MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	GAAA	2	8	57	64	75 %	0 %	25 %	0 %	414073193
2	NC_019430	AGAC	2	8	1014	1021	50 %	0 %	25 %	25 %	414073193
3	NC_019430	AGCA	2	8	1063	1070	50 %	0 %	25 %	25 %	414073193
4	NC_019430	TACC	2	8	1126	1133	25 %	25 %	0 %	50 %	414073193
5	NC_019430	CAAA	2	8	1179	1186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019430	TTTA	2	8	1360	1367	25 %	75 %	0 %	0 %	414073194
7	NC_019430	AATT	2	8	1459	1466	50 %	50 %	0 %	0 %	414073194
8	NC_019430	TCTT	2	8	1558	1565	0 %	75 %	0 %	25 %	414073194
9	NC_019430	TGAT	2	8	1646	1653	25 %	50 %	25 %	0 %	414073194
10	NC_019430	AAAG	2	8	2224	2231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019430	GAAA	2	8	2909	2916	75 %	0 %	25 %	0 %	414073196
12	NC_019430	ACAA	2	8	3029	3036	75 %	0 %	0 %	25 %	414073196
13	NC_019430	CAAA	2	8	3070	3077	75 %	0 %	0 %	25 %	414073196
14	NC_019430	TAAA	2	8	3308	3315	75 %	25 %	0 %	0 %	414073196
15	NC_019430	AAAG	2	8	3604	3611	75 %	0 %	25 %	0 %	414073196
16	NC_019430	GATT	2	8	3831	3838	25 %	50 %	25 %	0 %	414073196
17	NC_019430	GCTT	2	8	3887	3894	0 %	50 %	25 %	25 %	414073196
18	NC_019430	AATG	2	8	3982	3989	50 %	25 %	25 %	0 %	414073196
19	NC_019430	GCAA	2	8	4019	4026	50 %	0 %	25 %	25 %	414073196
20	NC_019430	TTTC	2	8	4682	4689	0 %	75 %	0 %	25 %	414073197
21	NC_019430	ATTC	2	8	5317	5324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019430	AAGG	2	8	5444	5451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	AGTC	2	8	5477	5484	25 %	25 %	25 %	25 %	414073198
24	NC_019430	TATT	2	8	5687	5694	25 %	75 %	0 %	0 %	414073198
25	NC_019430	CGAG	2	8	5795	5802	25 %	0 %	50 %	25 %	414073198
26	NC_019430	TTTA	2	8	5898	5905	25 %	75 %	0 %	0 %	414073198
27	NC_019430	TGTT	2	8	6039	6046	0 %	75 %	25 %	0 %	414073198
28	NC_019430	ATTC	2	8	6559	6566	25 %	50 %	0 %	25 %	414073198
29	NC_019430	AATT	2	8	7020	7027	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
30	NC_019430	AAGC	2	8	7132	7139	50 %	0 %	25 %	25 %	414073199
31	NC_019430	ACAA	2	8	7268	7275	75 %	0 %	0 %	25 %	414073199
32	NC_019430	TTTC	2	8	7958	7965	0 %	75 %	0 %	25 %	414073200
33	NC_019430	AAAT	2	8	8521	8528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019430	TGAC	2	8	9979	9986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019430	TAAA	2	8	10534	10541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019430	TTAT	2	8	10628	10635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019430	TTTA	2	8	10665	10672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019430	ATTT	2	8	10856	10863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019430	AATT	2	8	10903	10910	50 %	50 %	0 %	0 %	414073202
40	NC_019430	ATAG	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	414073202
41	NC_019430	ATAA	2	8	11473	11480	75 %	25 %	0 %	0 %	414073202
42	NC_019430	TGAC	2	8	12212	12219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019430	TAAA	2	8	12767	12774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019430	TTAT	2	8	12861	12868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019430	ATGT	2	8	13748	13755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019430	TCAG	2	8	14268	14275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019430	ATTT	2	8	14332	14339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019430	TTTA	2	8	14729	14736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019430	TTAA	2	8	14758	14765	50 %	50 %	0 %	0 %	414073203
50	NC_019430	AATG	2	8	14890	14897	50 %	25 %	25 %	0 %	414073203
51	NC_019430	TCTT	2	8	15457	15464	0 %	75 %	0 %	25 %	414073203
52	NC_019430	CTTT	2	8	15667	15674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019430	ATAA	2	8	16306	16313	75 %	25 %	0 %	0 %	414073204
54	NC_019430	ACCA	2	8	16840	16847	50 %	0 %	0 %	50 %	414073204
55	NC_019430	TGAA	2	8	16981	16988	50 %	25 %	25 %	0 %	414073204
56	NC_019430	GCAA	2	8	17719	17726	50 %	0 %	25 %	25 %	414073205
57	NC_019430	GTTT	2	8	17886	17893	0 %	75 %	25 %	0 %	414073205
58	NC_019430	CAAT	2	8	18281	18288	50 %	25 %	0 %	25 %	414073205
59	NC_019430	GATT	2	8	18540	18547	25 %	50 %	25 %	0 %	414073205
60	NC_019430	AGGT	2	8	18873	18880	25 %	25 %	50 %	0 %	414073205
61	NC_019430	AGAT	2	8	19037	19044	50 %	25 %	25 %	0 %	414073205
62	NC_019430	AGAT	2	8	19096	19103	50 %	25 %	25 %	0 %	414073205
63	NC_019430	ATTA	2	8	19165	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	414073205
64	NC_019430	GAGC	2	8	19423	19430	25 %	0 %	50 %	25 %	414073206
65	NC_019430	CAAT	2	8	21542	21549	50 %	25 %	0 %	25 %	414073209
66	NC_019430	TCAT	2	8	21604	21611	25 %	50 %	0 %	25 %	414073209
67	NC_019430	TTTA	2	8	21726	21733	25 %	75 %	0 %	0 %	414073209
68	NC_019430	ATAC	2	8	21766	21773	50 %	25 %	0 %	25 %	414073209
69	NC_019430	ATAG	2	8	21822	21829	50 %	25 %	25 %	0 %	414073209
70	NC_019430	GTAC	2	8	21838	21845	25 %	25 %	25 %	25 %	414073209
71	NC_019430	TTTA	2	8	22243	22250	25 %	75 %	0 %	0 %	414073210
72	NC_019430	GTCC	2	8	22290	22297	0 %	25 %	25 %	50 %	414073210
73	NC_019430	CAAA	2	8	22512	22519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019430	GTTT	2	8	22763	22770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019430	TTGT	2	8	22781	22788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019430	GAAA	2	8	22859	22866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019430	AAGG	2	8	23443	23450	50 %	0 %	50 %	0 %	414073211
78	NC_019430	TCGA	2	8	23516	23523	25 %	25 %	25 %	25 %	414073211
79	NC_019430	AGGG	2	8	23897	23904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019430	AGTG	2	8	25072	25079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019430	CATC	2	8	25184	25191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019430	ATTT	2	8	25793	25800	25 %	75 %	0 %	0 %	414073213
83	NC_019430	TGGT	2	8	26054	26061	0 %	50 %	50 %	0 %	414073213
84	NC_019430	TGAT	2	8	26981	26988	25 %	50 %	25 %	0 %	414073213
85	NC_019430	GTCT	2	8	27131	27138	0 %	50 %	25 %	25 %	414073213
86	NC_019430	TCAT	3	12	27325	27336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019430	AAGT	2	8	27496	27503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019430	TAAA	2	8	27742	27749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019430	GGAT	2	8	28191	28198	25 %	25 %	50 %	0 %	414073214
90	NC_019430	ATTT	2	8	29922	29929	25 %	75 %	0 %	0 %	414073216
91	NC_019430	ATAA	2	8	30350	30357	75 %	25 %	0 %	0 %	414073216
92	NC_019430	TCTT	2	8	30796	30803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019430	TCTT	2	8	30925	30932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019430	ATTT	2	8	31285	31292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019430	AGCT	2	8	31840	31847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019430	CCTT	2	8	31914	31921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019430	TTTC	2	8	31946	31953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019430	TAAA	2	8	31995	32002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019430	TGAC	2	8	32545	32552	25 %	25 %	25 %	25 %	414073217
100	NC_019430	TAAA	2	8	33100	33107	75 %	25 %	0 %	0 %	414073217
101	NC_019430	TTAT	2	8	33194	33201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019430	AGTG	2	8	33451	33458	25 %	25 %	50 %	0 %	414073218
103	NC_019430	CACT	2	8	33720	33727	25 %	25 %	0 %	50 %	414073218
104	NC_019430	ATTT	2	8	34281	34288	25 %	75 %	0 %	0 %	414073218
105	NC_019430	CTCG	2	8	34289	34296	0 %	25 %	25 %	50 %	414073218
106	NC_019430	ACTT	2	8	35696	35703	25 %	50 %	0 %	25 %	414073220
107	NC_019430	TACT	2	8	35977	35984	25 %	50 %	0 %	25 %	414073220
108	NC_019430	AACA	2	8	36006	36013	75 %	0 %	0 %	25 %	414073220
109	NC_019430	TCAA	2	8	36383	36390	50 %	25 %	0 %	25 %	414073221
110	NC_019430	CTTT	2	8	37022	37029	0 %	75 %	0 %	25 %	414073221
111	NC_019430	TGCT	2	8	37158	37165	0 %	50 %	25 %	25 %	414073221
112	NC_019430	AAGC	2	8	37294	37301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019430	ACAG	2	8	37623	37630	50 %	0 %	25 %	25 %	414073222
114	NC_019430	ACCT	2	8	39419	39426	25 %	25 %	0 %	50 %	414073223
115	NC_019430	GCAA	2	8	39483	39490	50 %	0 %	25 %	25 %	414073223
116	NC_019430	TTAA	2	8	39949	39956	50 %	50 %	0 %	0 %	414073223
117	NC_019430	CTTT	2	8	40940	40947	0 %	75 %	0 %	25 %	414073223
118	NC_019430	TATT	2	8	41306	41313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019430	GAAT	2	8	41400	41407	50 %	25 %	25 %	0 %	414073224
120	NC_019430	CAAT	2	8	41455	41462	50 %	25 %	0 %	25 %	414073224
121	NC_019430	GATT	2	8	41538	41545	25 %	50 %	25 %	0 %	414073224
122	NC_019430	TGAA	2	8	41859	41866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019430	CAAA	2	8	42519	42526	75 %	0 %	0 %	25 %	414073225
124	NC_019430	TATT	2	8	43054	43061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019430	GTCA	2	8	43506	43513	25 %	25 %	25 %	25 %	414073226
126	NC_019430	TTGA	2	8	44659	44666	25 %	50 %	25 %	0 %	414073227
127	NC_019430	TTTA	2	8	44876	44883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019430	TAAT	2	8	45195	45202	50 %	50 %	0 %	0 %	414073228
129	NC_019430	AACA	2	8	45226	45233	75 %	0 %	0 %	25 %	414073228
130	NC_019430	TGAC	2	8	45239	45246	25 %	25 %	25 %	25 %	414073228
131	NC_019430	TGCT	2	8	46220	46227	0 %	50 %	25 %	25 %	414073229
132	NC_019430	AGGA	2	8	46532	46539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019430	TCTA	2	8	46843	46850	25 %	50 %	0 %	25 %	414073230
134	NC_019430	TAAA	2	8	47133	47140	75 %	25 %	0 %	0 %	414073230
135	NC_019430	TCAT	2	8	48809	48816	25 %	50 %	0 %	25 %	414073231
136	NC_019430	ATTA	2	8	49267	49274	50 %	50 %	0 %	0 %	414073231
137	NC_019430	CTAT	2	8	49373	49380	25 %	50 %	0 %	25 %	414073231
138	NC_019430	TATT	2	8	49527	49534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019430	GATG	2	8	49755	49762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019430	ATAA	2	8	50190	50197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019430	TAGT	2	8	50278	50285	25 %	50 %	25 %	0 %	414073232
142	NC_019430	TTTA	2	8	50404	50411	25 %	75 %	0 %	0 %	414073232
143	NC_019430	ATTA	2	8	50444	50451	50 %	50 %	0 %	0 %	414073232
144	NC_019430	ATTT	2	8	50467	50474	25 %	75 %	0 %	0 %	414073232
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146	NC_019430	TAAA	2	8	50773	50780	75 %	25 %	0 %	0 %	414073232
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.