MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	TGA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
2	NC_019431	TGC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073261
3	NC_019431	ATG	3	9	338	346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
4	NC_019431	CAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
5	NC_019431	TGA	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
6	NC_019431	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
7	NC_019431	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
8	NC_019431	GCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073261
9	NC_019431	CTT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
10	NC_019431	AAT	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
11	NC_019431	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073261
12	NC_019431	GAT	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
13	NC_019431	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
14	NC_019431	GTG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073261
15	NC_019431	TAA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
16	NC_019431	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073261
17	NC_019431	AAC	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
18	NC_019431	TCG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073262
19	NC_019431	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
20	NC_019431	CCA	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073262
21	NC_019431	TTA	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
22	NC_019431	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073262
23	NC_019431	TTC	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073262
24	NC_019431	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073262
25	NC_019431	ACA	3	9	3194	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
26	NC_019431	CAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
27	NC_019431	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
28	NC_019431	GAT	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
29	NC_019431	TCA	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
30	NC_019431	ATT	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
31	NC_019431	TAT	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
32	NC_019431	CAA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
33	NC_019431	ATT	3	9	3569	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
34	NC_019431	TGA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
35	NC_019431	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
36	NC_019431	ATT	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
37	NC_019431	GAT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
38	NC_019431	ATA	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073263
39	NC_019431	ACA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
40	NC_019431	GAT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
41	NC_019431	TGA	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
42	NC_019431	GAG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073264
43	NC_019431	AAC	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
44	NC_019431	TTA	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073264
45	NC_019431	AAC	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
46	NC_019431	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
47	NC_019431	AGA	3	9	4297	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
48	NC_019431	CAT	2	6	4315	4320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073264
49	NC_019431	TGA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
50	NC_019431	GAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
51	NC_019431	GAA	3	9	4589	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
52	NC_019431	GTT	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073264
53	NC_019431	TCC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073265
54	NC_019431	TGC	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073265
55	NC_019431	ACT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
56	NC_019431	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
57	NC_019431	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
58	NC_019431	AGA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
59	NC_019431	AGC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
60	NC_019431	TAG	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
61	NC_019431	TTA	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
62	NC_019431	GAA	3	9	5953	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
63	NC_019431	TCA	2	6	5993	5998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
64	NC_019431	TCA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
65	NC_019431	GGA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073265
66	NC_019431	ACG	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
67	NC_019431	AGT	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
68	NC_019431	TTC	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073266
69	NC_019431	CGT	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073266
70	NC_019431	AGC	2	6	8186	8191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073266
71	NC_019431	GAT	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073266
72	NC_019431	ATA	2	6	8462	8467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073266
73	NC_019431	AAT	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073266
74	NC_019431	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073267
75	NC_019431	AAG	2	6	9015	9020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073267
76	NC_019431	TAG	2	6	9028	9033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073267
77	NC_019431	TGT	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073267
78	NC_019431	TCA	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073267
79	NC_019431	GTG	2	6	9398	9403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073267
80	NC_019431	TAA	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073268
81	NC_019431	GAA	2	6	9477	9482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
82	NC_019431	TAG	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
83	NC_019431	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
84	NC_019431	ATT	2	6	9683	9688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073268
85	NC_019431	ATG	2	6	9733	9738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
86	NC_019431	GAA	2	6	9825	9830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
87	NC_019431	CAA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073268
88	NC_019431	TCA	2	6	10056	10061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073268
89	NC_019431	ATG	2	6	10129	10134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
90	NC_019431	TGT	2	6	10184	10189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073268
91	NC_019431	TCA	2	6	10349	10354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073268
92	NC_019431	AGA	2	6	10385	10390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
93	NC_019431	ATT	2	6	10470	10475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073268
94	NC_019431	AAC	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073268
95	NC_019431	ATG	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073268
96	NC_019431	CAT	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073268
97	NC_019431	GAA	2	6	10809	10814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073268
98	NC_019431	GTC	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073268
99	NC_019431	ATC	2	6	12810	12815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073269
100	NC_019431	ATC	2	6	12849	12854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073269
101	NC_019431	ATT	2	6	12877	12882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073269
102	NC_019431	TCT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073269
103	NC_019431	TTC	2	6	12939	12944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073269
104	NC_019431	AAT	2	6	13035	13040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073269
105	NC_019431	TAT	2	6	13046	13051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073269
106	NC_019431	TAA	2	6	13080	13085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073269
107	NC_019431	TAA	2	6	13750	13755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073270
108	NC_019431	ATT	3	9	13778	13786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073270
109	NC_019431	TAA	2	6	13851	13856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073270
110	NC_019431	CAT	2	6	13870	13875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073270
111	NC_019431	ATA	2	6	13918	13923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073270
112	NC_019431	TTA	2	6	13947	13952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073270
113	NC_019431	TTA	2	6	13977	13982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073270
114	NC_019431	GTT	2	6	14003	14008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073270
115	NC_019431	CTA	2	6	14279	14284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073270
116	NC_019431	CAT	2	6	14320	14325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073270
117	NC_019431	ATG	2	6	14373	14378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073270
118	NC_019431	AAG	2	6	14491	14496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073270
119	NC_019431	AAG	2	6	14547	14552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073270
120	NC_019431	ATT	2	6	14599	14604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073270
121	NC_019431	TTC	2	6	15225	15230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073271
122	NC_019431	TGA	2	6	15250	15255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073271
123	NC_019431	ACT	2	6	15286	15291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073271
124	NC_019431	ATG	2	6	15539	15544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073271
125	NC_019431	TCC	2	6	15576	15581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073271
126	NC_019431	ATC	2	6	15753	15758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073271
127	NC_019431	CTA	2	6	15829	15834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073271
128	NC_019431	CAT	2	6	15936	15941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073271
129	NC_019431	ACG	2	6	16681	16686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073272
130	NC_019431	CAA	2	6	16696	16701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073272
131	NC_019431	GAA	2	6	16797	16802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073272
132	NC_019431	TTA	2	6	16939	16944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073273
133	NC_019431	TCA	2	6	17056	17061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073273
134	NC_019431	TCT	2	6	17062	17067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073273
135	NC_019431	AGA	2	6	17220	17225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073273
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139	NC_019431	ATG	2	6	17594	17599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073274
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142	NC_019431	AGA	2	6	17727	17732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073274
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144	NC_019431	CAT	2	6	17785	17790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073274
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150	NC_019431	TTG	2	6	18706	18711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073275
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247	NC_019431	TAC	2	6	27838	27843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073283
248	NC_019431	TAT	2	6	27927	27932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073283
249	NC_019431	CTT	2	6	27960	27965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073283
250	NC_019431	GAA	2	6	28058	28063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073283
251	NC_019431	GTC	2	6	28156	28161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073283
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253	NC_019431	TTG	2	6	28235	28240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073283
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.