MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	CTGTT	2	10	1393	1402	0 %	60 %	20 %	20 %	414073194
2	NC_019430	ATCTT	2	10	1819	1828	20 %	60 %	0 %	20 %	414073195
3	NC_019430	TTTTA	2	10	2394	2403	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
4	NC_019430	ATTTT	2	10	2501	2510	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
5	NC_019430	CATGG	2	10	2587	2596	20 %	20 %	40 %	20 %	414073196
6	NC_019430	AAAGA	2	10	2746	2755	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
7	NC_019430	AAAGA	2	10	3058	3067	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
8	NC_019430	AAATG	2	10	5331	5340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	GATTG	2	10	6859	6868	20 %	40 %	40 %	0 %	414073198
10	NC_019430	ATAAA	2	10	11151	11160	80 %	20 %	0 %	0 %	414073202
11	NC_019430	TAAGA	2	10	11491	11500	60 %	20 %	20 %	0 %	414073202
12	NC_019430	TTTAT	2	10	13819	13828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019430	AAGTG	2	10	14854	14863	40 %	20 %	40 %	0 %	414073203
14	NC_019430	AAAAT	2	10	17324	17333	80 %	20 %	0 %	0 %	414073204
15	NC_019430	TGCAA	2	10	19335	19344	40 %	20 %	20 %	20 %	414073206
16	NC_019430	TCTCT	2	10	19472	19481	0 %	60 %	0 %	40 %	414073206
17	NC_019430	TCTGT	2	10	20477	20486	0 %	60 %	20 %	20 %	414073207
18	NC_019430	CTCTA	2	10	24942	24951	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019430	ATTTC	2	10	27240	27249	20 %	60 %	0 %	20 %	414073213
20	NC_019430	TATTT	2	10	28942	28951	20 %	80 %	0 %	0 %	414073215
21	NC_019430	ATAAA	2	10	29303	29312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019430	CCCAA	2	10	29771	29780	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019430	TAAAT	2	10	37275	37284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019430	GACTA	2	10	41511	41520	40 %	20 %	20 %	20 %	414073224
25	NC_019430	CTTTT	2	10	43037	43046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019430	TTAAG	2	10	46508	46517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019430	TTTTA	2	10	46555	46564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019430	CTTAA	2	10	48086	48095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019430	TAATT	2	10	48678	48687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019430	TAGAG	2	10	49995	50004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019430	AATTA	2	10	50225	50234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019430	GAATG	2	10	50652	50661	40 %	20 %	40 %	0 %	414073232
33	NC_019430	TTTCA	2	10	52254	52263	20 %	60 %	0 %	20 %	414073234
34	NC_019430	TTCTT	2	10	53396	53405	0 %	80 %	0 %	20 %	414073235
35	NC_019430	ATTGA	2	10	53762	53771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019430	TTTGT	2	10	56683	56692	0 %	80 %	20 %	0 %	414073236
37	NC_019430	CCAAT	2	10	56994	57003	40 %	20 %	0 %	40 %	414073236
38	NC_019430	CCTTC	2	10	58304	58313	0 %	40 %	0 %	60 %	414073238
39	NC_019430	AAAAT	2	10	58388	58397	80 %	20 %	0 %	0 %	414073238
40	NC_019430	CATTC	2	10	59144	59153	20 %	40 %	0 %	40 %	414073239
41	NC_019430	ATACT	2	10	59972	59981	40 %	40 %	0 %	20 %	414073239
42	NC_019430	TTCAA	2	10	60171	60180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019430	TTTTA	2	10	60284	60293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019430	TAAAA	2	10	63297	63306	80 %	20 %	0 %	0 %	414073242
45	NC_019430	ATCCT	2	10	63590	63599	20 %	40 %	0 %	40 %	414073242
46	NC_019430	TATAA	2	10	63749	63758	60 %	40 %	0 %	0 %	414073242
47	NC_019430	ATAAA	2	10	63869	63878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019430	ATTAT	2	10	64319	64328	40 %	60 %	0 %	0 %	414073243
49	NC_019430	AAAAT	2	10	65776	65785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019430	GAACG	2	10	66324	66333	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019430	TTTTA	2	10	66623	66632	20 %	80 %	0 %	0 %	414073247
52	NC_019430	TTTGC	2	10	67474	67483	0 %	60 %	20 %	20 %	414073248
53	NC_019430	AACAG	2	10	69622	69631	60 %	0 %	20 %	20 %	414073250
54	NC_019430	GTTTT	2	10	70372	70381	0 %	80 %	20 %	0 %	414073251
55	NC_019430	TTTGG	2	10	70984	70993	0 %	60 %	40 %	0 %	414073251
56	NC_019430	GATTT	2	10	71337	71346	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
57	NC_019430	TATTG	2	10	71495	71504	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
58	NC_019430	AAAAT	2	10	71845	71854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019430	AGTTG	2	10	73855	73864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019430	ATATT	2	10	76513	76522	40 %	60 %	0 %	0 %	414073255
61	NC_019430	TTTGG	2	10	76782	76791	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019430	TTCCA	2	10	76859	76868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019430	TTAAG	2	10	76943	76952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019430	TTTTA	2	10	76990	76999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019430	CTTAA	2	10	78521	78530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019430	AGAAC	2	10	79448	79457	60 %	0 %	20 %	20 %	414073259

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.