MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 2572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	TAGCT	2	10	1405	1414	20 %	40 %	20 %	20 %	508605262
2	NC_019425	AATTG	2	10	2597	2606	40 %	40 %	20 %	0 %	414082104
3	NC_019425	TTCAC	2	10	3021	3030	20 %	40 %	0 %	40 %	414082104
4	NC_019425	TTATT	2	10	3632	3641	20 %	80 %	0 %	0 %	414082105
5	NC_019425	GTTAA	2	10	9875	9884	40 %	40 %	20 %	0 %	414082109
6	NC_019425	CTTAT	2	10	11306	11315	20 %	60 %	0 %	20 %	414082112
7	NC_019425	ACTTA	2	10	15519	15528	40 %	40 %	0 %	20 %	508605265
8	NC_019425	AAAAG	2	10	15837	15846	80 %	0 %	20 %	0 %	508605265
9	NC_019425	TAAAA	2	10	16837	16846	80 %	20 %	0 %	0 %	414082119
10	NC_019425	TAAAC	2	10	17219	17228	60 %	20 %	0 %	20 %	414082119
11	NC_019425	AAATA	2	10	17251	17260	80 %	20 %	0 %	0 %	414082119
12	NC_019425	TTTGT	2	10	19047	19056	0 %	80 %	20 %	0 %	414082121
13	NC_019425	AAAAT	2	10	19367	19376	80 %	20 %	0 %	0 %	414082121
14	NC_019425	TATTT	2	10	19450	19459	20 %	80 %	0 %	0 %	414082121
15	NC_019425	TAAAA	2	10	25521	25530	80 %	20 %	0 %	0 %	414082126
16	NC_019425	CAAGG	2	10	29511	29520	40 %	0 %	40 %	20 %	414082127
17	NC_019425	ATTTA	2	10	31753	31762	40 %	60 %	0 %	0 %	414082127
18	NC_019425	CATAT	2	10	34340	34349	40 %	40 %	0 %	20 %	414082130
19	NC_019425	ATTAG	2	10	44434	44443	40 %	40 %	20 %	0 %	508605271
20	NC_019425	ATGAA	2	10	44696	44705	60 %	20 %	20 %	0 %	508605271
21	NC_019425	ATTGT	2	10	44905	44914	20 %	60 %	20 %	0 %	508605271
22	NC_019425	TATAT	2	10	45107	45116	40 %	60 %	0 %	0 %	508605271
23	NC_019425	CATAG	2	10	45613	45622	40 %	20 %	20 %	20 %	508605272
24	NC_019425	AACCA	2	10	45946	45955	60 %	0 %	0 %	40 %	508605272
25	NC_019425	TTGCA	2	10	46225	46234	20 %	40 %	20 %	20 %	508605272
26	NC_019425	TATTT	2	10	46649	46658	20 %	80 %	0 %	0 %	508605273
27	NC_019425	TAAAA	2	10	47086	47095	80 %	20 %	0 %	0 %	508605274
28	NC_019425	AAAAG	2	10	47242	47251	80 %	0 %	20 %	0 %	508605274
29	NC_019425	ATCCC	2	10	47410	47419	20 %	20 %	0 %	60 %	508605274
30	NC_019425	AAATT	2	10	47877	47886	60 %	40 %	0 %	0 %	508605274
31	NC_019425	TGAGT	2	10	48085	48094	20 %	40 %	40 %	0 %	508605274
32	NC_019425	GGAAC	2	10	48095	48104	40 %	0 %	40 %	20 %	508605274
33	NC_019425	GGATT	2	10	49475	49484	20 %	40 %	40 %	0 %	508605276
34	NC_019425	GAAAA	2	10	54356	54365	80 %	0 %	20 %	0 %	508605281
35	NC_019425	TACTT	2	10	56314	56323	20 %	60 %	0 %	20 %	508605282
36	NC_019425	AAAGT	2	10	56626	56635	60 %	20 %	20 %	0 %	508605282
37	NC_019425	GAATT	2	10	56856	56865	40 %	40 %	20 %	0 %	508605282
38	NC_019425	GAAGT	2	10	57972	57981	40 %	20 %	40 %	0 %	508605283
39	NC_019425	CGGAT	2	10	59871	59880	20 %	20 %	40 %	20 %	508605284
40	NC_019425	AGATA	2	10	61849	61858	60 %	20 %	20 %	0 %	508605288
41	NC_019425	AGTTA	2	10	62629	62638	40 %	40 %	20 %	0 %	508605289
42	NC_019425	AAAGC	2	10	63752	63761	60 %	0 %	20 %	20 %	508605290
43	NC_019425	ATTCC	2	10	64214	64223	20 %	40 %	0 %	40 %	508605291
44	NC_019425	TGAAG	2	10	64374	64383	40 %	20 %	40 %	0 %	508605291
45	NC_019425	CTAAA	2	10	64589	64598	60 %	20 %	0 %	20 %	508605291
46	NC_019425	AGAAA	2	10	69043	69052	80 %	0 %	20 %	0 %	508605298
47	NC_019425	AAAAT	2	10	70584	70593	80 %	20 %	0 %	0 %	508605299
48	NC_019425	AACTA	2	10	70972	70981	60 %	20 %	0 %	20 %	508605299
49	NC_019425	TAACT	2	10	71448	71457	40 %	40 %	0 %	20 %	508605300
50	NC_019425	AAATA	2	10	74018	74027	80 %	20 %	0 %	0 %	508605302
51	NC_019425	AGTAA	2	10	74694	74703	60 %	20 %	20 %	0 %	508605302
52	NC_019425	TGGAA	2	10	74912	74921	40 %	20 %	40 %	0 %	508605302
53	NC_019425	AATTT	2	10	77466	77475	40 %	60 %	0 %	0 %	508605305
54	NC_019425	AATTA	2	10	81752	81761	60 %	40 %	0 %	0 %	508605308
55	NC_019425	GAAAT	2	10	82340	82349	60 %	20 %	20 %	0 %	508605309
56	NC_019425	TGGAA	2	10	82841	82850	40 %	20 %	40 %	0 %	508605310
57	NC_019425	ATTGG	2	10	83151	83160	20 %	40 %	40 %	0 %	508605310
58	NC_019425	AACTG	2	10	83967	83976	40 %	20 %	20 %	20 %	508605311
59	NC_019425	GCTTG	2	10	84373	84382	0 %	40 %	40 %	20 %	508605311
60	NC_019425	ATTTG	2	10	84981	84990	20 %	60 %	20 %	0 %	508605311
61	NC_019425	GAAAA	2	10	89266	89275	80 %	0 %	20 %	0 %	508605318
62	NC_019425	CCTCA	2	10	89291	89300	20 %	20 %	0 %	60 %	508605318
63	NC_019425	CTTCT	2	10	90740	90749	0 %	60 %	0 %	40 %	508605320
64	NC_019425	GAGAA	2	10	91169	91178	60 %	0 %	40 %	0 %	508605320
65	NC_019425	TAGAA	2	10	92429	92438	60 %	20 %	20 %	0 %	508605322
66	NC_019425	AGAAC	2	10	95582	95591	60 %	0 %	20 %	20 %	508605324
67	NC_019425	GAGTG	2	10	96180	96189	20 %	20 %	60 %	0 %	508605325
68	NC_019425	AAGGG	2	10	96254	96263	40 %	0 %	60 %	0 %	508605325
69	NC_019425	TTGAA	2	10	100964	100973	40 %	40 %	20 %	0 %	508605331
70	NC_019425	CAGTT	2	10	101045	101054	20 %	40 %	20 %	20 %	508605331
71	NC_019425	GAAAA	2	10	101063	101072	80 %	0 %	20 %	0 %	508605331
72	NC_019425	TACCT	2	10	101958	101967	20 %	40 %	0 %	40 %	508605331
73	NC_019425	AGAAC	2	10	103163	103172	60 %	0 %	20 %	20 %	508605332
74	NC_019425	GAAAA	2	10	103253	103262	80 %	0 %	20 %	0 %	508605332
75	NC_019425	GAAAT	2	10	105022	105031	60 %	20 %	20 %	0 %	414082201
76	NC_019425	ATTTG	2	10	105069	105078	20 %	60 %	20 %	0 %	414082201
77	NC_019425	AAGAT	2	10	105665	105674	60 %	20 %	20 %	0 %	414082201
78	NC_019425	AAAAT	2	10	107727	107736	80 %	20 %	0 %	0 %	508605333
79	NC_019425	ATCGA	2	10	108327	108336	40 %	20 %	20 %	20 %	508605334
80	NC_019425	AAAGA	2	10	112051	112060	80 %	0 %	20 %	0 %	508605336
81	NC_019425	CTTAC	2	10	112592	112601	20 %	40 %	0 %	40 %	508605336
82	NC_019425	TTTGG	2	10	112765	112774	0 %	60 %	40 %	0 %	508605336
83	NC_019425	TAGAA	2	10	113824	113833	60 %	20 %	20 %	0 %	508605337
84	NC_019425	TTGTA	2	10	116058	116067	20 %	60 %	20 %	0 %	508605339
85	NC_019425	AAAGT	2	10	123456	123465	60 %	20 %	20 %	0 %	508605346
86	NC_019425	GAAAG	2	10	126324	126333	60 %	0 %	40 %	0 %	508605351
87	NC_019425	AATCA	2	10	126613	126622	60 %	20 %	0 %	20 %	508605351
88	NC_019425	CCAAA	2	10	128193	128202	60 %	0 %	0 %	40 %	508605353
89	NC_019425	GAAAT	2	10	128699	128708	60 %	20 %	20 %	0 %	508605353
90	NC_019425	GAAAA	2	10	128950	128959	80 %	0 %	20 %	0 %	508605353
91	NC_019425	TTTAC	2	10	130050	130059	20 %	60 %	0 %	20 %	508605354
92	NC_019425	CTTAT	2	10	130649	130658	20 %	60 %	0 %	20 %	508605354
93	NC_019425	ACGTT	2	10	132138	132147	20 %	40 %	20 %	20 %	508605355
94	NC_019425	TGAAA	2	10	132785	132794	60 %	20 %	20 %	0 %	508605355
95	NC_019425	TGAAA	2	10	133004	133013	60 %	20 %	20 %	0 %	508605355
96	NC_019425	ACGTA	2	10	133187	133196	40 %	20 %	20 %	20 %	508605355
97	NC_019425	AAATT	2	10	135426	135435	60 %	40 %	0 %	0 %	508605355
98	NC_019425	TTATT	3	15	137254	137268	20 %	80 %	0 %	0 %	508605356
99	NC_019425	CTTTT	2	10	137665	137674	0 %	80 %	0 %	20 %	508605356
100	NC_019425	ATTTT	2	10	137697	137706	20 %	80 %	0 %	0 %	508605356
101	NC_019425	TGAAA	2	10	138222	138231	60 %	20 %	20 %	0 %	508605357
102	NC_019425	ATAAA	2	10	140035	140044	80 %	20 %	0 %	0 %	508605358
103	NC_019425	ATTTC	2	10	140101	140110	20 %	60 %	0 %	20 %	508605358
104	NC_019425	CAAAC	2	10	140664	140673	60 %	0 %	0 %	40 %	508605359
105	NC_019425	CTATG	2	10	141901	141910	20 %	40 %	20 %	20 %	508605360
106	NC_019425	TGAAA	2	10	142249	142258	60 %	20 %	20 %	0 %	508605360
107	NC_019425	GAATT	2	10	143821	143830	40 %	40 %	20 %	0 %	508605361
108	NC_019425	TCAAC	2	10	144559	144568	40 %	20 %	0 %	40 %	508605362
109	NC_019425	AAGTT	2	10	146500	146509	40 %	40 %	20 %	0 %	508605364
110	NC_019425	AGTAA	2	10	149196	149205	60 %	20 %	20 %	0 %	508605367
111	NC_019425	TGAAG	2	10	154181	154190	40 %	20 %	40 %	0 %	508605369
112	NC_019425	CCATC	2	10	155242	155251	20 %	20 %	0 %	60 %	508605369
113	NC_019425	GTAAC	2	10	156546	156555	40 %	20 %	20 %	20 %	508605370
114	NC_019425	TTTTA	2	10	157190	157199	20 %	80 %	0 %	0 %	508605372
115	NC_019425	AAAAT	2	10	159909	159918	80 %	20 %	0 %	0 %	508605375
116	NC_019425	CAAAA	2	10	161405	161414	80 %	0 %	0 %	20 %	508605376
117	NC_019425	CGACT	2	10	161586	161595	20 %	20 %	20 %	40 %	508605376
118	NC_019425	TTGGG	2	10	165433	165442	0 %	40 %	60 %	0 %	508605379
119	NC_019425	ATGGA	2	10	167059	167068	40 %	20 %	40 %	0 %	508605379
120	NC_019425	ATCAA	2	10	167754	167763	60 %	20 %	0 %	20 %	508605379
121	NC_019425	TGACC	2	10	170164	170173	20 %	20 %	20 %	40 %	508605382
122	NC_019425	TGAAA	2	10	171458	171467	60 %	20 %	20 %	0 %	508605383
123	NC_019425	AAGAA	2	10	172402	172411	80 %	0 %	20 %	0 %	508605383
124	NC_019425	AAGGT	2	10	173908	173917	40 %	20 %	40 %	0 %	508605385
125	NC_019425	TCTTA	2	10	174636	174645	20 %	60 %	0 %	20 %	508605386
126	NC_019425	TAGTT	2	10	176148	176157	20 %	60 %	20 %	0 %	508605388
127	NC_019425	AAATT	2	10	177416	177425	60 %	40 %	0 %	0 %	508605389
128	NC_019425	ATTTG	2	10	177915	177924	20 %	60 %	20 %	0 %	508605390
129	NC_019425	AGTTA	2	10	179194	179203	40 %	40 %	20 %	0 %	508605392
130	NC_019425	GAGCA	2	10	182715	182724	40 %	0 %	40 %	20 %	508605395
131	NC_019425	TAAAC	2	10	182759	182768	60 %	20 %	0 %	20 %	508605395
132	NC_019425	ATGAC	2	10	184537	184546	40 %	20 %	20 %	20 %	508605397
133	NC_019425	ATGCA	2	10	187558	187567	40 %	20 %	20 %	20 %	508605402
134	NC_019425	AAATT	2	10	187969	187978	60 %	40 %	0 %	0 %	508605402
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