MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 1739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	ATTTTT	2	12	16	27	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019425	TTTGAA	2	12	5371	5382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082107
3	NC_019425	CCGATG	2	12	6320	6331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414082107
4	NC_019425	GATGGA	2	12	7227	7238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414082108
5	NC_019425	GAAATT	2	12	7629	7640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414082108
6	NC_019425	AGAAAC	2	12	9335	9346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414082108
7	NC_019425	ACGATT	2	12	12384	12395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414082112
8	NC_019425	AGGTAA	2	12	13112	13123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414082113
9	NC_019425	CATATA	2	12	14560	14571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605264
10	NC_019425	AAGAAA	2	12	15065	15076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414082116
11	NC_019425	CTATTA	2	12	15214	15225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019425	AAAAAT	2	12	16408	16419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414082119
13	NC_019425	CAATTC	2	12	20461	20472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082122
14	NC_019425	TGAATG	2	12	26500	26511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082126
15	NC_019425	AAAGTA	2	12	26604	26615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414082126
16	NC_019425	TTAAAA	2	12	31567	31578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082127
17	NC_019425	ATTTTT	2	12	36108	36119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414082132
18	NC_019425	TAGGTT	2	12	38325	38336	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414082133
19	NC_019425	AAAAGC	2	12	39220	39231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414082134
20	NC_019425	TTTAGG	2	12	39430	39441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414082134
21	NC_019425	AGAGGA	2	12	44778	44789	50 %	0 %	50 %	0 %	508605271
22	NC_019425	CGGTTG	2	12	51128	51139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	508605278
23	NC_019425	AAGTGC	2	12	53824	53835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605280
24	NC_019425	TTATTT	2	12	56045	56056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605282
25	NC_019425	ATTTAA	2	12	56809	56820	50 %	50 %	0 %	0 %	508605282
26	NC_019425	TTTAGC	2	12	62551	62562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508605289
27	NC_019425	TTTTCA	2	12	63951	63962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	508605290
28	NC_019425	TTTTTA	2	12	66669	66680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605295
29	NC_019425	TGCCGA	2	12	67198	67209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	508605296
30	NC_019425	ATCCAT	2	12	69160	69171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605298
31	NC_019425	TGAATT	2	12	71874	71885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605300
32	NC_019425	GATTGT	2	12	72147	72158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605301
33	NC_019425	TGATTC	2	12	76119	76130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508605303
34	NC_019425	AAATGC	2	12	76815	76826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605304
35	NC_019425	GATGGC	2	12	78480	78491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605305
36	NC_019425	ATGGAC	2	12	83230	83241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605310
37	NC_019425	GAAAAA	2	12	83955	83966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	508605310
38	NC_019425	GCTGGA	2	12	84235	84246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605311
39	NC_019425	TGAAAA	2	12	88383	88394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605316
40	NC_019425	AAATGA	2	12	88542	88553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605316
41	NC_019425	AGAAAG	2	12	89406	89417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019425	CACAAA	2	12	91721	91732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605321
43	NC_019425	AATATA	2	12	104590	104601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082201
44	NC_019425	TTGAGA	2	12	106509	106520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605333
45	NC_019425	TTGAAA	2	12	108384	108395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605334
46	NC_019425	AAGTTA	2	12	109920	109931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605334
47	NC_019425	AAATAT	2	12	111768	111779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605336
48	NC_019425	GATTTA	2	12	113054	113065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605336
49	NC_019425	ATTTTT	2	12	113498	113509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605337
50	NC_019425	ATATTG	2	12	113859	113870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605337
51	NC_019425	TAAGTT	2	12	115119	115130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605338
52	NC_019425	AAATAC	2	12	116323	116334	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019425	TAAAAA	2	12	116957	116968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605340
54	NC_019425	AATTTC	2	12	119312	119323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605342
55	NC_019425	TTAGAA	2	12	121601	121612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605345
56	NC_019425	AAAATA	2	12	122059	122070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605345
57	NC_019425	GAATAT	2	12	122836	122847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605345
58	NC_019425	AAATGA	2	12	124584	124595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605349
59	NC_019425	ACAAGA	2	12	126207	126218	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	508605351
60	NC_019425	TTTGGA	2	12	127219	127230	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605352
61	NC_019425	AATTAA	2	12	128481	128492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605353
62	NC_019425	ATTTTG	2	12	130843	130854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605354
63	NC_019425	ACAGTA	2	12	133797	133808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605355
64	NC_019425	TGAATT	2	12	137875	137886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605356
65	NC_019425	GGCTAA	2	12	141859	141870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019425	AATTTC	2	12	145096	145107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605363
67	NC_019425	GTTGGA	2	12	153552	153563	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	508605369
68	NC_019425	GTGTTA	2	12	157495	157506	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019425	TTCAAA	2	12	157536	157547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605373
70	NC_019425	TAAAAA	2	12	160414	160425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605375
71	NC_019425	ATTTTT	2	12	160847	160858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605375
72	NC_019425	CGTGTT	2	12	162793	162804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	508605378
73	NC_019425	AGGAAT	2	12	164317	164328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508605379
74	NC_019425	AAGATA	2	12	164826	164837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605379
75	NC_019425	TACGAA	2	12	167557	167568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605379
76	NC_019425	CACGAA	2	12	168097	168108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	508605379
77	NC_019425	AATAAA	2	12	170286	170297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605382
78	NC_019425	CTTGGT	2	12	171672	171683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	508605383
79	NC_019425	TGAATT	2	12	172096	172107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605383
80	NC_019425	AATATA	2	12	173343	173354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605385
81	NC_019425	TCTAAC	2	12	182082	182093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605395
82	NC_019425	CGATTA	2	12	184513	184524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605397
83	NC_019425	ATTTGT	2	12	187583	187594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605402
84	NC_019425	TTCTTT	2	12	191815	191826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	508605406
85	NC_019425	AAATTA	2	12	192562	192573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019425	GACTAT	2	12	196152	196163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605411
87	NC_019425	TTTATT	2	12	198705	198716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605414
88	NC_019425	GTAACA	2	12	202729	202740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605415
89	NC_019425	GAAGTT	2	12	203047	203058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605415
90	NC_019425	TTGAAA	2	12	203291	203302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605415
91	NC_019425	TAAGGA	2	12	203370	203381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508605415
92	NC_019425	AATTGA	2	12	208232	208243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605419
93	NC_019425	TGAAAT	2	12	209562	209573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605420
94	NC_019425	TTGAGC	2	12	211078	211089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	508605422
95	NC_019425	TGGAAC	2	12	213758	213769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605422
96	NC_019425	ACAATG	2	12	225970	225981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605433
97	NC_019425	AAGAAA	2	12	229199	229210	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019425	TAACTA	2	12	233105	233116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605437
99	NC_019425	AATAAA	2	12	236461	236472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605438
100	NC_019425	AAAATA	2	12	240836	240847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605440
101	NC_019425	ACTGGA	2	12	245447	245458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605444
102	NC_019425	GTGAAC	2	12	246323	246334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605446
103	NC_019425	AGTTGA	2	12	253723	253734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605450
104	NC_019425	AGGTGA	2	12	255725	255736	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	508605453
105	NC_019425	CAATTT	2	12	255970	255981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605453
106	NC_019425	AGCACT	2	12	256244	256255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605454
107	NC_019425	AATCCA	2	12	257032	257043	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	508605455
108	NC_019425	CAAATT	2	12	258601	258612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605456
109	NC_019425	AGTATC	2	12	261164	261175	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605459
110	NC_019425	TAGGCG	2	12	265196	265207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605461
111	NC_019425	TGGAAG	2	12	266653	266664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019425	AGATCA	2	12	276781	276792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605468
113	NC_019425	AAATTA	2	12	276902	276913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605469
114	NC_019425	AAATTG	2	12	276936	276947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605469
115	NC_019425	GACAAT	2	12	277431	277442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414082349
116	NC_019425	ACATTT	2	12	280789	280800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605471
117	NC_019425	CAAACA	2	12	281176	281187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019425	GATTAG	2	12	281547	281558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605472
119	NC_019425	CGATGG	2	12	283219	283230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414082353
120	NC_019425	ATTGTA	2	12	283522	283533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082354
121	NC_019425	TTAAAG	2	12	287746	287757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605475
122	NC_019425	CTGTTT	2	12	288337	288348	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	508605475
123	NC_019425	TTTTTA	2	12	292814	292825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019425	CCAGGA	2	12	293643	293654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508605480
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127	NC_019425	TGAAGT	2	12	298427	298438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605483
128	NC_019425	TTAAAT	2	12	299206	299217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019425	TAATTT	2	12	300059	300070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019425	GCTGAA	2	12	302968	302979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605486
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133	NC_019425	GAAAAA	2	12	305628	305639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	508605489
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139	NC_019425	TCATCG	2	12	315207	315218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	508605498
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148	NC_019425	ATTTTT	2	12	328139	328150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019425	TAAAAG	2	12	332914	332925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414082402
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156	NC_019425	TGATAT	2	12	340310	340321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605514
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166	NC_019425	TGGAAC	2	12	359067	359078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605525
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169	NC_019425	ATGCAA	2	12	367580	367591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605533
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179	NC_019425	TTTTAC	2	12	382843	382854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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188	NC_019425	TTGCAA	2	12	414414	414425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605568
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192	NC_019425	ATTTGA	2	12	423948	423959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605578
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217	NC_019425	CTGTAA	2	12	469159	469170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605609
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220	NC_019425	GATCCA	2	12	471120	471131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605610
221	NC_019425	ATCCAG	2	12	471217	471228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605610
222	NC_019425	TTTAAT	2	12	472340	472351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082532
223	NC_019425	AGCTGA	2	12	475217	475228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414082537
224	NC_019425	AATTTT	2	12	479610	479621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605619
225	NC_019425	GGTGCT	2	12	481144	481155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	508605620
226	NC_019425	GTTGAA	2	12	487820	487831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605624
227	NC_019425	TCAAAA	2	12	492352	492363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	508605630
228	NC_019425	TTTGAT	2	12	494646	494657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
229	NC_019425	TAAAAT	2	12	494661	494672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_019425	AAAGAT	2	12	495259	495270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605632
231	NC_019425	GCTAGA	2	12	496303	496314	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605632
232	NC_019425	TGCTTT	2	12	504637	504648	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	508605638
233	NC_019425	TTTTGT	2	12	504988	504999	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	508605638
234	NC_019425	TATCAA	2	12	507393	507404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605640
235	NC_019425	GATTTA	2	12	508118	508129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082571
236	NC_019425	TGGAAT	2	12	512392	512403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605642
237	NC_019425	ACGTGA	2	12	520066	520077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605647
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239	NC_019425	AAGCTG	2	12	523502	523513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605650
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244	NC_019425	TAGCGA	2	12	531621	531632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605654
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247	NC_019425	TTTAAA	2	12	533889	533900	50 %	50 %	0 %	0 %	508605658
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302	NC_019425	TATTAA	2	12	666379	666390	50 %	50 %	0 %	0 %	414082710
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324	NC_019425	GTGCTA	2	12	710759	710770	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414082751
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333	NC_019425	AATGAT	2	12	734771	734782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
334	NC_019425	AATACA	2	12	736197	736208	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414082778
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339	NC_019425	TTGAAA	2	12	741741	741752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414082784
340	NC_019425	AAAATG	2	12	742847	742858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605763
341	NC_019425	GGGTTA	2	12	743627	743638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	508605763
342	NC_019425	TTTGAG	2	12	744533	744544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605764
343	NC_019425	ATTTAA	2	12	745957	745968	50 %	50 %	0 %	0 %	414082787
344	NC_019425	ATAGTA	2	12	747323	747334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605766
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348	NC_019425	GCTGAA	2	12	749684	749695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605768
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351	NC_019425	GTGGTA	2	12	752254	752265	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	508605771
352	NC_019425	TGAATT	2	12	755624	755635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605773
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371	NC_019425	CACTAG	2	12	800868	800879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605804
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458	NC_019425	TAAACC	2	12	985025	985036	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_019425	AATAAA	2	12	987343	987354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_019425	TAAAGC	2	12	988938	988949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605976
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467	NC_019425	TTTAGT	2	12	1005717	1005728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605997
468	NC_019425	TTAAAA	2	12	1006521	1006532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_019425	TGATTG	2	12	1009005	1009016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508606000
470	NC_019425	CTATTT	2	12	1010355	1010366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	508606002
471	NC_019425	GATGAG	2	12	1010723	1010734	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	508606002
472	NC_019425	AATAGG	2	12	1012559	1012570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_019425	ATAACA	2	12	1063902	1063913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	508606050
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