MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	GA	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	414073261
2	NC_019431	AT	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073261
3	NC_019431	AG	3	6	5212	5217	50 %	0 %	50 %	0 %	414073265
4	NC_019431	TA	3	6	7924	7929	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
5	NC_019431	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
6	NC_019431	TG	3	6	8390	8395	0 %	50 %	50 %	0 %	414073266
7	NC_019431	AT	3	6	9908	9913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073268
8	NC_019431	AT	3	6	11193	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	414073268
9	NC_019431	AT	3	6	13845	13850	50 %	50 %	0 %	0 %	414073270
10	NC_019431	AT	3	6	14624	14629	50 %	50 %	0 %	0 %	414073270
11	NC_019431	TA	3	6	15170	15175	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
12	NC_019431	TA	3	6	15467	15472	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
13	NC_019431	TC	3	6	17281	17286	0 %	50 %	0 %	50 %	414073273
14	NC_019431	AT	3	6	18494	18499	50 %	50 %	0 %	0 %	414073275
15	NC_019431	GA	3	6	18672	18677	50 %	0 %	50 %	0 %	414073275
16	NC_019431	TA	3	6	20023	20028	50 %	50 %	0 %	0 %	414073277
17	NC_019431	GT	3	6	20420	20425	0 %	50 %	50 %	0 %	414073277
18	NC_019431	TG	3	6	21018	21023	0 %	50 %	50 %	0 %	414073278
19	NC_019431	AG	3	6	22257	22262	50 %	0 %	50 %	0 %	414073279
20	NC_019431	AG	3	6	23381	23386	50 %	0 %	50 %	0 %	414073279
21	NC_019431	AT	3	6	25203	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
22	NC_019431	GA	3	6	25300	25305	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
23	NC_019431	TA	4	8	25393	25400	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
24	NC_019431	GA	3	6	25443	25448	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
25	NC_019431	AT	3	6	25725	25730	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
26	NC_019431	TA	3	6	26824	26829	50 %	50 %	0 %	0 %	414073282
27	NC_019431	TC	3	6	27379	27384	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
28	NC_019431	CT	3	6	28786	28791	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
29	NC_019431	CT	3	6	29305	29310	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
30	NC_019431	AG	3	6	29361	29366	50 %	0 %	50 %	0 %	414073283
31	NC_019431	CT	3	6	30075	30080	0 %	50 %	0 %	50 %	414073284
32	NC_019431	AC	3	6	31057	31062	50 %	0 %	0 %	50 %	414073285
33	NC_019431	TC	3	6	33606	33611	0 %	50 %	0 %	50 %	414073288
34	NC_019431	TA	3	6	34217	34222	50 %	50 %	0 %	0 %	414073289
35	NC_019431	AT	3	6	34262	34267	50 %	50 %	0 %	0 %	414073289
36	NC_019431	CT	3	6	35687	35692	0 %	50 %	0 %	50 %	414073290
37	NC_019431	TA	3	6	39847	39852	50 %	50 %	0 %	0 %	414073292
38	NC_019431	AT	3	6	39905	39910	50 %	50 %	0 %	0 %	414073292
39	NC_019431	TA	3	6	40371	40376	50 %	50 %	0 %	0 %	414073294
40	NC_019431	GA	3	6	41478	41483	50 %	0 %	50 %	0 %	414073295
41	NC_019431	AT	3	6	44871	44876	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
42	NC_019431	AT	3	6	45167	45172	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
43	NC_019431	TA	3	6	45374	45379	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
44	NC_019431	TG	3	6	50668	50673	0 %	50 %	50 %	0 %	414073300
45	NC_019431	AC	3	6	51022	51027	50 %	0 %	0 %	50 %	414073301
46	NC_019431	CT	3	6	51746	51751	0 %	50 %	0 %	50 %	414073301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.