MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA01

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019427	AGTTAG	2	12	188	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075312
2	NC_019427	CTGTAG	2	12	5830	5841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075321
3	NC_019427	CGACAA	2	12	8867	8878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414075323
4	NC_019427	GCTGGT	2	12	10984	10995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414075324
5	NC_019427	TGAAAC	2	12	12377	12388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075326
6	NC_019427	TACCAG	2	12	13008	13019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075327
7	NC_019427	TAATAT	2	12	14256	14267	50 %	50 %	0 %	0 %	414075327
8	NC_019427	TGCTAA	2	12	15352	15363	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075327
9	NC_019427	ACTTTT	2	12	17367	17378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075328
10	NC_019427	ATGATC	2	12	18089	18100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075328
11	NC_019427	ATGGTG	2	12	23973	23984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414075332
12	NC_019427	TAGCAA	2	12	27088	27099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075335
13	NC_019427	TAGTGA	2	12	27443	27454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075335
14	NC_019427	CTAATT	2	12	39153	39164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075344
15	NC_019427	GACAAA	2	12	39814	39825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414075344
16	NC_019427	GTCACC	2	12	43914	43925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075348
17	NC_019427	CCCTCA	2	12	44317	44328	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	414075348
18	NC_019427	TAAAGA	2	12	46437	46448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075350
19	NC_019427	TATCAT	2	12	49949	49960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075354
20	NC_019427	TGGTAA	2	12	66067	66078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075368
21	NC_019427	AGGATT	2	12	69591	69602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075370
22	NC_019427	TTTCTG	2	12	74652	74663	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075374
23	NC_019427	AATTTC	2	12	76702	76713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075377
24	NC_019427	ATTGAA	2	12	77135	77146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075377
25	NC_019427	GTTATC	2	12	77463	77474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075377
26	NC_019427	TATTTT	2	12	78220	78231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414075377
27	NC_019427	TGATAG	2	12	78850	78861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075378
28	NC_019427	GACCAC	2	12	79375	79386	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075380
29	NC_019427	TACTGC	2	12	79791	79802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075380
30	NC_019427	TTTGCA	2	12	83811	83822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075385
31	NC_019427	ACACCA	2	12	84178	84189	50 %	0 %	0 %	50 %	414075386
32	NC_019427	TTTGCG	2	12	85219	85230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075387
33	NC_019427	ATCAAT	2	12	88720	88731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075389
34	NC_019427	ACTTCC	2	12	89861	89872	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414075389
35	NC_019427	GCACAA	2	12	90105	90116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414075389
36	NC_019427	CATTGC	2	12	93189	93200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075391
37	NC_019427	AGCACC	2	12	95411	95422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075394
38	NC_019427	CTATAT	2	12	95695	95706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075394
39	NC_019427	TAGAAA	2	12	96762	96773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075395
40	NC_019427	TTAAAG	2	12	97491	97502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075395
41	NC_019427	CAGAAG	2	12	98073	98084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414075395
42	NC_019427	CAATAA	2	12	102508	102519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075399
43	NC_019427	CTAAAA	2	12	103242	103253	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075399
44	NC_019427	AATCCC	2	12	115865	115876	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414075410
45	NC_019427	AGCCGC	2	12	117320	117331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414075412
46	NC_019427	ATCTTC	2	12	117623	117634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075412
47	NC_019427	CTACAA	2	12	117655	117666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075412
48	NC_019427	TGGATA	2	12	122423	122434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075415
49	NC_019427	AACCTA	2	12	125342	125353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075417
50	NC_019427	CCAAAA	2	12	128151	128162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075418
51	NC_019427	TGAATT	2	12	130878	130889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075421
52	NC_019427	GATTTG	2	12	133856	133867	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075423
53	NC_019427	CCAACC	2	12	137335	137346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075427
54	NC_019427	TCCTGT	2	12	138971	138982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414075427
55	NC_019427	TTTTGC	2	12	140002	140013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075428
56	NC_019427	ACTTCA	2	12	144831	144842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075433
57	NC_019427	GGGAAT	2	12	149959	149970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414075438
58	NC_019427	TATCAG	2	12	152328	152339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075439
59	NC_019427	GGTAAT	2	12	154055	154066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075440
60	NC_019427	AATTGG	2	12	155884	155895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075440
61	NC_019427	AGCTAA	2	12	155914	155925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075440
62	NC_019427	GTTTGG	2	12	156142	156153	0 %	50 %	50 %	0 %	414075440
63	NC_019427	GCAGAT	2	12	156527	156538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075440
64	NC_019427	GTTTTG	2	12	158665	158676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075441
65	NC_019427	ATCATA	2	12	159767	159778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075443
66	NC_019427	TAAAGA	2	12	159859	159870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414075443
67	NC_019427	TTTAGC	2	12	161507	161518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075444
68	NC_019427	TTAAAC	2	12	163048	163059	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075445
69	NC_019427	CAGTTA	2	12	163968	163979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075446
70	NC_019427	TTGTTT	2	12	168773	168784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	414075449
71	NC_019427	TAAATG	2	12	172539	172550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075453
72	NC_019427	AATCCT	2	12	172892	172903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075454
73	NC_019427	GATTTG	2	12	173181	173192	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075454
74	NC_019427	AAAATA	2	12	177276	177287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414075457
75	NC_019427	TAGTAT	2	12	181439	181450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075461
76	NC_019427	GCTGTT	2	12	196990	197001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414075474
77	NC_019427	CTGTAC	2	12	199072	199083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075476
78	NC_019427	GGGTTT	2	12	200333	200344	0 %	50 %	50 %	0 %	414075478
79	NC_019427	TTCTTG	2	12	205874	205885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075485
80	NC_019427	TGTAAA	2	12	207741	207752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075489
81	NC_019427	TAGCAG	2	12	208033	208044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075490
82	NC_019427	CTTTGA	2	12	209501	209512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075491
83	NC_019427	CTATTC	2	12	211896	211907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075494
84	NC_019427	ATGCTT	2	12	215891	215902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075497
85	NC_019427	GGTTTA	2	12	217692	217703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075498
86	NC_019427	AAACCA	2	12	224311	224322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075506
87	NC_019427	GTAGCT	2	12	224455	224466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075506
88	NC_019427	TGATTC	2	12	224938	224949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075507
89	NC_019427	TTCTAA	2	12	233790	233801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075514
90	NC_019427	ATCGCC	2	12	234147	234158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075514
91	NC_019427	ATTCAT	2	12	239581	239592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414075518
92	NC_019427	TCTTCC	2	12	240570	240581	0 %	50 %	0 %	50 %	414075519
93	NC_019427	CCATCA	2	12	243039	243050	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414075523
94	NC_019427	GGTGAC	2	12	250275	250286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075528
95	NC_019427	GTCAAG	2	12	253395	253406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075530
96	NC_019427	CCCAAG	2	12	260408	260419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414075534
97	NC_019427	AAATTT	2	12	261659	261670	50 %	50 %	0 %	0 %	414075535
98	NC_019427	TTTAGG	2	12	266529	266540	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075537
99	NC_019427	CAAGAT	2	12	269878	269889	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075540
100	NC_019427	TTTGGG	2	12	276032	276043	0 %	50 %	50 %	0 %	414075545
101	NC_019427	GATGCT	2	12	276740	276751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075545
102	NC_019427	AGACCT	2	12	277400	277411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075546
103	NC_019427	ATTTCT	2	12	285880	285891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075558
104	NC_019427	CTTCAG	2	12	286265	286276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075559
105	NC_019427	AGCATC	2	12	286454	286465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075560
106	NC_019427	TCTCTA	2	12	286641	286652	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414075560
107	NC_019427	AGGTAG	2	12	289805	289816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414075563
108	NC_019427	TTAGAT	2	12	292794	292805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075568
109	NC_019427	AGCTTC	2	12	306465	306476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414075581
110	NC_019427	CTTCTG	2	12	306569	306580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414075581
111	NC_019427	ATTGAT	2	12	307742	307753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075581
112	NC_019427	CCCAAC	2	12	308134	308145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075582
113	NC_019427	TGTTGG	2	12	309609	309620	0 %	50 %	50 %	0 %	414075583
114	NC_019427	AAGTTA	2	12	312471	312482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075585
115	NC_019427	TGGACG	2	12	313151	313162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414075586
116	NC_019427	ATTAAA	2	12	313217	313228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075586
117	NC_019427	GCTTTT	2	12	314259	314270	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075587
118	NC_019427	TTTGCT	2	12	320969	320980	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075592
119	NC_019427	CCCAAC	2	12	324081	324092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075594
120	NC_019427	AATGGA	2	12	329856	329867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414075601
121	NC_019427	ACCTGA	2	12	331659	331670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075604
122	NC_019427	ATCAGA	2	12	334920	334931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075607
123	NC_019427	ATGATA	2	12	335342	335353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414075607
124	NC_019427	ACTTTG	2	12	339747	339758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075613
125	NC_019427	TTAAAT	2	12	341642	341653	50 %	50 %	0 %	0 %	414075613
126	NC_019427	CTAAAT	2	12	341873	341884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075613
127	NC_019427	CTTAGT	2	12	343146	343157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075614
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137	NC_019427	TTGAGC	2	12	368541	368552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075639
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141	NC_019427	GTCACC	2	12	388517	388528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075662
142	NC_019427	GTGGCT	2	12	393395	393406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414075665
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144	NC_019427	ATAGTC	2	12	395827	395838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414075667
145	NC_019427	CTGAAG	2	12	397488	397499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075669
146	NC_019427	AGCTAC	2	12	398248	398259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075669
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149	NC_019427	TTATGC	2	12	404673	404684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075674
150	NC_019427	AATTGG	2	12	404697	404708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075674
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222	NC_019427	GCTGTA	2	12	561288	561299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075819
223	NC_019427	ATTCTG	2	12	563669	563680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075821
224	NC_019427	TTTAGC	2	12	563877	563888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075821
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227	NC_019427	TCAAGA	2	12	573888	573899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075831
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229	NC_019427	TACCAA	2	12	579029	579040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414075839
230	NC_019427	ATGGTT	2	12	580275	580286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075841
231	NC_019427	GATTAT	2	12	580304	580315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414075841
232	NC_019427	ATCTTT	2	12	580743	580754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414075841
233	NC_019427	ATTAAA	2	12	583572	583583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075844
234	NC_019427	ATGGCA	2	12	585317	585328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075847
235	NC_019427	AAATCT	2	12	588970	588981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414075850
236	NC_019427	AGCGAT	2	12	589749	589760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075850
237	NC_019427	TTCTGT	2	12	592521	592532	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075855
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240	NC_019427	TGCCAA	2	12	602248	602259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075862
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259	NC_019427	TAATGG	2	12	651090	651101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075902
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333	NC_019427	GGTATC	2	12	810004	810015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414076041
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342	NC_019427	CTCGCT	2	12	819511	819522	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	414076052
343	NC_019427	TTGCTG	2	12	823531	823542	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414076056
344	NC_019427	ATTTTT	2	12	824012	824023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414076057
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455	NC_019427	TTCTGT	2	12	1080006	1080017	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414076270
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457	NC_019427	TATAGT	2	12	1081476	1081487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414076270
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