MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	GT	3	6	46	51	0 %	50 %	50 %	0 %	414073193
2	NC_019430	CA	3	6	3479	3484	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
3	NC_019430	AC	3	6	3915	3920	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
4	NC_019430	TA	3	6	4402	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
5	NC_019430	TA	3	6	4549	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
6	NC_019430	AT	3	6	5632	5637	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
7	NC_019430	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
8	NC_019430	CA	3	6	6674	6679	50 %	0 %	0 %	50 %	414073198
9	NC_019430	TA	3	6	7678	7683	50 %	50 %	0 %	0 %	414073200
10	NC_019430	TA	3	6	7825	7830	50 %	50 %	0 %	0 %	414073200
11	NC_019430	AG	3	6	9315	9320	50 %	0 %	50 %	0 %	414073201
12	NC_019430	GA	3	6	16770	16775	50 %	0 %	50 %	0 %	414073204
13	NC_019430	GT	3	6	16998	17003	0 %	50 %	50 %	0 %	414073204
14	NC_019430	TG	3	6	17278	17283	0 %	50 %	50 %	0 %	414073204
15	NC_019430	AT	3	6	17518	17523	50 %	50 %	0 %	0 %	414073205
16	NC_019430	GA	3	6	18644	18649	50 %	0 %	50 %	0 %	414073205
17	NC_019430	CA	3	6	18696	18701	50 %	0 %	0 %	50 %	414073205
18	NC_019430	GA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	50 %	0 %	414073205
19	NC_019430	AG	3	6	19463	19468	50 %	0 %	50 %	0 %	414073206
20	NC_019430	AT	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	414073212
21	NC_019430	CT	3	6	27005	27010	0 %	50 %	0 %	50 %	414073213
22	NC_019430	CA	3	6	28036	28041	50 %	0 %	0 %	50 %	414073214
23	NC_019430	TA	3	6	28355	28360	50 %	50 %	0 %	0 %	414073214
24	NC_019430	CT	3	6	29019	29024	0 %	50 %	0 %	50 %	414073215
25	NC_019430	CT	4	8	40449	40456	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
26	NC_019430	CT	3	6	40629	40634	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
27	NC_019430	TC	3	6	41670	41675	0 %	50 %	0 %	50 %	414073224
28	NC_019430	GT	3	6	43908	43913	0 %	50 %	50 %	0 %	414073226
29	NC_019430	AG	3	6	43956	43961	50 %	0 %	50 %	0 %	414073226
30	NC_019430	AC	3	6	44492	44497	50 %	0 %	0 %	50 %	414073227
31	NC_019430	TA	3	6	44762	44767	50 %	50 %	0 %	0 %	414073227
32	NC_019430	CT	3	6	44789	44794	0 %	50 %	0 %	50 %	414073227
33	NC_019430	TA	3	6	44989	44994	50 %	50 %	0 %	0 %	414073228
34	NC_019430	TA	3	6	45286	45291	50 %	50 %	0 %	0 %	414073228
35	NC_019430	GA	3	6	45630	45635	50 %	0 %	50 %	0 %	414073228
36	NC_019430	CT	3	6	46823	46828	0 %	50 %	0 %	50 %	414073230
37	NC_019430	AT	4	8	49012	49019	50 %	50 %	0 %	0 %	414073231
38	NC_019430	TC	3	6	49259	49264	0 %	50 %	0 %	50 %	414073231
39	NC_019430	TG	3	6	50371	50376	0 %	50 %	50 %	0 %	414073232
40	NC_019430	AT	3	6	50836	50841	50 %	50 %	0 %	0 %	414073232
41	NC_019430	TA	3	6	51634	51639	50 %	50 %	0 %	0 %	414073233
42	NC_019430	AG	3	6	51857	51862	50 %	0 %	50 %	0 %	414073234
43	NC_019430	AT	4	8	52138	52145	50 %	50 %	0 %	0 %	414073234
44	NC_019430	AG	3	6	52378	52383	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
45	NC_019430	AG	3	6	52431	52436	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
46	NC_019430	CT	3	6	54851	54856	0 %	50 %	0 %	50 %	414073236
47	NC_019430	TA	3	6	54999	55004	50 %	50 %	0 %	0 %	414073236
48	NC_019430	TC	3	6	57643	57648	0 %	50 %	0 %	50 %	414073237
49	NC_019430	TA	3	6	60087	60092	50 %	50 %	0 %	0 %	414073239
50	NC_019430	TA	3	6	60523	60528	50 %	50 %	0 %	0 %	414073240
51	NC_019430	TC	3	6	63169	63174	0 %	50 %	0 %	50 %	414073242
52	NC_019430	GA	3	6	63184	63189	50 %	0 %	50 %	0 %	414073242
53	NC_019430	TA	3	6	63348	63353	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
54	NC_019430	TA	3	6	63510	63515	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
55	NC_019430	AT	3	6	63543	63548	50 %	50 %	0 %	0 %	414073242
56	NC_019430	AT	3	6	64832	64837	50 %	50 %	0 %	0 %	414073244
57	NC_019430	TA	3	6	66905	66910	50 %	50 %	0 %	0 %	414073247
58	NC_019430	AT	3	6	69086	69091	50 %	50 %	0 %	0 %	414073249
59	NC_019430	CT	3	6	69367	69372	0 %	50 %	0 %	50 %	414073250
60	NC_019430	TC	3	6	70440	70445	0 %	50 %	0 %	50 %	414073251
61	NC_019430	GA	3	6	71459	71464	50 %	0 %	50 %	0 %	414073252
62	NC_019430	AC	3	6	72960	72965	50 %	0 %	0 %	50 %	414073253
63	NC_019430	TA	3	6	73230	73235	50 %	50 %	0 %	0 %	414073253
64	NC_019430	CT	3	6	73257	73262	0 %	50 %	0 %	50 %	414073253
65	NC_019430	AT	3	6	76218	76223	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
66	NC_019430	AT	3	6	76367	76372	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
67	NC_019430	CT	3	6	77258	77263	0 %	50 %	0 %	50 %	414073256
68	NC_019430	CA	3	6	78746	78751	50 %	0 %	0 %	50 %	414073257

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.