MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	CTT	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019431	AAT	2	6	2845	2850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019431	GAA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019431	GAT	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019431	ATT	2	6	4738	4743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019431	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019431	ATC	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019431	TCA	2	6	4952	4957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019431	TCC	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019431	GAG	2	6	6657	6662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019431	AAT	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019431	GGA	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019431	TAT	2	6	6824	6829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019431	CTT	2	6	6859	6864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019431	ATA	2	6	7053	7058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019431	GGA	2	6	7098	7103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019431	GCT	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019431	AAT	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019431	AAG	2	6	7304	7309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	ATG	2	6	7331	7336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019431	TCT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019431	TTG	2	6	7497	7502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019431	CTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019431	AAG	2	6	7669	7674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019431	TAA	2	6	7694	7699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019431	AAT	2	6	7748	7753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019431	TTG	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019431	GAA	2	6	8734	8739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019431	AGG	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019431	GTT	2	6	11423	11428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019431	TGA	2	6	11575	11580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019431	TAA	2	6	11761	11766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019431	AGA	2	6	11816	11821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019431	TAG	2	6	11929	11934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019431	TTA	2	6	11938	11943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019431	GAA	2	6	12152	12157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019431	ATT	2	6	12573	12578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019431	TAG	2	6	12602	12607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019431	ACT	2	6	12637	12642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019431	AAT	2	6	13152	13157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019431	CGG	2	6	13245	13250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019431	GAC	2	6	13315	13320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019431	ATT	2	6	13391	13396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019431	ACC	2	6	13424	13429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019431	GAA	2	6	13430	13435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019431	TCA	2	6	13460	13465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019431	TAA	2	6	13499	13504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019431	TTG	2	6	13652	13657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019431	ATT	2	6	13664	13669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019431	TCC	2	6	14700	14705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019431	ATA	3	9	14799	14807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019431	TAA	2	6	14947	14952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019431	ATA	2	6	14980	14985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019431	TAA	2	6	15098	15103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019431	AAT	2	6	15992	15997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019431	ATA	2	6	16008	16013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019431	CTT	2	6	16029	16034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019431	TAT	2	6	16089	16094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019431	AAC	2	6	16229	16234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019431	CCG	2	6	16427	16432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019431	ATT	2	6	16512	16517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019431	TTG	2	6	17487	17492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019431	CCT	2	6	19664	19669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019431	ATT	2	6	19682	19687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019431	ATT	2	6	19690	19695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019431	ATT	2	6	19706	19711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019431	TAC	2	6	20809	20814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019431	TAT	2	6	20829	20834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019431	ATT	2	6	20874	20879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019431	ATT	2	6	20882	20887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019431	TAA	2	6	20896	20901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019431	TAT	2	6	20921	20926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019431	TAA	2	6	20936	20941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019431	GTT	2	6	21679	21684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019431	GTA	2	6	21685	21690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019431	AAG	2	6	21882	21887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019431	ATG	2	6	21900	21905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019431	ATC	2	6	21927	21932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019431	TCA	2	6	21997	22002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019431	GAC	2	6	22025	22030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019431	AGT	2	6	23530	23535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019431	GTA	2	6	23540	23545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019431	AAC	2	6	23580	23585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019431	AGT	2	6	23679	23684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019431	AGT	3	9	23688	23696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019431	AGT	2	6	23713	23718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019431	GAA	2	6	23723	23728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019431	TAC	3	9	23730	23738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019431	CTT	2	6	23748	23753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019431	ATT	3	9	24431	24439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019431	ACA	2	6	24531	24536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019431	ATA	2	6	24561	24566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019431	TGT	2	6	24817	24822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019431	ACA	2	6	26462	26467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019431	ATT	2	6	26495	26500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019431	AAT	2	6	26558	26563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019431	TAC	2	6	27072	27077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019431	TAA	2	6	27085	27090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019431	ATT	2	6	27110	27115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019431	ACT	2	6	27135	27140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019431	TTA	2	6	27147	27152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019431	TTC	2	6	27167	27172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019431	ATT	2	6	27228	27233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019431	TTA	2	6	30869	30874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019431	ATT	2	6	30934	30939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019431	TAA	2	6	31493	31498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019431	TTA	2	6	31531	31536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019431	TCT	2	6	31626	31631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019431	AAT	2	6	31655	31660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019431	GTT	2	6	31681	31686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019431	ATT	2	6	31747	31752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019431	CTT	2	6	32019	32024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019431	TCT	2	6	32081	32086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019431	ATA	2	6	32162	32167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019431	AAG	2	6	32183	32188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019431	GTT	2	6	32209	32214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019431	ATT	2	6	32270	32275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019431	AAG	2	6	32290	32295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019431	CTT	2	6	32312	32317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019431	AGA	2	6	32438	32443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019431	AGA	2	6	32475	32480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019431	AAG	2	6	32652	32657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019431	ATT	2	6	32667	32672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019431	TTA	2	6	32732	32737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019431	AAC	3	9	32778	32786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019431	AGG	2	6	32824	32829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019431	TGT	2	6	32955	32960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019431	ATT	2	6	32976	32981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019431	TAT	2	6	33000	33005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019431	AGA	3	9	33072	33080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019431	TGG	2	6	33096	33101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019431	CAA	2	6	33112	33117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019431	TTC	2	6	33138	33143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019431	ATT	2	6	33204	33209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019431	TGA	2	6	33277	33282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019431	ATT	2	6	33860	33865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019431	ATC	2	6	34480	34485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019431	ATT	3	9	34535	34543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019431	TAA	2	6	34638	34643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019431	CAT	2	6	34751	34756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019431	CTT	2	6	34766	34771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019431	CTT	2	6	34802	34807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.