MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	ATTTA	2	10	4774	4783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019431	TAAAT	2	10	7254	7263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019431	ACTTA	2	10	8779	8788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019431	ATTAT	2	10	13186	13195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019431	ATTTA	2	10	14961	14970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019431	GAAAT	2	10	26403	26412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019431	TTTTA	2	10	32197	32206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019431	TACAA	2	10	32585	32594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019431	AAACA	2	10	32695	32704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019431	TTTTC	2	10	32745	32754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019431	TAATA	2	10	34728	34737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019431	TTAAG	2	10	35372	35381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019431	TTTTA	2	10	35419	35428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019431	CTTAA	2	10	36950	36959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019431	AATTA	2	10	37299	37308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019431	CTATA	2	10	38658	38667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019431	TATTT	2	10	38705	38714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019431	ATATT	2	10	38716	38725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019431	AATAA	2	10	39295	39304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	TTTTC	2	10	42863	42872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019431	AAAAT	2	10	47562	47571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019431	GAACG	2	10	48110	48119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019431	CTATA	2	10	50642	50651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.