MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019428	CAATC	2	10	1696	1705	40 %	20 %	0 %	40 %	414078961
2	NC_019428	TGGTC	2	10	2847	2856	0 %	40 %	40 %	20 %	414078961
3	NC_019428	TAATC	2	10	3230	3239	40 %	40 %	0 %	20 %	414078961
4	NC_019428	AATTC	2	10	3928	3937	40 %	40 %	0 %	20 %	414078961
5	NC_019428	AATCA	2	10	4066	4075	60 %	20 %	0 %	20 %	414078961
6	NC_019428	TTTAC	2	10	4836	4845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019428	ACTAA	2	10	7320	7329	60 %	20 %	0 %	20 %	414078963
8	NC_019428	ATAAG	2	10	7511	7520	60 %	20 %	20 %	0 %	414078964
9	NC_019428	CCCGC	2	10	8148	8157	0 %	0 %	20 %	80 %	414078965
10	NC_019428	TTTTC	2	10	11985	11994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019428	CTGAT	2	10	12516	12525	20 %	40 %	20 %	20 %	414078970
12	NC_019428	CTTTA	2	10	12656	12665	20 %	60 %	0 %	20 %	414078970
13	NC_019428	TTTAA	2	10	14300	14309	40 %	60 %	0 %	0 %	414078972
14	NC_019428	AAAAT	2	10	15224	15233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019428	CTGAA	2	10	16674	16683	40 %	20 %	20 %	20 %	414078974
16	NC_019428	GTAGG	2	10	17159	17168	20 %	20 %	60 %	0 %	414078974
17	NC_019428	TTGCA	2	10	17394	17403	20 %	40 %	20 %	20 %	414078974
18	NC_019428	CTTTG	2	10	17778	17787	0 %	60 %	20 %	20 %	414078974
19	NC_019428	AATGA	2	10	24934	24943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019428	CTAAA	2	10	28608	28617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019428	TGTCC	2	10	30598	30607	0 %	40 %	20 %	40 %	414078983
22	NC_019428	GTAAT	2	10	30948	30957	40 %	40 %	20 %	0 %	414078984
23	NC_019428	ATTTC	2	10	31951	31960	20 %	60 %	0 %	20 %	414078987
24	NC_019428	CAAAG	2	10	33045	33054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019428	ATTTA	2	10	33802	33811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019428	TCATT	2	10	35014	35023	20 %	60 %	0 %	20 %	414078992
27	NC_019428	TCATT	2	10	35050	35059	20 %	60 %	0 %	20 %	414078992
28	NC_019428	ACTAA	2	10	35341	35350	60 %	20 %	0 %	20 %	414078993
29	NC_019428	TCAAT	2	10	37808	37817	40 %	40 %	0 %	20 %	414078999
30	NC_019428	AACTA	2	10	38673	38682	60 %	20 %	0 %	20 %	414079001
31	NC_019428	TTGAG	2	10	40765	40774	20 %	40 %	40 %	0 %	414079005
32	NC_019428	TATAA	2	10	42535	42544	60 %	40 %	0 %	0 %	414079007
33	NC_019428	TCAAC	2	10	42692	42701	40 %	20 %	0 %	40 %	414079008
34	NC_019428	ACCTT	2	10	43018	43027	20 %	40 %	0 %	40 %	414079008
35	NC_019428	TAAAT	2	10	43530	43539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019428	ATTCA	2	10	43664	43673	40 %	40 %	0 %	20 %	414079010
37	NC_019428	TTAAT	2	10	47068	47077	40 %	60 %	0 %	0 %	414079013
38	NC_019428	ATTAC	2	10	47935	47944	40 %	40 %	0 %	20 %	414079015
39	NC_019428	AAAGT	2	10	49713	49722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019428	GTCTT	2	10	51977	51986	0 %	60 %	20 %	20 %	414079021
41	NC_019428	ACTTA	2	10	55375	55384	40 %	40 %	0 %	20 %	414079025
42	NC_019428	TATTT	2	10	55441	55450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019428	TCCAT	2	10	59458	59467	20 %	40 %	0 %	40 %	414079034
44	NC_019428	AGTAC	2	10	61843	61852	40 %	20 %	20 %	20 %	414079036
45	NC_019428	CATTC	2	10	65391	65400	20 %	40 %	0 %	40 %	414079039
46	NC_019428	AATTC	2	10	66416	66425	40 %	40 %	0 %	20 %	414079040
47	NC_019428	TCCAT	2	10	68884	68893	20 %	40 %	0 %	40 %	414079042
48	NC_019428	CTTGA	2	10	70366	70375	20 %	40 %	20 %	20 %	414079043
49	NC_019428	TTAAT	2	10	75609	75618	40 %	60 %	0 %	0 %	414079046
50	NC_019428	TTAAT	2	10	76044	76053	40 %	60 %	0 %	0 %	414079046
51	NC_019428	ATTTT	2	10	76604	76613	20 %	80 %	0 %	0 %	414079046
52	NC_019428	ATTTA	2	10	78598	78607	40 %	60 %	0 %	0 %	414079046
53	NC_019428	TCGAG	2	10	78832	78841	20 %	20 %	40 %	20 %	414079046
54	NC_019428	AATTA	2	10	78960	78969	60 %	40 %	0 %	0 %	414079047
55	NC_019428	TCTCT	2	10	80287	80296	0 %	60 %	0 %	40 %	414079048

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.