MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	AATA	2	8	369	376	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
2	NC_019431	TGAT	2	8	476	483	25 %	50 %	25 %	0 %	414073261
3	NC_019431	AAAT	2	8	1230	1237	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
4	NC_019431	AATG	2	8	1326	1333	50 %	25 %	25 %	0 %	414073261
5	NC_019431	TAAA	2	8	1347	1354	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
6	NC_019431	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	414073262
7	NC_019431	TTGA	2	8	3251	3258	25 %	50 %	25 %	0 %	414073263
8	NC_019431	ATTC	2	8	3453	3460	25 %	50 %	0 %	25 %	414073263
9	NC_019431	ATCA	2	8	3653	3660	50 %	25 %	0 %	25 %	414073263
10	NC_019431	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
11	NC_019431	CTCG	2	8	4275	4282	0 %	25 %	25 %	50 %	414073264
12	NC_019431	TTGA	2	8	4616	4623	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
13	NC_019431	GAAA	2	8	5117	5124	75 %	0 %	25 %	0 %	414073265
14	NC_019431	TTGC	2	8	5414	5421	0 %	50 %	25 %	25 %	414073265
15	NC_019431	GTTT	2	8	5685	5692	0 %	75 %	25 %	0 %	414073265
16	NC_019431	GCAA	2	8	5834	5841	50 %	0 %	25 %	25 %	414073265
17	NC_019431	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	414073265
18	NC_019431	ATCC	2	8	8233	8240	25 %	25 %	0 %	50 %	414073266
19	NC_019431	TCAT	2	8	9162	9169	25 %	50 %	0 %	25 %	414073267
20	NC_019431	CTGA	2	8	9813	9820	25 %	25 %	25 %	25 %	414073268
21	NC_019431	GGTT	2	8	10521	10528	0 %	50 %	50 %	0 %	414073268
22	NC_019431	ATTT	2	8	11167	11174	25 %	75 %	0 %	0 %	414073268
23	NC_019431	CATA	2	8	13130	13137	50 %	25 %	0 %	25 %	414073269
24	NC_019431	ACTT	2	8	14041	14048	25 %	50 %	0 %	25 %	414073270
25	NC_019431	AAAT	2	8	14404	14411	75 %	25 %	0 %	0 %	414073270
26	NC_019431	TAAT	2	8	15376	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
27	NC_019431	AACA	2	8	15407	15414	75 %	0 %	0 %	25 %	414073271
28	NC_019431	AGTG	2	8	16849	16856	25 %	25 %	50 %	0 %	414073272
29	NC_019431	CATC	2	8	16961	16968	25 %	25 %	0 %	50 %	414073273
30	NC_019431	TTTA	2	8	17509	17516	25 %	75 %	0 %	0 %	414073274
31	NC_019431	TTTC	2	8	19116	19123	0 %	75 %	0 %	25 %	414073275
32	NC_019431	AATC	2	8	19195	19202	50 %	25 %	0 %	25 %	414073275
33	NC_019431	TGAT	2	8	19305	19312	25 %	50 %	25 %	0 %	414073275
34	NC_019431	CAAA	2	8	20281	20288	75 %	0 %	0 %	25 %	414073277
35	NC_019431	ACTA	2	8	20363	20370	50 %	25 %	0 %	25 %	414073277
36	NC_019431	GTTG	2	8	20655	20662	0 %	50 %	50 %	0 %	414073277
37	NC_019431	CTTT	2	8	20710	20717	0 %	75 %	0 %	25 %	414073277
38	NC_019431	ACCA	2	8	20727	20734	50 %	0 %	0 %	50 %	414073277
39	NC_019431	ATTT	2	8	21244	21251	25 %	75 %	0 %	0 %	414073278
40	NC_019431	TACT	2	8	21480	21487	25 %	50 %	0 %	25 %	414073278
41	NC_019431	GAAA	2	8	22162	22169	75 %	0 %	25 %	0 %	414073279
42	NC_019431	TTGC	2	8	22459	22466	0 %	50 %	25 %	25 %	414073279
43	NC_019431	AGTC	2	8	22772	22779	25 %	25 %	25 %	25 %	414073279
44	NC_019431	GTTT	2	8	22799	22806	0 %	75 %	25 %	0 %	414073279
45	NC_019431	GCAA	2	8	22879	22886	50 %	0 %	25 %	25 %	414073279
46	NC_019431	AAGA	2	8	23029	23036	75 %	0 %	25 %	0 %	414073279
47	NC_019431	AATT	2	8	24847	24854	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
48	NC_019431	AGGT	2	8	25084	25091	25 %	25 %	50 %	0 %	414073281
49	NC_019431	TTTG	2	8	25099	25106	0 %	75 %	25 %	0 %	414073281
50	NC_019431	GAAG	2	8	25136	25143	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
51	NC_019431	TTAT	2	8	25144	25151	25 %	75 %	0 %	0 %	414073281
52	NC_019431	TTGT	2	8	25274	25281	0 %	75 %	25 %	0 %	414073281
53	NC_019431	GAAA	2	8	25350	25357	75 %	0 %	25 %	0 %	414073281
54	NC_019431	AATA	2	8	25657	25664	75 %	25 %	0 %	0 %	414073281
55	NC_019431	TTTC	2	8	27688	27695	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
56	NC_019431	AAAG	2	8	27771	27778	75 %	0 %	25 %	0 %	414073283
57	NC_019431	TCAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	0 %	25 %	414073283
58	NC_019431	TTCT	2	8	27974	27981	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
59	NC_019431	TTCT	2	8	28004	28011	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
60	NC_019431	TCTT	2	8	28042	28049	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
61	NC_019431	AAGA	2	8	28370	28377	75 %	0 %	25 %	0 %	414073283
62	NC_019431	TTAA	2	8	28456	28463	50 %	50 %	0 %	0 %	414073283
63	NC_019431	CAAA	2	8	28612	28619	75 %	0 %	0 %	25 %	414073283
64	NC_019431	CTTT	2	8	29557	29564	0 %	75 %	0 %	25 %	414073284
65	NC_019431	TCAA	2	8	29630	29637	50 %	25 %	0 %	25 %	414073284
66	NC_019431	AAGC	2	8	29964	29971	50 %	0 %	25 %	25 %	414073284
67	NC_019431	AAGC	2	8	30159	30166	50 %	0 %	25 %	25 %	414073284
68	NC_019431	ATAG	2	8	30681	30688	50 %	25 %	25 %	0 %	414073284
69	NC_019431	GAAA	2	8	30808	30815	75 %	0 %	25 %	0 %	414073284
70	NC_019431	ATGG	3	12	31121	31132	25 %	25 %	50 %	0 %	414073285
71	NC_019431	GAAA	2	8	31263	31270	75 %	0 %	25 %	0 %	414073286
72	NC_019431	CAAA	2	8	31426	31433	75 %	0 %	0 %	25 %	414073286
73	NC_019431	CTAT	2	8	33447	33454	25 %	50 %	0 %	25 %	414073288
74	NC_019431	TTAG	2	8	33521	33528	25 %	50 %	25 %	0 %	414073288
75	NC_019431	ATTA	2	8	33628	33635	50 %	50 %	0 %	0 %	414073288
76	NC_019431	TTTA	2	8	33639	33646	25 %	75 %	0 %	0 %	414073288
77	NC_019431	TTTG	2	8	33660	33667	0 %	75 %	25 %	0 %	414073288
78	NC_019431	TTCA	2	8	34414	34421	25 %	50 %	0 %	25 %	414073289
79	NC_019431	TCTA	2	8	35707	35714	25 %	50 %	0 %	25 %	414073290
80	NC_019431	TAAA	2	8	35997	36004	75 %	25 %	0 %	0 %	414073290
81	NC_019431	CTAT	2	8	38205	38212	25 %	50 %	0 %	25 %	414073291
82	NC_019431	TTAT	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	414073291
83	NC_019431	CAAA	2	8	38395	38402	75 %	0 %	0 %	25 %	414073291
84	NC_019431	TCAC	2	8	38493	38500	25 %	25 %	0 %	50 %	414073291
85	NC_019431	CTTT	2	8	39636	39643	0 %	75 %	0 %	25 %	414073292
86	NC_019431	ATTT	2	8	39813	39820	25 %	75 %	0 %	0 %	414073292
87	NC_019431	CAAA	2	8	39894	39901	75 %	0 %	0 %	25 %	414073292
88	NC_019431	TAAA	2	8	39966	39973	75 %	25 %	0 %	0 %	414073292
89	NC_019431	TATT	2	8	40065	40072	25 %	75 %	0 %	0 %	414073292
90	NC_019431	CTTT	2	8	40105	40112	0 %	75 %	0 %	25 %	414073293
91	NC_019431	TTTC	2	8	40744	40751	0 %	75 %	0 %	25 %	414073295
92	NC_019431	CTAT	2	8	40871	40878	25 %	50 %	0 %	25 %	414073295
93	NC_019431	GCTT	2	8	41393	41400	0 %	50 %	25 %	25 %	414073295
94	NC_019431	GCTT	2	8	41588	41595	0 %	50 %	25 %	25 %	414073295
95	NC_019431	TTGA	2	8	41922	41929	25 %	50 %	25 %	0 %	414073295
96	NC_019431	AAAG	2	8	41995	42002	75 %	0 %	25 %	0 %	414073295
97	NC_019431	ATTT	2	8	44811	44818	25 %	75 %	0 %	0 %	414073296
98	NC_019431	ATGT	2	8	45087	45094	25 %	50 %	25 %	0 %	414073296
99	NC_019431	CTTT	2	8	45421	45428	0 %	75 %	0 %	25 %	414073296
100	NC_019431	CTTT	2	8	46049	46056	0 %	75 %	0 %	25 %	414073297
101	NC_019431	TCAA	2	8	47942	47949	50 %	25 %	0 %	25 %	414073298
102	NC_019431	TGTT	2	8	50000	50007	0 %	75 %	25 %	0 %	414073299
103	NC_019431	CAGC	2	8	50412	50419	25 %	0 %	25 %	50 %	414073299
104	NC_019431	AAAT	2	8	51301	51308	75 %	25 %	0 %	0 %	414073301
105	NC_019431	AAGT	2	8	51471	51478	50 %	25 %	25 %	0 %	414073301
106	NC_019431	TTGC	2	8	51623	51630	0 %	50 %	25 %	25 %	414073301
107	NC_019431	AGAA	2	8	51825	51832	75 %	0 %	25 %	0 %	414073301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.