MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS3

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019433	AGT	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
2	NC_019433	GAA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
3	NC_019433	AGA	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
4	NC_019433	AGA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
5	NC_019433	ATG	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
6	NC_019433	TAT	2	6	492	497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
7	NC_019433	TGA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
8	NC_019433	AGA	2	6	690	695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
9	NC_019433	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
10	NC_019433	AGA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
11	NC_019433	TTA	2	6	871	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
12	NC_019433	ATT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
13	NC_019433	TGA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073316
14	NC_019433	ATA	2	6	1284	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073316
15	NC_019433	GTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073316
16	NC_019433	GTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073316
17	NC_019433	AGA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073316
18	NC_019433	AGA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073316
19	NC_019433	TGG	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073316
20	NC_019433	GAT	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073316
21	NC_019433	GAT	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
22	NC_019433	AAC	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
23	NC_019433	AAC	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
24	NC_019433	AGT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
25	NC_019433	ATG	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
26	NC_019433	AAC	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
27	NC_019433	TTC	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073317
28	NC_019433	AAC	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
29	NC_019433	TCA	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
30	NC_019433	ATC	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
31	NC_019433	GGT	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073317
32	NC_019433	TGA	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
33	NC_019433	GAT	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
34	NC_019433	GAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
35	NC_019433	GAT	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
36	NC_019433	ATT	2	6	2795	2800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073317
37	NC_019433	CTT	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073317
38	NC_019433	TCA	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
39	NC_019433	CTA	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019433	TAT	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019433	TAA	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019433	CTT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019433	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019433	GAA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318
45	NC_019433	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073318
46	NC_019433	ATG	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073318
47	NC_019433	ATT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073318
48	NC_019433	GTT	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073318
49	NC_019433	GAA	2	6	3891	3896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318
50	NC_019433	TAA	2	6	4134	4139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073318
51	NC_019433	GAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318
52	NC_019433	TGC	2	6	4355	4360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019433	CGA	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019433	TTA	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019433	TAG	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019433	ACT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019433	GAA	3	9	4875	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019433	CTT	2	6	4900	4905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019433	TGT	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019433	TTA	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019433	CTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019433	TGT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019433	TCA	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019433	TTG	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019433	GTT	2	6	5624	5629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019433	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019433	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019433	CAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019433	CAA	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019433	CTT	2	6	6047	6052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019433	ATA	2	6	6079	6084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019433	GAA	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019433	TTC	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.