MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Carnobacterium maltaromaticum LMA28 complete genome

Total Repeats: 44902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019425	ATT	3	9	524	532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
2	NC_019425	ATT	2	6	558	563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
3	NC_019425	ATT	2	6	638	643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
4	NC_019425	TTC	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
5	NC_019425	AAT	2	6	683	688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605262
6	NC_019425	GCT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605262
7	NC_019425	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
8	NC_019425	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
9	NC_019425	GGA	2	6	851	856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	508605262
10	NC_019425	TCA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605262
11	NC_019425	CTA	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605262
12	NC_019425	AGT	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
13	NC_019425	TTA	2	6	966	971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
14	NC_019425	TAT	2	6	1029	1034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605262
15	NC_019425	TGA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
16	NC_019425	AAG	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
17	NC_019425	AAG	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
18	NC_019425	TTC	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	508605262
19	NC_019425	ATG	2	6	1110	1115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605262
20	NC_019425	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605262
21	NC_019425	CGT	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605262
22	NC_019425	AAG	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
23	NC_019425	TTG	2	6	1548	1553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508605262
24	NC_019425	GGT	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	508605262
25	NC_019425	GAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
26	NC_019425	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605262
27	NC_019425	AAG	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
28	NC_019425	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082104
29	NC_019425	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
30	NC_019425	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082104
31	NC_019425	GTA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
32	NC_019425	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082104
33	NC_019425	TGA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
34	NC_019425	ATG	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
35	NC_019425	GTC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082104
36	NC_019425	ATT	2	6	2483	2488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
37	NC_019425	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
38	NC_019425	TTA	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082104
39	NC_019425	GAT	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
40	NC_019425	ATG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
41	NC_019425	TGT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082104
42	NC_019425	GAT	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082104
43	NC_019425	TTA	2	6	3466	3471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
44	NC_019425	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
45	NC_019425	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
46	NC_019425	AGT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082105
47	NC_019425	TTA	2	6	3552	3557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082105
48	NC_019425	TCG	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082105
49	NC_019425	TGA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082105
50	NC_019425	AGA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605263
51	NC_019425	AAG	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	508605263
52	NC_019425	TCC	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	508605263
53	NC_019425	TTG	2	6	3930	3935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	508605263
54	NC_019425	TAA	2	6	3940	3945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605263
55	NC_019425	AAC	2	6	4149	4154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
56	NC_019425	ATG	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
57	NC_019425	TCA	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	508605263
58	NC_019425	TGC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605263
59	NC_019425	TGA	2	6	4477	4482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
60	NC_019425	AAT	2	6	4499	4504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	508605263
61	NC_019425	ACA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
62	NC_019425	AAC	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
63	NC_019425	TTA	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	508605263
64	NC_019425	GAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
65	NC_019425	CAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	508605263
66	NC_019425	TAG	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	508605263
67	NC_019425	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
68	NC_019425	ATG	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
69	NC_019425	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
70	NC_019425	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
71	NC_019425	GAA	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
72	NC_019425	TGA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
73	NC_019425	GTC	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
74	NC_019425	GGA	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414082107
75	NC_019425	TGG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
76	NC_019425	ATT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082107
77	NC_019425	AAC	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
78	NC_019425	ACA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
79	NC_019425	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
80	NC_019425	CAA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
81	NC_019425	TTG	3	9	5582	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
82	NC_019425	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082107
83	NC_019425	TTG	2	6	5629	5634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
84	NC_019425	AAC	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
85	NC_019425	TCA	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082107
86	NC_019425	TGA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
87	NC_019425	GAA	2	6	5752	5757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
88	NC_019425	TCG	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
89	NC_019425	GCT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
90	NC_019425	AAG	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
91	NC_019425	TCG	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
92	NC_019425	TGG	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
93	NC_019425	GAA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
94	NC_019425	TGG	2	6	6267	6272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082107
95	NC_019425	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082107
96	NC_019425	ACC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414082107
97	NC_019425	AAC	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
98	NC_019425	CAA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082107
99	NC_019425	CGT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082107
100	NC_019425	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082107
101	NC_019425	GAA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082107
102	NC_019425	GAA	2	6	6894	6899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
103	NC_019425	TTG	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
104	NC_019425	TCG	2	6	7025	7030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
105	NC_019425	TTG	2	6	7096	7101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
106	NC_019425	GCT	2	6	7242	7247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
107	NC_019425	TGC	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
108	NC_019425	CCA	2	6	7437	7442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414082108
109	NC_019425	TGA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
110	NC_019425	CAA	2	6	7498	7503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082108
111	NC_019425	TCG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
112	NC_019425	TTG	2	6	7663	7668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
113	NC_019425	TGA	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
114	NC_019425	GTT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
115	NC_019425	CTT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082108
116	NC_019425	ATT	2	6	7945	7950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
117	NC_019425	TCG	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082108
118	NC_019425	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
119	NC_019425	ATC	2	6	8064	8069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414082108
120	NC_019425	ATT	2	6	8073	8078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
121	NC_019425	CAG	2	6	8264	8269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082108
122	NC_019425	ATT	2	6	8286	8291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
123	NC_019425	AGA	2	6	8372	8377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
124	NC_019425	GAA	3	9	8391	8399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
125	NC_019425	TAA	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082108
126	NC_019425	GGT	2	6	8475	8480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
127	NC_019425	GAT	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
128	NC_019425	TTA	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
129	NC_019425	AGC	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414082108
130	NC_019425	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082108
131	NC_019425	ACA	2	6	8736	8741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082108
132	NC_019425	AGA	2	6	8822	8827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414082108
133	NC_019425	TGA	2	6	8836	8841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
134	NC_019425	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414082108
135	NC_019425	GTG	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
136	NC_019425	GTT	2	6	8985	8990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414082108
137	NC_019425	GTG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414082108
138	NC_019425	ACA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082108
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142	NC_019425	GAT	2	6	9381	9386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082108
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146	NC_019425	AAT	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082109
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150	NC_019425	GAT	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082110
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152	NC_019425	CTT	2	6	10109	10114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414082110
153	NC_019425	CTG	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414082110
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156	NC_019425	CAA	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082110
157	NC_019425	GTA	2	6	10385	10390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082110
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159	NC_019425	CAA	2	6	10423	10428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082110
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161	NC_019425	CAA	2	6	10441	10446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082110
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167	NC_019425	ATA	2	6	10678	10683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082111
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242	NC_019425	GCG	2	6	15114	15119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414082116
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247	NC_019425	TGC	2	6	15622	15627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	508605265
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252	NC_019425	ATA	2	6	16395	16400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082119
253	NC_019425	CAA	2	6	16425	16430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414082119
254	NC_019425	TAA	2	6	16501	16506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082119
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256	NC_019425	ATA	2	6	16574	16579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414082119
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259	NC_019425	AGT	2	6	16708	16713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414082119
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