MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 1539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	TTTGAA	2	12	5371	5382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082107
2	NC_019425	CCGATG	2	12	6320	6331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414082107
3	NC_019425	GATGGA	2	12	7227	7238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414082108
4	NC_019425	GAAATT	2	12	7629	7640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414082108
5	NC_019425	AGAAAC	2	12	9335	9346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414082108
6	NC_019425	ACGATT	2	12	12384	12395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414082112
7	NC_019425	AGGTAA	2	12	13112	13123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414082113
8	NC_019425	CATATA	2	12	14560	14571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605264
9	NC_019425	AAGAAA	2	12	15065	15076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414082116
10	NC_019425	AAAAAT	2	12	16408	16419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414082119
11	NC_019425	CAATTC	2	12	20461	20472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082122
12	NC_019425	TGAATG	2	12	26500	26511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082126
13	NC_019425	AAAGTA	2	12	26604	26615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414082126
14	NC_019425	TTAAAA	2	12	31567	31578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082127
15	NC_019425	ATTTTT	2	12	36108	36119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414082132
16	NC_019425	TAGGTT	2	12	38325	38336	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414082133
17	NC_019425	AAAAGC	2	12	39220	39231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414082134
18	NC_019425	TTTAGG	2	12	39430	39441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414082134
19	NC_019425	AGAGGA	2	12	44778	44789	50 %	0 %	50 %	0 %	508605271
20	NC_019425	CGGTTG	2	12	51128	51139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	508605278
21	NC_019425	AAGTGC	2	12	53824	53835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605280
22	NC_019425	TTATTT	2	12	56045	56056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605282
23	NC_019425	ATTTAA	2	12	56809	56820	50 %	50 %	0 %	0 %	508605282
24	NC_019425	TTTAGC	2	12	62551	62562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508605289
25	NC_019425	TTTTCA	2	12	63951	63962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	508605290
26	NC_019425	TTTTTA	2	12	66669	66680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605295
27	NC_019425	TGCCGA	2	12	67198	67209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	508605296
28	NC_019425	ATCCAT	2	12	69160	69171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605298
29	NC_019425	TGAATT	2	12	71874	71885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605300
30	NC_019425	GATTGT	2	12	72147	72158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605301
31	NC_019425	TGATTC	2	12	76119	76130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508605303
32	NC_019425	AAATGC	2	12	76815	76826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605304
33	NC_019425	GATGGC	2	12	78480	78491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605305
34	NC_019425	ATGGAC	2	12	83230	83241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605310
35	NC_019425	GAAAAA	2	12	83955	83966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	508605310
36	NC_019425	GCTGGA	2	12	84235	84246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605311
37	NC_019425	TGAAAA	2	12	88383	88394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605316
38	NC_019425	AAATGA	2	12	88542	88553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605316
39	NC_019425	CACAAA	2	12	91721	91732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605321
40	NC_019425	AATATA	2	12	104590	104601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082201
41	NC_019425	TTGAGA	2	12	106509	106520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605333
42	NC_019425	TTGAAA	2	12	108384	108395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605334
43	NC_019425	AAGTTA	2	12	109920	109931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605334
44	NC_019425	AAATAT	2	12	111768	111779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605336
45	NC_019425	GATTTA	2	12	113054	113065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605336
46	NC_019425	ATTTTT	2	12	113498	113509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605337
47	NC_019425	ATATTG	2	12	113859	113870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605337
48	NC_019425	TAAGTT	2	12	115119	115130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605338
49	NC_019425	TAAAAA	2	12	116957	116968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605340
50	NC_019425	AATTTC	2	12	119312	119323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605342
51	NC_019425	TTAGAA	2	12	121601	121612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605345
52	NC_019425	AAAATA	2	12	122059	122070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605345
53	NC_019425	GAATAT	2	12	122836	122847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605345
54	NC_019425	AAATGA	2	12	124584	124595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605349
55	NC_019425	ACAAGA	2	12	126207	126218	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	508605351
56	NC_019425	TTTGGA	2	12	127219	127230	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605352
57	NC_019425	AATTAA	2	12	128481	128492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605353
58	NC_019425	ATTTTG	2	12	130843	130854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605354
59	NC_019425	ACAGTA	2	12	133797	133808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605355
60	NC_019425	TGAATT	2	12	137875	137886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605356
61	NC_019425	AATTTC	2	12	145096	145107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605363
62	NC_019425	GTTGGA	2	12	153552	153563	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	508605369
63	NC_019425	TTCAAA	2	12	157536	157547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605373
64	NC_019425	TAAAAA	2	12	160414	160425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605375
65	NC_019425	ATTTTT	2	12	160847	160858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605375
66	NC_019425	CGTGTT	2	12	162793	162804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	508605378
67	NC_019425	AGGAAT	2	12	164317	164328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508605379
68	NC_019425	AAGATA	2	12	164826	164837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605379
69	NC_019425	TACGAA	2	12	167557	167568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605379
70	NC_019425	CACGAA	2	12	168097	168108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	508605379
71	NC_019425	AATAAA	2	12	170286	170297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605382
72	NC_019425	CTTGGT	2	12	171672	171683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	508605383
73	NC_019425	TGAATT	2	12	172096	172107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605383
74	NC_019425	AATATA	2	12	173343	173354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605385
75	NC_019425	TCTAAC	2	12	182082	182093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605395
76	NC_019425	CGATTA	2	12	184513	184524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605397
77	NC_019425	ATTTGT	2	12	187583	187594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605402
78	NC_019425	TTCTTT	2	12	191815	191826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	508605406
79	NC_019425	GACTAT	2	12	196152	196163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605411
80	NC_019425	TTTATT	2	12	198705	198716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508605414
81	NC_019425	GTAACA	2	12	202729	202740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605415
82	NC_019425	GAAGTT	2	12	203047	203058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605415
83	NC_019425	TTGAAA	2	12	203291	203302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605415
84	NC_019425	TAAGGA	2	12	203370	203381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508605415
85	NC_019425	AATTGA	2	12	208232	208243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605419
86	NC_019425	TGAAAT	2	12	209562	209573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605420
87	NC_019425	TTGAGC	2	12	211078	211089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	508605422
88	NC_019425	TGGAAC	2	12	213758	213769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605422
89	NC_019425	ACAATG	2	12	225970	225981	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605433
90	NC_019425	TAACTA	2	12	233105	233116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605437
91	NC_019425	AATAAA	2	12	236461	236472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605438
92	NC_019425	AAAATA	2	12	240836	240847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605440
93	NC_019425	ACTGGA	2	12	245447	245458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605444
94	NC_019425	GTGAAC	2	12	246323	246334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605446
95	NC_019425	AGTTGA	2	12	253723	253734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605450
96	NC_019425	AGGTGA	2	12	255725	255736	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	508605453
97	NC_019425	CAATTT	2	12	255970	255981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605453
98	NC_019425	AGCACT	2	12	256244	256255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605454
99	NC_019425	AATCCA	2	12	257032	257043	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	508605455
100	NC_019425	CAAATT	2	12	258601	258612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	508605456
101	NC_019425	AGTATC	2	12	261164	261175	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605459
102	NC_019425	TAGGCG	2	12	265196	265207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508605461
103	NC_019425	AGATCA	2	12	276781	276792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605468
104	NC_019425	AAATTA	2	12	276902	276913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605469
105	NC_019425	AAATTG	2	12	276936	276947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605469
106	NC_019425	GACAAT	2	12	277431	277442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414082349
107	NC_019425	ACATTT	2	12	280789	280800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	508605471
108	NC_019425	GATTAG	2	12	281547	281558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605472
109	NC_019425	CGATGG	2	12	283219	283230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414082353
110	NC_019425	ATTGTA	2	12	283522	283533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082354
111	NC_019425	TTAAAG	2	12	287746	287757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605475
112	NC_019425	CTGTTT	2	12	288337	288348	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	508605475
113	NC_019425	CCAGGA	2	12	293643	293654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	508605480
114	NC_019425	TGAAAC	2	12	294071	294082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	508605480
115	NC_019425	TGAAAT	2	12	296307	296318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605482
116	NC_019425	TGAAGT	2	12	298427	298438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605483
117	NC_019425	GCTGAA	2	12	302968	302979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605486
118	NC_019425	AATTTT	2	12	303831	303842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605487
119	NC_019425	GAAAAA	2	12	305628	305639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	508605489
120	NC_019425	GACGAA	2	12	307992	308003	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414082379
121	NC_019425	TTGATT	2	12	310087	310098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414082380
122	NC_019425	AAATTA	2	12	310334	310345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082380
123	NC_019425	TCATCG	2	12	315135	315146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	508605498
124	NC_019425	TCATCG	2	12	315171	315182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	508605498
125	NC_019425	TCATCG	2	12	315207	315218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	508605498
126	NC_019425	TTTCTT	2	12	316270	316281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	508605498
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132	NC_019425	TAAAAG	2	12	332914	332925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414082402
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145	NC_019425	AGTTCA	2	12	353976	353987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	508605523
146	NC_019425	TAAAGT	2	12	354822	354833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	508605523
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148	NC_019425	ATATGG	2	12	361136	361147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605527
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232	NC_019425	GATTGT	2	12	564160	564171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414082619
233	NC_019425	TCATCT	2	12	565117	565128	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	508605677
234	NC_019425	AAGGCT	2	12	567819	567830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414082622
235	NC_019425	ACTAAA	2	12	573225	573236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	508605680
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271	NC_019425	GTGGTT	2	12	677114	677125	0 %	50 %	50 %	0 %	414082719
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327	NC_019425	AGCTTT	2	12	794224	794235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	508605798
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332	NC_019425	ATGGAA	2	12	806114	806125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508605809
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334	NC_019425	TCCAGA	2	12	809305	809316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	508605812
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337	NC_019425	AGAATA	2	12	817674	817685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414082859
338	NC_019425	TAATGT	2	12	817812	817823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414082859
339	NC_019425	TTGAGA	2	12	819515	819526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082860
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342	NC_019425	AATCAA	2	12	828943	828954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	508605826
343	NC_019425	TCAACT	2	12	829553	829564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605827
344	NC_019425	TATGAT	2	12	834901	834912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605834
345	NC_019425	GGAATT	2	12	835743	835754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605835
346	NC_019425	TCCATT	2	12	837273	837284	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414082879
347	NC_019425	TAACAA	2	12	838231	838242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414082879
348	NC_019425	CAAGAA	2	12	840273	840284	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	508605837
349	NC_019425	TTGAGA	2	12	840322	840333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605837
350	NC_019425	CAGAAG	2	12	841999	842010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	508605839
351	NC_019425	AGAAGC	2	12	845437	845448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	508605842
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353	NC_019425	AAAAGG	2	12	856154	856165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605852
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360	NC_019425	TAATTT	2	12	869839	869850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605863
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362	NC_019425	TTATGA	2	12	878297	878308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	508605870
363	NC_019425	TTGATT	2	12	878390	878401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508605870
364	NC_019425	TTTGAG	2	12	879042	879053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	508605871
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369	NC_019425	GCTGAA	2	12	885773	885784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508605876
370	NC_019425	AATAAA	2	12	886609	886620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	508605877
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374	NC_019425	TAAAAG	2	12	892746	892757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605884
375	NC_019425	TAAAGA	2	12	893053	893064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	508605884
376	NC_019425	TTGAAA	2	12	895002	895013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414082940
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449	NC_019425	TATTTG	2	12	1079518	1079529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	508606066
450	NC_019425	TAGGCG	2	12	1085849	1085860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	508606070
451	NC_019425	AAAAGA	2	12	1090445	1090456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	508606073
452	NC_019425	ATCAAC	2	12	1091015	1091026	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414083142
453	NC_019425	AGTGAA	2	12	1091838	1091849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414083142
454	NC_019425	TCCATA	2	12	1094647	1094658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508606076
455	NC_019425	TAAATT	2	12	1095380	1095391	50 %	50 %	0 %	0 %	508606076
456	NC_019425	TATTTT	2	12	1096697	1096708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	508606077
457	NC_019425	AAGTGA	2	12	1100735	1100746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	508606083
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459	NC_019425	GGAACT	2	12	1101855	1101866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	508606083
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