MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 3269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	AATTT	2	10	94	103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019425	AAAAG	2	10	231	240	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019425	TAGCT	2	10	1405	1414	20 %	40 %	20 %	20 %	508605262
4	NC_019425	AATTG	2	10	2597	2606	40 %	40 %	20 %	0 %	414082104
5	NC_019425	TTCAC	2	10	3021	3030	20 %	40 %	0 %	40 %	414082104
6	NC_019425	TTATT	2	10	3409	3418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019425	TTATT	2	10	3632	3641	20 %	80 %	0 %	0 %	414082105
8	NC_019425	ATAAA	2	10	9538	9547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019425	GTTAA	2	10	9875	9884	40 %	40 %	20 %	0 %	414082109
10	NC_019425	GAATG	2	10	10585	10594	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019425	AATTT	2	10	11033	11042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019425	CTTAT	2	10	11306	11315	20 %	60 %	0 %	20 %	414082112
13	NC_019425	ACTTA	2	10	15519	15528	40 %	40 %	0 %	20 %	508605265
14	NC_019425	AAAAG	2	10	15837	15846	80 %	0 %	20 %	0 %	508605265
15	NC_019425	TAAAA	2	10	16837	16846	80 %	20 %	0 %	0 %	414082119
16	NC_019425	TAAAC	2	10	17219	17228	60 %	20 %	0 %	20 %	414082119
17	NC_019425	AAATA	2	10	17251	17260	80 %	20 %	0 %	0 %	414082119
18	NC_019425	TTTGT	2	10	19047	19056	0 %	80 %	20 %	0 %	414082121
19	NC_019425	AAAAT	2	10	19367	19376	80 %	20 %	0 %	0 %	414082121
20	NC_019425	TATTT	2	10	19450	19459	20 %	80 %	0 %	0 %	414082121
21	NC_019425	TGTAA	2	10	20925	20934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019425	TTAGC	2	10	22720	22729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019425	ATAAA	2	10	22733	22742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019425	TAAAA	2	10	25521	25530	80 %	20 %	0 %	0 %	414082126
25	NC_019425	CAAGG	2	10	29511	29520	40 %	0 %	40 %	20 %	414082127
26	NC_019425	ATTTA	2	10	31753	31762	40 %	60 %	0 %	0 %	414082127
27	NC_019425	CATAT	2	10	34340	34349	40 %	40 %	0 %	20 %	414082130
28	NC_019425	TTTCC	2	10	43946	43955	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019425	AAAAG	2	10	44176	44185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019425	ATTAT	2	10	44308	44317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019425	ATTAG	2	10	44434	44443	40 %	40 %	20 %	0 %	508605271
32	NC_019425	ATGAA	2	10	44696	44705	60 %	20 %	20 %	0 %	508605271
33	NC_019425	ATTGT	2	10	44905	44914	20 %	60 %	20 %	0 %	508605271
34	NC_019425	TATAT	2	10	45107	45116	40 %	60 %	0 %	0 %	508605271
35	NC_019425	CATAG	2	10	45613	45622	40 %	20 %	20 %	20 %	508605272
36	NC_019425	AACCA	2	10	45946	45955	60 %	0 %	0 %	40 %	508605272
37	NC_019425	TTGCA	2	10	46225	46234	20 %	40 %	20 %	20 %	508605272
38	NC_019425	TATTT	2	10	46649	46658	20 %	80 %	0 %	0 %	508605273
39	NC_019425	TAAAA	2	10	47086	47095	80 %	20 %	0 %	0 %	508605274
40	NC_019425	AAAAG	2	10	47242	47251	80 %	0 %	20 %	0 %	508605274
41	NC_019425	ATCCC	2	10	47410	47419	20 %	20 %	0 %	60 %	508605274
42	NC_019425	AAATT	2	10	47877	47886	60 %	40 %	0 %	0 %	508605274
43	NC_019425	TGAGT	2	10	48085	48094	20 %	40 %	40 %	0 %	508605274
44	NC_019425	GGAAC	2	10	48095	48104	40 %	0 %	40 %	20 %	508605274
45	NC_019425	GGATT	2	10	49475	49484	20 %	40 %	40 %	0 %	508605276
46	NC_019425	TAAAC	2	10	52172	52181	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019425	AATAA	2	10	54181	54190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019425	GAAAA	2	10	54356	54365	80 %	0 %	20 %	0 %	508605281
49	NC_019425	TACTT	2	10	56314	56323	20 %	60 %	0 %	20 %	508605282
50	NC_019425	AAAGT	2	10	56626	56635	60 %	20 %	20 %	0 %	508605282
51	NC_019425	GAATT	2	10	56856	56865	40 %	40 %	20 %	0 %	508605282
52	NC_019425	GAAGT	2	10	57972	57981	40 %	20 %	40 %	0 %	508605283
53	NC_019425	CGGAT	2	10	59871	59880	20 %	20 %	40 %	20 %	508605284
54	NC_019425	AGATA	2	10	61849	61858	60 %	20 %	20 %	0 %	508605288
55	NC_019425	AGTTA	2	10	62629	62638	40 %	40 %	20 %	0 %	508605289
56	NC_019425	AAAGC	2	10	63752	63761	60 %	0 %	20 %	20 %	508605290
57	NC_019425	ATTCC	2	10	64214	64223	20 %	40 %	0 %	40 %	508605291
58	NC_019425	TGAAG	2	10	64374	64383	40 %	20 %	40 %	0 %	508605291
59	NC_019425	CTAAA	2	10	64589	64598	60 %	20 %	0 %	20 %	508605291
60	NC_019425	TTAAA	2	10	64901	64910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019425	TTTTA	2	10	65013	65022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019425	ATAAA	2	10	67971	67980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019425	AGAAA	2	10	69043	69052	80 %	0 %	20 %	0 %	508605298
64	NC_019425	AAAAT	2	10	70584	70593	80 %	20 %	0 %	0 %	508605299
65	NC_019425	AACTA	2	10	70972	70981	60 %	20 %	0 %	20 %	508605299
66	NC_019425	TAACT	2	10	71448	71457	40 %	40 %	0 %	20 %	508605300
67	NC_019425	AAATA	2	10	74018	74027	80 %	20 %	0 %	0 %	508605302
68	NC_019425	AGTAA	2	10	74694	74703	60 %	20 %	20 %	0 %	508605302
69	NC_019425	TGGAA	2	10	74912	74921	40 %	20 %	40 %	0 %	508605302
70	NC_019425	AATTT	2	10	77466	77475	40 %	60 %	0 %	0 %	508605305
71	NC_019425	AATTA	2	10	81752	81761	60 %	40 %	0 %	0 %	508605308
72	NC_019425	GAAAT	2	10	82340	82349	60 %	20 %	20 %	0 %	508605309
73	NC_019425	TGGAA	2	10	82841	82850	40 %	20 %	40 %	0 %	508605310
74	NC_019425	ATTGG	2	10	83151	83160	20 %	40 %	40 %	0 %	508605310
75	NC_019425	AACTG	2	10	83967	83976	40 %	20 %	20 %	20 %	508605311
76	NC_019425	GCTTG	2	10	84373	84382	0 %	40 %	40 %	20 %	508605311
77	NC_019425	ATTTG	2	10	84981	84990	20 %	60 %	20 %	0 %	508605311
78	NC_019425	AATTT	2	10	88053	88062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019425	GAAAA	2	10	89266	89275	80 %	0 %	20 %	0 %	508605318
80	NC_019425	CCTCA	2	10	89291	89300	20 %	20 %	0 %	60 %	508605318
81	NC_019425	GTATT	2	10	89497	89506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019425	ACCCA	2	10	89611	89620	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_019425	AGTAT	2	10	90049	90058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019425	CTTCT	2	10	90740	90749	0 %	60 %	0 %	40 %	508605320
85	NC_019425	GAGAA	2	10	91169	91178	60 %	0 %	40 %	0 %	508605320
86	NC_019425	TAGAA	2	10	92429	92438	60 %	20 %	20 %	0 %	508605322
87	NC_019425	AGAAC	2	10	95582	95591	60 %	0 %	20 %	20 %	508605324
88	NC_019425	GAGTG	2	10	96180	96189	20 %	20 %	60 %	0 %	508605325
89	NC_019425	AAGGG	2	10	96254	96263	40 %	0 %	60 %	0 %	508605325
90	NC_019425	TTGAA	2	10	100964	100973	40 %	40 %	20 %	0 %	508605331
91	NC_019425	CAGTT	2	10	101045	101054	20 %	40 %	20 %	20 %	508605331
92	NC_019425	GAAAA	2	10	101063	101072	80 %	0 %	20 %	0 %	508605331
93	NC_019425	TACCT	2	10	101958	101967	20 %	40 %	0 %	40 %	508605331
94	NC_019425	AAAAT	2	10	102917	102926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019425	AGAAC	2	10	103163	103172	60 %	0 %	20 %	20 %	508605332
96	NC_019425	GAAAA	2	10	103253	103262	80 %	0 %	20 %	0 %	508605332
97	NC_019425	GAAAT	2	10	105022	105031	60 %	20 %	20 %	0 %	414082201
98	NC_019425	ATTTG	2	10	105069	105078	20 %	60 %	20 %	0 %	414082201
99	NC_019425	AAGAT	2	10	105665	105674	60 %	20 %	20 %	0 %	414082201
100	NC_019425	AAAAT	2	10	107727	107736	80 %	20 %	0 %	0 %	508605333
101	NC_019425	ATCGA	2	10	108327	108336	40 %	20 %	20 %	20 %	508605334
102	NC_019425	GGGTT	2	10	110411	110420	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019425	ATATA	2	10	111638	111647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019425	AAAGA	2	10	112051	112060	80 %	0 %	20 %	0 %	508605336
105	NC_019425	CTTAC	2	10	112592	112601	20 %	40 %	0 %	40 %	508605336
106	NC_019425	TTTGG	2	10	112765	112774	0 %	60 %	40 %	0 %	508605336
107	NC_019425	TAGAA	2	10	113824	113833	60 %	20 %	20 %	0 %	508605337
108	NC_019425	TTGTA	2	10	116058	116067	20 %	60 %	20 %	0 %	508605339
109	NC_019425	TTTGA	2	10	117871	117880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019425	AAAGT	2	10	123456	123465	60 %	20 %	20 %	0 %	508605346
111	NC_019425	GAAAG	2	10	126324	126333	60 %	0 %	40 %	0 %	508605351
112	NC_019425	AATCA	2	10	126613	126622	60 %	20 %	0 %	20 %	508605351
113	NC_019425	ACTAA	2	10	127146	127155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019425	CCAAA	2	10	128193	128202	60 %	0 %	0 %	40 %	508605353
115	NC_019425	GAAAT	2	10	128699	128708	60 %	20 %	20 %	0 %	508605353
116	NC_019425	GAAAA	2	10	128950	128959	80 %	0 %	20 %	0 %	508605353
117	NC_019425	TTTAC	2	10	130050	130059	20 %	60 %	0 %	20 %	508605354
118	NC_019425	CTTAT	2	10	130649	130658	20 %	60 %	0 %	20 %	508605354
119	NC_019425	ACGTT	2	10	132138	132147	20 %	40 %	20 %	20 %	508605355
120	NC_019425	TGAAA	2	10	132785	132794	60 %	20 %	20 %	0 %	508605355
121	NC_019425	TGAAA	2	10	133004	133013	60 %	20 %	20 %	0 %	508605355
122	NC_019425	ACGTA	2	10	133187	133196	40 %	20 %	20 %	20 %	508605355
123	NC_019425	AAATT	2	10	135426	135435	60 %	40 %	0 %	0 %	508605355
124	NC_019425	TAAAA	2	10	136356	136365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019425	TTATT	3	15	137254	137268	20 %	80 %	0 %	0 %	508605356
126	NC_019425	CTTTT	2	10	137665	137674	0 %	80 %	0 %	20 %	508605356
127	NC_019425	ATTTT	2	10	137697	137706	20 %	80 %	0 %	0 %	508605356
128	NC_019425	TGAAA	2	10	138222	138231	60 %	20 %	20 %	0 %	508605357
129	NC_019425	ATAAA	2	10	140035	140044	80 %	20 %	0 %	0 %	508605358
130	NC_019425	ATTTC	2	10	140101	140110	20 %	60 %	0 %	20 %	508605358
131	NC_019425	GATAG	2	10	140366	140375	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019425	CAAAC	2	10	140664	140673	60 %	0 %	0 %	40 %	508605359
133	NC_019425	CTATG	2	10	141901	141910	20 %	40 %	20 %	20 %	508605360
134	NC_019425	TGAAA	2	10	142249	142258	60 %	20 %	20 %	0 %	508605360
135	NC_019425	GAATT	2	10	143821	143830	40 %	40 %	20 %	0 %	508605361
136	NC_019425	TCAAC	2	10	144559	144568	40 %	20 %	0 %	40 %	508605362
137	NC_019425	AAGTT	2	10	146500	146509	40 %	40 %	20 %	0 %	508605364
138	NC_019425	TTAAA	2	10	147436	147445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019425	AGTAA	2	10	149196	149205	60 %	20 %	20 %	0 %	508605367
140	NC_019425	AAAAG	2	10	152225	152234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019425	TGAAG	2	10	154181	154190	40 %	20 %	40 %	0 %	508605369
142	NC_019425	CCATC	2	10	155242	155251	20 %	20 %	0 %	60 %	508605369
143	NC_019425	GTAAC	2	10	156546	156555	40 %	20 %	20 %	20 %	508605370
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145	NC_019425	TTTTA	2	10	157190	157199	20 %	80 %	0 %	0 %	508605372
146	NC_019425	TTTAA	2	10	158426	158435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019425	AAAAT	2	10	159909	159918	80 %	20 %	0 %	0 %	508605375
148	NC_019425	CAAAA	2	10	161405	161414	80 %	0 %	0 %	20 %	508605376
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155	NC_019425	TGACC	2	10	170164	170173	20 %	20 %	20 %	40 %	508605382
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173	NC_019425	ATTGG	2	10	195693	195702	20 %	40 %	40 %	0 %	508605411
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177	NC_019425	AATGA	2	10	198629	198638	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_019425	AATTA	2	10	209464	209473	60 %	40 %	0 %	0 %	508605420
183	NC_019425	AATTT	2	10	210601	210610	40 %	60 %	0 %	0 %	508605422
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194	NC_019425	TTTTA	2	10	221034	221043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019425	TTAAT	2	10	222752	222761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_019425	AGATA	2	10	279561	279570	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_019425	CTTTT	3	15	307455	307469	0 %	80 %	0 %	20 %	508605492
262	NC_019425	AATTT	2	10	307781	307790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019425	TTTAA	2	10	307826	307835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019425	AAAAT	2	10	308716	308725	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019425	TTTAA	2	10	311630	311639	40 %	60 %	0 %	0 %	508605495
266	NC_019425	AACTA	2	10	315635	315644	60 %	20 %	0 %	20 %	508605498
267	NC_019425	CATTT	2	10	315860	315869	20 %	60 %	0 %	20 %	508605498
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269	NC_019425	TAGTT	2	10	318978	318987	20 %	60 %	20 %	0 %	414082388
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271	NC_019425	AATGT	2	10	320848	320857	40 %	40 %	20 %	0 %	508605501
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280	NC_019425	GTTAT	2	10	327592	327601	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_019425	GAATC	2	10	327739	327748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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