MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA01

Total Repeats: 2020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019427	AGTTAG	2	12	188	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075312
2	NC_019427	TCAAAT	2	12	1559	1570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019427	CTGTAG	2	12	5830	5841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075321
4	NC_019427	CGACAA	2	12	8867	8878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414075323
5	NC_019427	CTTTTT	2	12	9693	9704	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019427	GCTGGT	2	12	10984	10995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414075324
7	NC_019427	TGAAAC	2	12	12377	12388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075326
8	NC_019427	TACCAG	2	12	13008	13019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075327
9	NC_019427	TAATAT	2	12	14256	14267	50 %	50 %	0 %	0 %	414075327
10	NC_019427	TGCTAA	2	12	15352	15363	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075327
11	NC_019427	ACTTTT	2	12	17367	17378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075328
12	NC_019427	ATGATC	2	12	18089	18100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075328
13	NC_019427	TTTGAT	2	12	18614	18625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019427	GTTTTT	2	12	23161	23172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019427	ATGGTG	2	12	23973	23984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414075332
16	NC_019427	TAGCAA	2	12	27088	27099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075335
17	NC_019427	TAGTGA	2	12	27443	27454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075335
18	NC_019427	TTATTT	2	12	35991	36002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019427	CTAATT	2	12	39153	39164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075344
20	NC_019427	GACAAA	2	12	39814	39825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414075344
21	NC_019427	ACTTCG	2	12	41447	41458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019427	GTCACC	2	12	43914	43925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075348
23	NC_019427	CCCTCA	2	12	44317	44328	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	414075348
24	NC_019427	TAAAGA	2	12	46437	46448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075350
25	NC_019427	TATCAT	2	12	49949	49960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075354
26	NC_019427	TTATAT	2	12	52065	52076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019427	TGGTAA	2	12	66067	66078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075368
28	NC_019427	AATATC	2	12	67087	67098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019427	AGGATT	2	12	69591	69602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075370
30	NC_019427	TTTCTG	2	12	74652	74663	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075374
31	NC_019427	AATTTC	2	12	76702	76713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075377
32	NC_019427	ATTGAA	2	12	77135	77146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075377
33	NC_019427	GTTATC	2	12	77463	77474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075377
34	NC_019427	TATTTT	2	12	78220	78231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414075377
35	NC_019427	TGATAG	2	12	78850	78861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075378
36	NC_019427	GACCAC	2	12	79375	79386	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075380
37	NC_019427	TACTGC	2	12	79791	79802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075380
38	NC_019427	TTTGCA	2	12	83811	83822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075385
39	NC_019427	ACACCA	2	12	84178	84189	50 %	0 %	0 %	50 %	414075386
40	NC_019427	TTTGCG	2	12	85219	85230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075387
41	NC_019427	ATCAAT	2	12	88720	88731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075389
42	NC_019427	ACTTCC	2	12	89861	89872	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414075389
43	NC_019427	GCACAA	2	12	90105	90116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414075389
44	NC_019427	CATTGC	2	12	93189	93200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075391
45	NC_019427	AGCACC	2	12	95411	95422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075394
46	NC_019427	CTATAT	2	12	95695	95706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075394
47	NC_019427	TAGAAA	2	12	96762	96773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075395
48	NC_019427	TTAAAG	2	12	97491	97502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075395
49	NC_019427	CAGAAG	2	12	98073	98084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414075395
50	NC_019427	CAATAA	2	12	102508	102519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075399
51	NC_019427	CTAAAA	2	12	103242	103253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075399
52	NC_019427	TTCTAC	2	12	103388	103399	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019427	AATCCC	2	12	115865	115876	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414075410
54	NC_019427	AGCCGC	2	12	117320	117331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414075412
55	NC_019427	ATCTTC	2	12	117623	117634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075412
56	NC_019427	CTACAA	2	12	117655	117666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075412
57	NC_019427	TGGATA	2	12	122423	122434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075415
58	NC_019427	GAGACA	2	12	123558	123569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019427	GAGACA	2	12	123716	123727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019427	GAGACA	2	12	123875	123886	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019427	AACCTA	2	12	125342	125353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075417
62	NC_019427	CCAAAA	2	12	128151	128162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075418
63	NC_019427	TGAATT	2	12	130878	130889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075421
64	NC_019427	GATTTG	2	12	133856	133867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075423
65	NC_019427	AGATTT	2	12	136840	136851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019427	CCAACC	2	12	137335	137346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075427
67	NC_019427	TCCTGT	2	12	138971	138982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414075427
68	NC_019427	TTTTGC	2	12	140002	140013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075428
69	NC_019427	ACTTCA	2	12	144831	144842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075433
70	NC_019427	GCTATC	2	12	147425	147436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019427	GGGAAT	2	12	149959	149970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414075438
72	NC_019427	TATCAG	2	12	152328	152339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075439
73	NC_019427	GGTAAT	2	12	154055	154066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075440
74	NC_019427	AATTGG	2	12	155884	155895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075440
75	NC_019427	AGCTAA	2	12	155914	155925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075440
76	NC_019427	GTTTGG	2	12	156142	156153	0 %	50 %	50 %	0 %	414075440
77	NC_019427	GCAGAT	2	12	156527	156538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075440
78	NC_019427	GTTTTG	2	12	158665	158676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075441
79	NC_019427	ATCATA	2	12	159767	159778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075443
80	NC_019427	TAAAGA	2	12	159859	159870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075443
81	NC_019427	TTTAGC	2	12	161507	161518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075444
82	NC_019427	TTAAAC	2	12	163048	163059	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075445
83	NC_019427	CAGTTA	2	12	163968	163979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075446
84	NC_019427	TTGTTT	2	12	168773	168784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	414075449
85	NC_019427	TAAATG	2	12	172539	172550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075453
86	NC_019427	AATCCT	2	12	172892	172903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075454
87	NC_019427	GATTTG	2	12	173181	173192	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075454
88	NC_019427	AAAATA	2	12	177276	177287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414075457
89	NC_019427	TAGTAT	2	12	181439	181450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075461
90	NC_019427	GCTGTT	2	12	196990	197001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075474
91	NC_019427	CTGTAC	2	12	199072	199083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075476
92	NC_019427	GGGTTT	2	12	200333	200344	0 %	50 %	50 %	0 %	414075478
93	NC_019427	TTCTTG	2	12	205874	205885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075485
94	NC_019427	TGTAAA	2	12	207741	207752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075489
95	NC_019427	TAGCAG	2	12	208033	208044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075490
96	NC_019427	CTTTGA	2	12	209501	209512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075491
97	NC_019427	CTATTC	2	12	211896	211907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075494
98	NC_019427	ATGCTT	2	12	215891	215902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075497
99	NC_019427	GGTTTA	2	12	217692	217703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075498
100	NC_019427	AAACCA	2	12	224311	224322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075506
101	NC_019427	GTAGCT	2	12	224455	224466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075506
102	NC_019427	TGATTC	2	12	224938	224949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075507
103	NC_019427	ATAGAG	2	12	231531	231542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019427	TTACAT	2	12	231926	231937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019427	GATTTA	2	12	232812	232823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019427	TTCTAA	2	12	233790	233801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075514
107	NC_019427	ATCGCC	2	12	234147	234158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075514
108	NC_019427	TTAATT	2	12	236751	236762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019427	ATTCAT	2	12	239581	239592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075518
110	NC_019427	TCTTCC	2	12	240570	240581	0 %	50 %	0 %	50 %	414075519
111	NC_019427	CCATCA	2	12	243039	243050	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414075523
112	NC_019427	ATAGAC	2	12	245303	245314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019427	GGTGAC	2	12	250275	250286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075528
114	NC_019427	GTCAAG	2	12	253395	253406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075530
115	NC_019427	CCCAAG	2	12	260408	260419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075534
116	NC_019427	AAATTT	2	12	261659	261670	50 %	50 %	0 %	0 %	414075535
117	NC_019427	CGAAGT	2	12	263516	263527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019427	TTTAGG	2	12	266529	266540	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075537
119	NC_019427	CAAGAT	2	12	269878	269889	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075540
120	NC_019427	CTATTA	2	12	272431	272442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019427	TTTGGG	2	12	276032	276043	0 %	50 %	50 %	0 %	414075545
122	NC_019427	GATGCT	2	12	276740	276751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075545
123	NC_019427	AGACCT	2	12	277400	277411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075546
124	NC_019427	ATTTCT	2	12	285880	285891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075558
125	NC_019427	CTTCAG	2	12	286265	286276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075559
126	NC_019427	AGCATC	2	12	286454	286465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075560
127	NC_019427	TCTCTA	2	12	286641	286652	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075560
128	NC_019427	AGGTAG	2	12	289805	289816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414075563
129	NC_019427	TAAGAA	2	12	292604	292615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019427	TTAGAT	2	12	292794	292805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075568
131	NC_019427	AGCTTC	2	12	306465	306476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075581
132	NC_019427	CTTCTG	2	12	306569	306580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414075581
133	NC_019427	ATTGAT	2	12	307742	307753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075581
134	NC_019427	CCCAAC	2	12	308134	308145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075582
135	NC_019427	TGTTGG	2	12	309609	309620	0 %	50 %	50 %	0 %	414075583
136	NC_019427	AAGTTA	2	12	312471	312482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075585
137	NC_019427	TGGACG	2	12	313151	313162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075586
138	NC_019427	ATTAAA	2	12	313217	313228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075586
139	NC_019427	GCTTTT	2	12	314259	314270	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075587
140	NC_019427	TTTGCT	2	12	320969	320980	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075592
141	NC_019427	CCCAAC	2	12	324081	324092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075594
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143	NC_019427	ACCTGA	2	12	331659	331670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075604
144	NC_019427	ATCAGA	2	12	334920	334931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075607
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147	NC_019427	TTAAAT	2	12	341642	341653	50 %	50 %	0 %	0 %	414075613
148	NC_019427	CTAAAT	2	12	341873	341884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075613
149	NC_019427	CTTAGT	2	12	343146	343157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075614
150	NC_019427	TCAATA	2	12	344148	344159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075615
151	NC_019427	ATATCT	2	12	344391	344402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075615
152	NC_019427	AACAAA	2	12	347547	347558	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	414075619
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154	NC_019427	TGGGGC	2	12	353649	353660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	414075624
155	NC_019427	TGGGAA	2	12	354372	354383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414075625
156	NC_019427	TGAGCT	2	12	365462	365473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075635
157	NC_019427	ATCACA	2	12	366472	366483	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075637
158	NC_019427	GAAAAT	2	12	367450	367461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075637
159	NC_019427	TTGAGC	2	12	368541	368552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075639
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162	NC_019427	TAAAAA	2	12	384201	384212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019427	TTAATC	2	12	386063	386074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075660
164	NC_019427	GTCACC	2	12	388517	388528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075662
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167	NC_019427	ACAAAT	2	12	392559	392570	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_019427	GTGGCT	2	12	393395	393406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414075665
169	NC_019427	TCCTAA	2	12	393490	393501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075665
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188	NC_019427	CGGTTT	2	12	423707	423718	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075694
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215	NC_019427	TATTGC	2	12	480942	480953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075752
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221	NC_019427	ATGGTG	2	12	489122	489133	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414075760
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223	NC_019427	AGGGGA	2	12	494219	494230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
224	NC_019427	AAATTA	2	12	494607	494618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075764
225	NC_019427	GGTGAC	2	12	497456	497467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075767
226	NC_019427	AATTTA	2	12	499951	499962	50 %	50 %	0 %	0 %	414075769
227	NC_019427	TTTATC	2	12	500402	500413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075769
228	NC_019427	GTTGAT	2	12	504023	504034	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075774
229	NC_019427	ATTTAG	2	12	505797	505808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_019427	GTGCAG	2	12	507152	507163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075776
231	NC_019427	TCAAAA	2	12	507654	507665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075777
232	NC_019427	ACTTCG	2	12	508850	508861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_019427	GATCAA	2	12	509957	509968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075778
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235	NC_019427	TGCTGT	2	12	511858	511869	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075780
236	NC_019427	TTGGAA	2	12	513391	513402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075781
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239	NC_019427	GATGAG	2	12	514043	514054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_019427	ACCCAA	2	12	706062	706073	50 %	0 %	0 %	50 %	414075944
341	NC_019427	AATCCG	2	12	709297	709308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075945
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348	NC_019427	ATCTTC	2	12	726838	726849	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075962
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