MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS3

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019433	TTAA	2	8	421	428	50 %	50 %	0 %	0 %	414073315
2	NC_019433	CGGA	2	8	555	562	25 %	0 %	50 %	25 %	414073315
3	NC_019433	CTAC	2	8	1123	1130	25 %	25 %	0 %	50 %	414073315
4	NC_019433	TGAG	2	8	1155	1162	25 %	25 %	50 %	0 %	414073315
5	NC_019433	AAAT	2	8	1428	1435	75 %	25 %	0 %	0 %	414073316
6	NC_019433	CAAT	2	8	1657	1664	50 %	25 %	0 %	25 %	414073316
7	NC_019433	AAAG	2	8	1800	1807	75 %	0 %	25 %	0 %	414073317
8	NC_019433	AAAG	2	8	1927	1934	75 %	0 %	25 %	0 %	414073317
9	NC_019433	TTGG	2	8	1940	1947	0 %	50 %	50 %	0 %	414073317
10	NC_019433	TGTT	2	8	2996	3003	0 %	75 %	25 %	0 %	414073317
11	NC_019433	CAAG	2	8	3141	3148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019433	ACCT	2	8	3173	3180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019433	TTTA	2	8	3188	3195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019433	CAAT	2	8	3449	3456	50 %	25 %	0 %	25 %	414073318
15	NC_019433	GTGA	2	8	4345	4352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019433	TGGG	2	8	4361	4368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019433	AATG	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019433	TGAA	2	8	4769	4776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019433	TGTT	2	8	4832	4839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019433	AAAG	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019433	ACTC	2	8	5260	5267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019433	TGTT	2	8	6053	6060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019433	ACTC	2	8	6134	6141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.