MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS3

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019433	AGT	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
2	NC_019433	GAA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
3	NC_019433	AGA	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
4	NC_019433	AGA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
5	NC_019433	ATG	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
6	NC_019433	TAT	2	6	492	497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
7	NC_019433	TGA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
8	NC_019433	AGA	2	6	690	695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
9	NC_019433	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073315
10	NC_019433	AGA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073315
11	NC_019433	TTA	2	6	871	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
12	NC_019433	ATT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073315
13	NC_019433	TGA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073316
14	NC_019433	ATA	2	6	1284	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073316
15	NC_019433	GTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073316
16	NC_019433	GTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073316
17	NC_019433	AGA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073316
18	NC_019433	AGA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073316
19	NC_019433	TGG	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073316
20	NC_019433	GAT	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073316
21	NC_019433	GAT	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
22	NC_019433	AAC	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
23	NC_019433	AAC	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
24	NC_019433	AGT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
25	NC_019433	ATG	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
26	NC_019433	AAC	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
27	NC_019433	TTC	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073317
28	NC_019433	AAC	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073317
29	NC_019433	TCA	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
30	NC_019433	ATC	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
31	NC_019433	GGT	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073317
32	NC_019433	TGA	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
33	NC_019433	GAT	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
34	NC_019433	GAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
35	NC_019433	GAT	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073317
36	NC_019433	ATT	2	6	2795	2800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073317
37	NC_019433	CTT	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073317
38	NC_019433	TCA	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073317
39	NC_019433	GAA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318
40	NC_019433	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073318
41	NC_019433	ATG	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073318
42	NC_019433	ATT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073318
43	NC_019433	GTT	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073318
44	NC_019433	GAA	2	6	3891	3896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318
45	NC_019433	TAA	2	6	4134	4139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073318
46	NC_019433	GAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.