MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	ATTTTT	2	12	16	27	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019425	CTATTA	2	12	15214	15225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019425	AGAAAG	2	12	89406	89417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019425	AAATAC	2	12	116323	116334	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019425	GGCTAA	2	12	141859	141870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019425	GTGTTA	2	12	157495	157506	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019425	AAATTA	2	12	192562	192573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019425	AAGAAA	2	12	229199	229210	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019425	TGGAAG	2	12	266653	266664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019425	CAAACA	2	12	281176	281187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019425	TTTTTA	2	12	292814	292825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019425	TTAAAT	2	12	299206	299217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019425	TAATTT	2	12	300059	300070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019425	GATAGT	2	12	305507	305518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019425	AAAAAT	2	12	318858	318869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019425	TTTAAG	2	12	327615	327626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019425	ATTTTT	2	12	328139	328150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019425	TTAAAA	2	12	340009	340020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019425	TTAATT	2	12	357993	358004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019425	GTAAAA	2	12	362579	362590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019425	TTTTAC	2	12	382843	382854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019425	TTAAGT	2	12	404654	404665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019425	GAATAG	2	12	421061	421072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019425	TTTGAT	2	12	494646	494657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019425	TAAAAT	2	12	494661	494672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019425	TGGAAG	2	12	531293	531304	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019425	AAAGAA	2	12	533324	533335	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019425	AAAACA	2	12	533571	533582	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019425	AAATAA	2	12	578917	578928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019425	TCTATT	2	12	598348	598359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019425	TATTTC	2	12	614232	614243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019425	TTAATT	2	12	642445	642456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019425	TAAAAA	2	12	644109	644120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019425	AAAAAT	2	12	645076	645087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019425	TGGAAG	2	12	650169	650180	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019425	TTTAAT	2	12	660805	660816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019425	AAAAAG	2	12	682946	682957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019425	TAAATA	2	12	699934	699945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019425	TAAATA	2	12	705633	705644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019425	TGAAAA	2	12	717032	717043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019425	AATGAT	2	12	734771	734782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019425	TATTTT	2	12	798146	798157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019425	TAGTTA	2	12	845917	845928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019425	TCTTTT	2	12	857872	857883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019425	TATAGA	2	12	861537	861548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019425	TTAAAT	2	12	900871	900882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019425	TTTATA	2	12	900883	900894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019425	TCTATT	2	12	942223	942234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019425	TTATAC	2	12	981574	981585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019425	TAAACC	2	12	985025	985036	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019425	AATAAA	2	12	987343	987354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019425	TTAAAA	2	12	1006521	1006532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019425	AATAGG	2	12	1012559	1012570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019425	AATAAA	2	12	1018840	1018851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019425	ATGGAA	2	12	1062431	1062442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019425	ATAGTA	2	12	1073347	1073358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019425	TGGAAG	2	12	1087306	1087317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019425	TTATTT	2	12	1114702	1114713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019425	GTAAAA	2	12	1118585	1118596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019425	TTTTTA	2	12	1147289	1147300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019425	TTTAAA	2	12	1162584	1162595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019425	AATAAA	2	12	1178720	1178731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019425	TGAATA	2	12	1204029	1204040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019425	GTAAAA	2	12	1204949	1204960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019425	ATAGAA	2	12	1226166	1226177	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019425	TAAAAT	2	12	1246957	1246968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019425	TGCCAT	2	12	1259258	1259269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019425	TATAAT	2	12	1271678	1271689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019425	TAAAAA	2	12	1286597	1286608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019425	AAATAT	2	12	1293629	1293640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019425	TAGAAA	2	12	1304722	1304733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019425	ATTTAT	2	12	1315836	1315847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019425	TTCATT	2	12	1333149	1333160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019425	AGTCTA	2	12	1341347	1341358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019425	GGTTTC	2	12	1351444	1351455	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019425	TCTTTT	2	12	1355596	1355607	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019425	AGTAAA	2	12	1398082	1398093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019425	AACAAA	2	12	1406343	1406354	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019425	AAATTA	2	12	1432829	1432840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019425	AAAAAG	2	12	1441840	1441851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019425	AAATAA	2	12	1443290	1443301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019425	TATTGA	2	12	1452969	1452980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019425	TTTTGT	2	12	1477219	1477230	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019425	AATAAA	2	12	1479737	1479748	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019425	TAAAAT	2	12	1488364	1488375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019425	TAAAAA	2	12	1540616	1540627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019425	TTTTAT	2	12	1648812	1648823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019425	TAATTA	2	12	1659201	1659212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019425	AAATTC	2	12	1659659	1659670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019425	TTTTAC	2	12	1662463	1662474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019425	AAAATT	2	12	1671905	1671916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019425	TTATTT	2	12	1696439	1696450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019425	TTATGT	2	12	1710823	1710834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019425	CTTTTT	2	12	1735579	1735590	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019425	TTTTTA	2	12	1752279	1752290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019425	ATTTTT	2	12	1799846	1799857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019425	ATTTTT	2	12	1805675	1805686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019425	TAAACT	2	12	1827122	1827133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019425	TAAAAA	2	12	1839245	1839256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019425	AAATTT	2	12	1839759	1839770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019425	CCACTC	2	12	1862554	1862565	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019425	TAAAAA	2	12	1863713	1863724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019425	TAAAAA	2	12	1867548	1867559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019425	ATTTTT	2	12	1924127	1924138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019425	TTATTT	2	12	1965098	1965109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019425	GCTTCT	2	12	1969533	1969544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019425	ATTTTT	2	12	1971584	1971595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019425	TTTTTA	2	12	1975244	1975255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019425	TATTTG	2	12	1977896	1977907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019425	TTTTTA	2	12	1977994	1978005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019425	AGAAGC	2	12	1980476	1980487	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019425	ATGATA	2	12	1982042	1982053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019425	ATAAAA	2	12	2020044	2020055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019425	ATTCTA	2	12	2026458	2026469	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019425	TATTTC	2	12	2026956	2026967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019425	AATTGC	2	12	2031410	2031421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019425	TTTTTA	2	12	2031533	2031544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019425	AAAATC	2	12	2046342	2046353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019425	TCCTTT	2	12	2055748	2055759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019425	TCATTT	2	12	2066519	2066530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019425	AATAAA	2	12	2077130	2077141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019425	ATAAAA	2	12	2086254	2086265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019425	GTATTA	2	12	2089387	2089398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019425	TTTTAT	2	12	2095160	2095171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019425	TTTTAA	2	12	2108305	2108316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019425	TAATTT	2	12	2118688	2118699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019425	TTAATT	2	12	2146592	2146603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019425	TCTTTT	2	12	2146703	2146714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019425	TTTATA	2	12	2178443	2178454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_019425	TTATTT	2	12	2347053	2347064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.