MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	ATTTTC	2	12	1734	1745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073195
2	NC_019430	AGAAAT	2	12	1842	1853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073195
3	NC_019430	CAAGAA	2	12	3238	3249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073196
4	NC_019430	CAAAGG	2	12	5566	5577	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414073198
5	NC_019430	GATGAA	2	12	6248	6259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073198
6	NC_019430	GTAGAA	2	12	22435	22446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019430	ACCATA	2	12	22930	22941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414073211
8	NC_019430	GAAAAA	2	12	28092	28103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414073214
9	NC_019430	ATCAAA	2	12	28144	28155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073214
10	NC_019430	TAAAAT	2	12	30510	30521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073216
11	NC_019430	TTATCA	2	12	31742	31753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019430	TTATCT	2	12	35823	35834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073220
13	NC_019430	CAAGTA	2	12	37420	37431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073222
14	NC_019430	TCAGCA	2	12	38856	38867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073222
15	NC_019430	TACCGA	2	12	43889	43900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073226
16	NC_019430	GAAAAA	2	12	44352	44363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414073227
17	NC_019430	TAGAAA	2	12	46780	46791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073230
18	NC_019430	AATATC	2	12	51961	51972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073234
19	NC_019430	ATCATA	2	12	55855	55866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073236
20	NC_019430	TTTTAT	2	12	61252	61263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019430	CAATGA	2	12	65300	65311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073244
22	NC_019430	AAAAAT	2	12	65746	65757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	AAAATA	2	12	66183	66194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073246
24	NC_019430	TTGTCA	2	12	68126	68137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073248
25	NC_019430	AAACCA	2	12	69474	69485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073250
26	NC_019430	GAAAAA	2	12	72820	72831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414073253
27	NC_019430	TAGAAA	2	12	77215	77226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073256
28	NC_019430	TTACCA	2	12	79066	79077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073258

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.