MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 24541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073324
2	NC_019435	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
3	NC_019435	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
4	NC_019435	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073324
5	NC_019435	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
6	NC_019435	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073324
7	NC_019435	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
8	NC_019435	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073324
9	NC_019435	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073324
10	NC_019435	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073324
11	NC_019435	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073324
12	NC_019435	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073324
13	NC_019435	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073325
14	NC_019435	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073325
15	NC_019435	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073325
16	NC_019435	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073325
17	NC_019435	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
18	NC_019435	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073325
19	NC_019435	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073325
20	NC_019435	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
21	NC_019435	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
22	NC_019435	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
23	NC_019435	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073325
24	NC_019435	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073325
25	NC_019435	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073325
26	NC_019435	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
27	NC_019435	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
28	NC_019435	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
29	NC_019435	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
30	NC_019435	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
31	NC_019435	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073326
32	NC_019435	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
33	NC_019435	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
34	NC_019435	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
35	NC_019435	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
36	NC_019435	AAC	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
37	NC_019435	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
38	NC_019435	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
39	NC_019435	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
40	NC_019435	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
41	NC_019435	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
42	NC_019435	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
43	NC_019435	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
44	NC_019435	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
45	NC_019435	AGA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
46	NC_019435	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
47	NC_019435	AAG	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
48	NC_019435	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
49	NC_019435	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
50	NC_019435	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
51	NC_019435	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073326
52	NC_019435	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073326
53	NC_019435	TTC	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
54	NC_019435	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
55	NC_019435	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
56	NC_019435	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
57	NC_019435	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
58	NC_019435	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
59	NC_019435	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
60	NC_019435	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
61	NC_019435	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
62	NC_019435	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
63	NC_019435	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
64	NC_019435	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
65	NC_019435	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
66	NC_019435	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
67	NC_019435	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
68	NC_019435	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
69	NC_019435	ATG	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
70	NC_019435	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
71	NC_019435	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
72	NC_019435	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073326
73	NC_019435	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073327
74	NC_019435	TGA	3	9	6304	6312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
75	NC_019435	AAG	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
76	NC_019435	TGA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
77	NC_019435	GCT	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073327
78	NC_019435	ATA	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073327
79	NC_019435	TTC	2	6	6934	6939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073327
80	NC_019435	TAG	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
81	NC_019435	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073327
82	NC_019435	ATT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073327
83	NC_019435	AGA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
84	NC_019435	ATG	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
85	NC_019435	CTT	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073327
86	NC_019435	AGA	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
87	NC_019435	CTT	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073327
88	NC_019435	GAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
89	NC_019435	AGA	2	6	7663	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
90	NC_019435	GCA	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073327
91	NC_019435	TAA	4	12	7783	7794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073327
92	NC_019435	TAT	2	6	8189	8194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073327
93	NC_019435	AAT	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073327
94	NC_019435	TGA	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
95	NC_019435	AGA	2	6	8479	8484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
96	NC_019435	GAA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
97	NC_019435	ATA	2	6	8955	8960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073327
98	NC_019435	TGA	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
99	NC_019435	AAG	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
100	NC_019435	TCA	2	6	9019	9024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073327
101	NC_019435	GCT	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073327
102	NC_019435	CTG	2	6	9177	9182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073327
103	NC_019435	TGA	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
104	NC_019435	TGA	2	6	9280	9285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
105	NC_019435	AAG	2	6	9381	9386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
106	NC_019435	AGG	2	6	9631	9636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073327
107	NC_019435	TTG	2	6	9651	9656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073327
108	NC_019435	TGA	3	9	9856	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073328
109	NC_019435	AAT	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073329
110	NC_019435	GAC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073329
111	NC_019435	CAG	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073330
112	NC_019435	CAA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073330
113	NC_019435	CAA	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073330
114	NC_019435	GAG	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073330
115	NC_019435	ATT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073330
116	NC_019435	GTT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073330
117	NC_019435	TGA	3	9	11077	11085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073330
118	NC_019435	AAT	2	6	11102	11107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073330
119	NC_019435	TGA	2	6	11320	11325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073330
120	NC_019435	TTG	2	6	11357	11362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073330
121	NC_019435	AGA	2	6	11398	11403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073330
122	NC_019435	GCG	2	6	11456	11461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414073330
123	NC_019435	GAA	2	6	11504	11509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073330
124	NC_019435	GAT	2	6	11525	11530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073330
125	NC_019435	CTT	2	6	11606	11611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073330
126	NC_019435	ATG	2	6	11751	11756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073330
127	NC_019435	GAA	2	6	11810	11815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073330
128	NC_019435	AAT	2	6	11998	12003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073331
129	NC_019435	GAA	2	6	12188	12193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073331
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252	NC_019435	AGT	2	6	22843	22848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
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254	NC_019435	TGA	2	6	22899	22904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
255	NC_019435	TAA	2	6	22905	22910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073341
256	NC_019435	TAC	2	6	23019	23024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073341
257	NC_019435	TAT	2	6	23052	23057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073341
258	NC_019435	ATG	2	6	23105	23110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
259	NC_019435	TCA	2	6	23134	23139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073341
260	NC_019435	TTG	2	6	23189	23194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073341
261	NC_019435	TCT	2	6	23198	23203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073341
262	NC_019435	ATG	2	6	23209	23214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
263	NC_019435	GGC	2	6	23239	23244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414073341
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267	NC_019435	CAG	2	6	23417	23422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073341
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269	NC_019435	GTG	2	6	23642	23647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073341
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271	NC_019435	TTG	2	6	23699	23704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073341
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274	NC_019435	TGC	2	6	24009	24014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073341
275	NC_019435	TGA	2	6	24021	24026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
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279	NC_019435	GAC	2	6	24281	24286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073341
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281	NC_019435	CTG	2	6	24479	24484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073341
282	NC_019435	CGT	2	6	24505	24510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073341
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289	NC_019435	TGA	2	6	24729	24734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073341
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376	NC_019435	AGA	2	6	32230	32235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073346
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