MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	GT	3	6	46	51	0 %	50 %	50 %	0 %	414073193
2	NC_019430	TA	3	6	2138	2143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019430	CA	3	6	3479	3484	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
4	NC_019430	AC	3	6	3915	3920	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
5	NC_019430	TA	3	6	4402	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
6	NC_019430	TA	3	6	4549	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
7	NC_019430	CT	3	6	5012	5017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019430	AT	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	AT	3	6	5632	5637	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
10	NC_019430	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
11	NC_019430	CA	3	6	6674	6679	50 %	0 %	0 %	50 %	414073198
12	NC_019430	CT	3	6	7578	7583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019430	TA	3	6	7678	7683	50 %	50 %	0 %	0 %	414073200
14	NC_019430	TA	3	6	7825	7830	50 %	50 %	0 %	0 %	414073200
15	NC_019430	CT	3	6	8288	8293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019430	AG	3	6	9315	9320	50 %	0 %	50 %	0 %	414073201
17	NC_019430	AT	3	6	12903	12908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019430	AT	3	6	13912	13917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019430	TA	3	6	15886	15891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019430	GA	3	6	16770	16775	50 %	0 %	50 %	0 %	414073204
21	NC_019430	GT	3	6	16998	17003	0 %	50 %	50 %	0 %	414073204
22	NC_019430	TG	3	6	17278	17283	0 %	50 %	50 %	0 %	414073204
23	NC_019430	AT	3	6	17518	17523	50 %	50 %	0 %	0 %	414073205
24	NC_019430	GA	3	6	18644	18649	50 %	0 %	50 %	0 %	414073205
25	NC_019430	CA	3	6	18696	18701	50 %	0 %	0 %	50 %	414073205
26	NC_019430	GA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	50 %	0 %	414073205
27	NC_019430	AG	3	6	19463	19468	50 %	0 %	50 %	0 %	414073206
28	NC_019430	AT	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	414073212
29	NC_019430	CT	3	6	27005	27010	0 %	50 %	0 %	50 %	414073213
30	NC_019430	AT	3	6	27899	27904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019430	CA	3	6	28036	28041	50 %	0 %	0 %	50 %	414073214
32	NC_019430	TA	3	6	28355	28360	50 %	50 %	0 %	0 %	414073214
33	NC_019430	AT	3	6	28649	28654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019430	TA	3	6	28691	28696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019430	CT	3	6	29019	29024	0 %	50 %	0 %	50 %	414073215
36	NC_019430	TA	3	6	31482	31487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019430	AT	3	6	32173	32178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019430	CT	4	8	40449	40456	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
39	NC_019430	CT	3	6	40629	40634	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
40	NC_019430	AT	3	6	41166	41171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019430	AT	3	6	41243	41248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019430	TC	3	6	41670	41675	0 %	50 %	0 %	50 %	414073224
43	NC_019430	GA	3	6	42006	42011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019430	AT	3	6	42307	42312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019430	TA	4	8	42895	42902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019430	TC	3	6	43282	43287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019430	GT	3	6	43908	43913	0 %	50 %	50 %	0 %	414073226
48	NC_019430	AG	3	6	43956	43961	50 %	0 %	50 %	0 %	414073226
49	NC_019430	AC	3	6	44492	44497	50 %	0 %	0 %	50 %	414073227
50	NC_019430	TA	3	6	44762	44767	50 %	50 %	0 %	0 %	414073227
51	NC_019430	CT	3	6	44789	44794	0 %	50 %	0 %	50 %	414073227
52	NC_019430	TA	3	6	44989	44994	50 %	50 %	0 %	0 %	414073228
53	NC_019430	TA	3	6	45286	45291	50 %	50 %	0 %	0 %	414073228
54	NC_019430	GA	3	6	45630	45635	50 %	0 %	50 %	0 %	414073228
55	NC_019430	TA	5	10	45961	45970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019430	TA	3	6	45979	45984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019430	TA	4	8	46460	46467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019430	CT	3	6	46823	46828	0 %	50 %	0 %	50 %	414073230
59	NC_019430	GA	3	6	48438	48443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019430	AT	4	8	49012	49019	50 %	50 %	0 %	0 %	414073231
61	NC_019430	TC	3	6	49259	49264	0 %	50 %	0 %	50 %	414073231
62	NC_019430	CT	3	6	49679	49684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019430	TG	3	6	50371	50376	0 %	50 %	50 %	0 %	414073232
64	NC_019430	AT	3	6	50836	50841	50 %	50 %	0 %	0 %	414073232
65	NC_019430	TA	3	6	51634	51639	50 %	50 %	0 %	0 %	414073233
66	NC_019430	AG	3	6	51857	51862	50 %	0 %	50 %	0 %	414073234
67	NC_019430	AT	4	8	52138	52145	50 %	50 %	0 %	0 %	414073234
68	NC_019430	AG	3	6	52378	52383	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
69	NC_019430	AG	3	6	52431	52436	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
70	NC_019430	TA	3	6	53545	53550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019430	TA	3	6	53567	53572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019430	TA	3	6	53589	53594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019430	AT	3	6	53675	53680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019430	AT	3	6	53958	53963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019430	CT	3	6	54851	54856	0 %	50 %	0 %	50 %	414073236
76	NC_019430	TA	3	6	54999	55004	50 %	50 %	0 %	0 %	414073236
77	NC_019430	TC	3	6	57643	57648	0 %	50 %	0 %	50 %	414073237
78	NC_019430	TA	3	6	60087	60092	50 %	50 %	0 %	0 %	414073239
79	NC_019430	TA	3	6	60242	60247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019430	AT	3	6	60274	60279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019430	TA	3	6	60523	60528	50 %	50 %	0 %	0 %	414073240
82	NC_019430	TA	3	6	62028	62033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019430	AT	3	6	62127	62132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019430	AG	3	6	62443	62448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019430	TA	3	6	62470	62475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019430	TC	3	6	63169	63174	0 %	50 %	0 %	50 %	414073242
87	NC_019430	GA	3	6	63184	63189	50 %	0 %	50 %	0 %	414073242
88	NC_019430	TA	3	6	63348	63353	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
89	NC_019430	TA	3	6	63510	63515	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
90	NC_019430	AT	3	6	63543	63548	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
91	NC_019430	TA	4	8	64587	64594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019430	AT	3	6	64832	64837	50 %	50 %	0 %	0 %	414073244
93	NC_019430	TA	3	6	66905	66910	50 %	50 %	0 %	0 %	414073247
94	NC_019430	TA	3	6	68487	68492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019430	TA	3	6	68509	68514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019430	TA	3	6	68531	68536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019430	AT	4	8	68618	68625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019430	AT	3	6	69086	69091	50 %	50 %	0 %	0 %	414073249
99	NC_019430	CT	3	6	69367	69372	0 %	50 %	0 %	50 %	414073250
100	NC_019430	TC	3	6	70440	70445	0 %	50 %	0 %	50 %	414073251
101	NC_019430	GA	3	6	71459	71464	50 %	0 %	50 %	0 %	414073252
102	NC_019430	TC	3	6	71966	71971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019430	AC	3	6	72960	72965	50 %	0 %	0 %	50 %	414073253
104	NC_019430	TA	3	6	73230	73235	50 %	50 %	0 %	0 %	414073253
105	NC_019430	CT	3	6	73257	73262	0 %	50 %	0 %	50 %	414073253
106	NC_019430	AT	3	6	73674	73679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019430	TA	3	6	73812	73817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019430	AT	3	6	73839	73844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019430	AT	3	6	75387	75392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019430	AG	3	6	75988	75993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019430	AT	3	6	76218	76223	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
112	NC_019430	AT	3	6	76367	76372	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
113	NC_019430	CT	3	6	77258	77263	0 %	50 %	0 %	50 %	414073256
114	NC_019430	CA	3	6	78746	78751	50 %	0 %	0 %	50 %	414073257
115	NC_019430	AG	3	6	78939	78944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019430	GA	3	6	80154	80159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019430	AT	3	6	80327	80332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019430	AT	4	8	80338	80345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.