MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	ATTTA	2	10	4774	4783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019431	TCCCA	2	10	5851	5860	20 %	20 %	0 %	60 %	414073265
3	NC_019431	TAAAT	2	10	7254	7263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019431	ACTTA	2	10	8779	8788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019431	TGAAA	2	10	8821	8830	60 %	20 %	20 %	0 %	414073267
6	NC_019431	TATTT	2	10	10712	10721	20 %	80 %	0 %	0 %	414073268
7	NC_019431	ATTAT	2	10	13186	13195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019431	CATTT	2	10	13906	13915	20 %	60 %	0 %	20 %	414073270
9	NC_019431	AAAAT	2	10	14532	14541	80 %	20 %	0 %	0 %	414073270
10	NC_019431	ATTTA	2	10	14961	14970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019431	CTCTA	2	10	16719	16728	20 %	40 %	0 %	40 %	414073272
12	NC_019431	GAAGA	2	10	17960	17969	60 %	0 %	40 %	0 %	414073274
13	NC_019431	TCTTT	2	10	19368	19377	0 %	80 %	0 %	20 %	414073275
14	NC_019431	ATGTG	2	10	20198	20207	20 %	40 %	40 %	0 %	414073277
15	NC_019431	TTAAC	2	10	25731	25740	40 %	40 %	0 %	20 %	414073281
16	NC_019431	ATGCC	2	10	26106	26115	20 %	20 %	20 %	40 %	414073281
17	NC_019431	GAAAT	2	10	26403	26412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019431	TTCAG	2	10	27468	27477	20 %	40 %	20 %	20 %	414073283
19	NC_019431	TGAAA	2	10	27504	27513	60 %	20 %	20 %	0 %	414073283
20	NC_019431	AAAAC	2	10	28269	28278	80 %	0 %	0 %	20 %	414073283
21	NC_019431	GAAAA	2	10	28687	28696	80 %	0 %	20 %	0 %	414073283
22	NC_019431	CCAAT	2	10	29644	29653	40 %	20 %	0 %	40 %	414073284
23	NC_019431	TACAG	2	10	30626	30635	40 %	20 %	20 %	20 %	414073284
24	NC_019431	TTTTA	2	10	32197	32206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019431	TACAA	2	10	32585	32594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019431	AAACA	2	10	32695	32704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019431	TTTTC	2	10	32745	32754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019431	AATTG	2	10	33678	33687	40 %	40 %	20 %	0 %	414073288
29	NC_019431	CAAAT	2	10	34241	34250	60 %	20 %	0 %	20 %	414073289
30	NC_019431	TAATA	2	10	34728	34737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019431	TTAAG	2	10	35372	35381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019431	TTTTA	2	10	35419	35428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019431	CTTAA	2	10	36950	36959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019431	AATTA	2	10	37299	37308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019431	CTATA	2	10	38658	38667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019431	TATTT	2	10	38705	38714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019431	ATATT	2	10	38716	38725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019431	AATAA	2	10	39295	39304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019431	ATTTT	2	10	39794	39803	20 %	80 %	0 %	0 %	414073292
40	NC_019431	CTGTA	2	10	40924	40933	20 %	40 %	20 %	20 %	414073295
41	NC_019431	GATTG	2	10	41905	41914	20 %	40 %	40 %	0 %	414073295
42	NC_019431	TTTTC	2	10	42863	42872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019431	ATTAA	2	10	45271	45280	60 %	40 %	0 %	0 %	414073296
44	NC_019431	GCAAA	2	10	45745	45754	60 %	0 %	20 %	20 %	414073296
45	NC_019431	CAGAA	2	10	46458	46467	60 %	0 %	20 %	20 %	414073297
46	NC_019431	AAAAT	2	10	47562	47571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019431	GAACG	2	10	48110	48119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019431	GTTCT	2	10	50235	50244	0 %	60 %	20 %	20 %	414073299
49	NC_019431	ATTTT	2	10	50330	50339	20 %	80 %	0 %	0 %	414073299
50	NC_019431	CTATA	2	10	50642	50651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019431	AAGAA	2	10	51161	51170	80 %	0 %	20 %	0 %	414073301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.