %	20 %	414073526
124	NC_019435	TGAAA	2	10	228053	228062	60 %	20 %	20 %	0 %	414073531
125	NC_019435	GAATT	2	10	230305	230314	40 %	40 %	20 %	0 %	414073534
126	NC_019435	AAAAG	2	10	231093	231102	80 %	0 %	20 %	0 %	414073535
127	NC_019435	GATTT	2	10	232864	232873	20 %	60 %	20 %	0 %	414073537
128	NC_019435	ATTGA	2	10	233249	233258	40 %	40 %	20 %	0 %	414073538
129	NC_019435	GGCTT	2	10	233327	233336	0 %	40 %	40 %	20 %	414073538
130	NC_019435	TTGTA	2	10	234693	234702	20 %	60 %	20 %	0 %	414073539
131	NC_019435	CTAGT	2	10	237526	237535	20 %	40 %	20 %	20 %	414073541
132	NC_019435	TAGAG	2	10	241408	241417	40 %	20 %	40 %	0 %	414073544
133	NC_019435	TTGGC	2	10	248802	248811	0 %	40 %	40 %	20 %	414073552
134	NC_019435	ATGCC	2	10	249157	249166	20 %	20 %	20 %	40 %	414073552
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