MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS5

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019432	TAT	2	6	2275	2280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019432	ATT	2	6	2430	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019432	TCA	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019432	CTT	2	6	2590	2595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019432	TAA	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019432	ATG	3	9	6788	6796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019432	AGA	3	9	6837	6845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019432	TAT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019432	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019432	CTA	2	6	7153	7158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019432	TAG	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019432	ACT	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019432	ATA	2	6	7320	7325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019432	TCG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019432	TAG	2	6	7410	7415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019432	TAG	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019432	TTA	2	6	7614	7619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019432	CTT	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019432	ATT	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019432	ATC	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019432	TCT	2	6	8536	8541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019432	CAA	2	6	8588	8593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019432	ACT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019432	AAT	2	6	9751	9756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019432	TGG	2	6	9828	9833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019432	ATT	2	6	9880	9885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019432	ATT	2	6	9980	9985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019432	TTC	2	6	9989	9994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019432	TCT	2	6	10029	10034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019432	TTA	2	6	10956	10961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019432	TAA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019432	ATT	2	6	11143	11148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019432	ATA	2	6	11598	11603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019432	GAA	2	6	11611	11616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019432	TTC	2	6	11635	11640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019432	AGG	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.