MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	CAAA	2	8	1179	1186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019430	AAAG	2	8	2224	2231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019430	ATTC	2	8	5317	5324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019430	AAGG	2	8	5444	5451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019430	AAAT	2	8	8521	8528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019430	TGAC	2	8	9979	9986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019430	TAAA	2	8	10534	10541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019430	TTAT	2	8	10628	10635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	TTTA	2	8	10665	10672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019430	ATTT	2	8	10856	10863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019430	TGAC	2	8	12212	12219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019430	TAAA	2	8	12767	12774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019430	TTAT	2	8	12861	12868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019430	ATGT	2	8	13748	13755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019430	TCAG	2	8	14268	14275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019430	ATTT	2	8	14332	14339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019430	TTTA	2	8	14729	14736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019430	CTTT	2	8	15667	15674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019430	CAAA	2	8	22512	22519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019430	GTTT	2	8	22763	22770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019430	TTGT	2	8	22781	22788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019430	GAAA	2	8	22859	22866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	AGGG	2	8	23897	23904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019430	AGTG	2	8	25072	25079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019430	CATC	2	8	25184	25191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019430	TCAT	3	12	27325	27336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019430	AAGT	2	8	27496	27503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019430	TAAA	2	8	27742	27749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019430	TCTT	2	8	30796	30803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019430	TCTT	2	8	30925	30932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019430	ATTT	2	8	31285	31292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019430	AGCT	2	8	31840	31847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019430	CCTT	2	8	31914	31921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019430	TTTC	2	8	31946	31953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019430	TAAA	2	8	31995	32002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019430	TTAT	2	8	33194	33201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019430	AAGC	2	8	37294	37301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019430	TATT	2	8	41306	41313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019430	TGAA	2	8	41859	41866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019430	TATT	2	8	43054	43061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019430	TTTA	2	8	44876	44883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019430	AGGA	2	8	46532	46539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019430	TATT	2	8	49527	49534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019430	GATG	2	8	49755	49762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019430	ATAA	2	8	50190	50197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019430	CTTT	2	8	51070	51077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019430	ATAA	2	8	53684	53691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019430	TAAT	2	8	54139	54146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019430	ACCA	2	8	58084	58091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019430	AATA	2	8	60256	60263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019430	TTAT	2	8	60264	60271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019430	AATA	2	8	61794	61801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019430	TTTG	2	8	62200	62207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019430	TAAA	2	8	62354	62361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019430	TCAA	2	8	62571	62578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019430	ATGA	2	8	63001	63008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019430	GTAA	2	8	63961	63968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019430	TAAG	2	8	68396	68403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019430	TCTT	2	8	71865	71872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019430	GAAC	2	8	71952	71959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019430	TGTT	2	8	71978	71985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019430	TTCA	2	8	72016	72023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019430	CATT	2	8	72114	72121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019430	TTTA	2	8	73344	73351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019430	TCAC	2	8	73383	73390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019430	CAGT	2	8	73560	73567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019430	ACAT	2	8	73616	73623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019430	TAGT	2	8	73632	73639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019430	TGAT	2	8	73833	73840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019430	AAAT	2	8	73900	73907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019430	TAGA	2	8	74082	74089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019430	TTAT	2	8	75175	75182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019430	ATTA	2	8	75465	75472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019430	CTTT	2	8	75553	75560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019430	AAAT	2	8	75797	75804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019430	CAAT	2	8	75941	75948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019430	ATTT	2	8	76821	76828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019430	AGGA	2	8	76967	76974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019430	TAGT	2	8	78563	78570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019430	ACTG	2	8	80496	80503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.