MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gluconobacter oxydans H24 plasmid unnamed

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019397	GTCGC	2	10	599	608	0 %	20 %	40 %	40 %	414344522
2	NC_019397	ACCAG	2	10	2849	2858	40 %	0 %	20 %	40 %	414344524
3	NC_019397	AAGAC	2	10	4041	4050	60 %	0 %	20 %	20 %	414344525
4	NC_019397	TCCTT	2	10	4101	4110	0 %	60 %	0 %	40 %	414344525
5	NC_019397	TCCCC	2	10	4747	4756	0 %	20 %	0 %	80 %	414344526
6	NC_019397	GGCTT	2	10	6031	6040	0 %	40 %	40 %	20 %	414344530
7	NC_019397	CGCGG	2	10	8489	8498	0 %	0 %	60 %	40 %	414344532
8	NC_019397	AGACG	2	10	9661	9670	40 %	0 %	40 %	20 %	414344534
9	NC_019397	TACAA	2	10	13185	13194	60 %	20 %	0 %	20 %	414344538
10	NC_019397	GCGAC	2	10	13508	13517	20 %	0 %	40 %	40 %	414344538
11	NC_019397	ACACG	2	10	16063	16072	40 %	0 %	20 %	40 %	414344542
12	NC_019397	TGGAG	2	10	16197	16206	20 %	20 %	60 %	0 %	414344542
13	NC_019397	CGGCA	2	10	17101	17110	20 %	0 %	40 %	40 %	414344543
14	NC_019397	CCTGC	2	10	22870	22879	0 %	20 %	20 %	60 %	414344551
15	NC_019397	AGCCG	2	10	24253	24262	20 %	0 %	40 %	40 %	414344553
16	NC_019397	TGGAT	2	10	24709	24718	20 %	40 %	40 %	0 %	414344553
17	NC_019397	ACAGA	2	10	24898	24907	60 %	0 %	20 %	20 %	414344553
18	NC_019397	CACTC	2	10	26055	26064	20 %	20 %	0 %	60 %	414344557
19	NC_019397	AGGAC	2	10	29558	29567	40 %	0 %	40 %	20 %	414344561
20	NC_019397	ATTTG	2	10	29786	29795	20 %	60 %	20 %	0 %	414344561
21	NC_019397	CGAAA	2	10	32620	32629	60 %	0 %	20 %	20 %	414344565
22	NC_019397	TCCGG	2	10	34026	34035	0 %	20 %	40 %	40 %	414344567
23	NC_019397	CCAGC	2	10	35654	35663	20 %	0 %	20 %	60 %	414344569
24	NC_019397	GATCA	2	10	43705	43714	40 %	20 %	20 %	20 %	414344579
25	NC_019397	GCGAT	2	10	43912	43921	20 %	20 %	40 %	20 %	414344580
26	NC_019397	TGGCG	2	10	43945	43954	0 %	20 %	60 %	20 %	414344580
27	NC_019397	GACGT	2	10	45526	45535	20 %	20 %	40 %	20 %	414344581
28	NC_019397	GGAAT	2	10	46702	46711	40 %	20 %	40 %	0 %	414344583
29	NC_019397	GAGAC	2	10	46836	46845	40 %	0 %	40 %	20 %	414344583
30	NC_019397	AAAAG	2	10	47372	47381	80 %	0 %	20 %	0 %	414344584
31	NC_019397	AAAAG	2	10	47812	47821	80 %	0 %	20 %	0 %	414344585
32	NC_019397	AAAAG	2	10	48252	48261	80 %	0 %	20 %	0 %	414344586
33	NC_019397	AAAAG	2	10	48692	48701	80 %	0 %	20 %	0 %	414344587
34	NC_019397	AAAAG	2	10	49132	49141	80 %	0 %	20 %	0 %	414344588
35	NC_019397	CCGCA	2	10	50230	50239	20 %	0 %	20 %	60 %	414344591
36	NC_019397	GCCGA	2	10	51195	51204	20 %	0 %	40 %	40 %	414344592
37	NC_019397	TCGCT	2	10	51418	51427	0 %	40 %	20 %	40 %	414344592
38	NC_019397	CTCCC	2	10	53058	53067	0 %	20 %	0 %	80 %	414344594
39	NC_019397	GTCCG	2	10	55986	55995	0 %	20 %	40 %	40 %	414344597
40	NC_019397	AGGAG	2	10	56957	56966	40 %	0 %	60 %	0 %	414344597
41	NC_019397	CGATC	2	10	57254	57263	20 %	20 %	20 %	40 %	414344597
42	NC_019397	ACGGG	2	10	59163	59172	20 %	0 %	60 %	20 %	414344597
43	NC_019397	GATCG	2	10	59390	59399	20 %	20 %	40 %	20 %	414344597
44	NC_019397	ACTGA	2	10	61023	61032	40 %	20 %	20 %	20 %	414344598
45	NC_019397	GCAGC	2	10	62614	62623	20 %	0 %	40 %	40 %	414344601
46	NC_019397	CAGGA	2	10	66381	66390	40 %	0 %	40 %	20 %	414344607
47	NC_019397	GCGCC	2	10	68675	68684	0 %	0 %	40 %	60 %	414344610
48	NC_019397	GCAGA	2	10	71782	71791	40 %	0 %	40 %	20 %	414344613
49	NC_019397	GTGCG	2	10	72567	72576	0 %	20 %	60 %	20 %	414344614
50	NC_019397	TCTTG	2	10	79027	79036	0 %	60 %	20 %	20 %	414344624
51	NC_019397	CGGAT	2	10	82793	82802	20 %	20 %	40 %	20 %	414344628
52	NC_019397	CTTCT	2	10	85971	85980	0 %	60 %	0 %	40 %	414344634
53	NC_019397	CCTCA	2	10	90655	90664	20 %	20 %	0 %	60 %	414344638
54	NC_019397	ATAGA	2	10	92597	92606	60 %	20 %	20 %	0 %	414344640
55	NC_019397	CTTCG	2	10	93908	93917	0 %	40 %	20 %	40 %	414344642
56	NC_019397	TGAAT	2	10	94835	94844	40 %	40 %	20 %	0 %	414344642
57	NC_019397	CAGCA	2	10	96252	96261	40 %	0 %	20 %	40 %	414344645
58	NC_019397	CATTC	2	10	97463	97472	20 %	40 %	0 %	40 %	414344645
59	NC_019397	GCGGA	2	10	98902	98911	20 %	0 %	60 %	20 %	414344647
60	NC_019397	GACCA	2	10	99934	99943	40 %	0 %	20 %	40 %	414344647
61	NC_019397	GACCG	2	10	100985	100994	20 %	0 %	40 %	40 %	414344650
62	NC_019397	TGATC	2	10	103182	103191	20 %	40 %	20 %	20 %	414344652
63	NC_019397	CGCTG	2	10	105151	105160	0 %	20 %	40 %	40 %	414344657
64	NC_019397	CTTCT	2	10	109892	109901	0 %	60 %	0 %	40 %	414344662
65	NC_019397	GGGCT	2	10	111360	111369	0 %	20 %	60 %	20 %	414344663
66	NC_019397	AGCAG	2	10	113220	113229	40 %	0 %	40 %	20 %	414344665
67	NC_019397	CAGGA	2	10	113387	113396	40 %	0 %	40 %	20 %	414344665
68	NC_019397	CCCAT	2	10	118321	118330	20 %	20 %	0 %	60 %	414344671
69	NC_019397	CCGCA	2	10	122826	122835	20 %	0 %	20 %	60 %	414344675
70	NC_019397	GGCCG	2	10	123775	123784	0 %	0 %	60 %	40 %	414344676
71	NC_019397	GGCCG	2	10	126487	126496	0 %	0 %	60 %	40 %	414344679
72	NC_019397	GGACC	2	10	126769	126778	20 %	0 %	40 %	40 %	414344679
73	NC_019397	GGAGT	2	10	128873	128882	20 %	20 %	60 %	0 %	414344683
74	NC_019397	TCACA	2	10	128968	128977	40 %	20 %	0 %	40 %	414344684
75	NC_019397	GTCAC	2	10	129878	129887	20 %	20 %	20 %	40 %	414344686
76	NC_019397	CTGCG	2	10	134425	134434	0 %	20 %	40 %	40 %	414344690
77	NC_019397	AGCTT	2	10	134596	134605	20 %	40 %	20 %	20 %	414344691
78	NC_019397	CAGAG	2	10	138629	138638	40 %	0 %	40 %	20 %	414344694
79	NC_019397	CCTCA	2	10	142140	142149	20 %	20 %	0 %	60 %	414344698
80	NC_019397	CCTTT	2	10	142435	142444	0 %	60 %	0 %	40 %	414344698
81	NC_019397	TCGCA	2	10	142583	142592	20 %	20 %	20 %	40 %	414344698
82	NC_019397	CACAC	2	10	142618	142627	40 %	0 %	0 %	60 %	414344698
83	NC_019397	CATGC	2	10	143481	143490	20 %	20 %	20 %	40 %	414344700
84	NC_019397	CGGAG	2	10	143669	143678	20 %	0 %	60 %	20 %	414344700
85	NC_019397	CCTGT	2	10	144942	144951	0 %	40 %	20 %	40 %	414344701
86	NC_019397	TTTCA	2	10	146592	146601	20 %	60 %	0 %	20 %	414344702
87	NC_019397	AGGTG	2	10	150918	150927	20 %	20 %	60 %	0 %	414344708
88	NC_019397	GATCT	2	10	151650	151659	20 %	40 %	20 %	20 %	414344710
89	NC_019397	CAGGA	2	10	152649	152658	40 %	0 %	40 %	20 %	414344712
90	NC_019397	CCCAG	2	10	157727	157736	20 %	0 %	20 %	60 %	414344719
91	NC_019397	CGGAG	2	10	160070	160079	20 %	0 %	60 %	20 %	414344725
92	NC_019397	GCGTT	2	10	162253	162262	0 %	40 %	40 %	20 %	414344727
93	NC_019397	GTTCT	2	10	162843	162852	0 %	60 %	20 %	20 %	414344727
94	NC_019397	ACGAG	2	10	164054	164063	40 %	0 %	40 %	20 %	414344728
95	NC_019397	GACAT	2	10	164863	164872	40 %	20 %	20 %	20 %	414344729
96	NC_019397	TGGCG	2	10	166669	166678	0 %	20 %	60 %	20 %	414344731
97	NC_019397	GGCGA	2	10	166970	166979	20 %	0 %	60 %	20 %	414344731
98	NC_019397	GTCGG	2	10	167299	167308	0 %	20 %	60 %	20 %	414344732
99	NC_019397	CGTGA	2	10	168144	168153	20 %	20 %	40 %	20 %	414344734
100	NC_019397	TCCAC	2	10	168371	168380	20 %	20 %	0 %	60 %	414344734
101	NC_019397	CCGGT	2	10	168978	168987	0 %	20 %	40 %	40 %	414344735
102	NC_019397	GTCCG	2	10	169068	169077	0 %	20 %	40 %	40 %	414344735
103	NC_019397	CCCTC	2	10	169356	169365	0 %	20 %	0 %	80 %	414344736
104	NC_019397	CTGGG	2	10	170673	170682	0 %	20 %	60 %	20 %	414344738
105	NC_019397	ACCGG	2	10	170706	170715	20 %	0 %	40 %	40 %	414344738
106	NC_019397	GTTTT	2	10	171142	171151	0 %	80 %	20 %	0 %	414344738
107	NC_019397	GCGCC	2	10	174157	174166	0 %	0 %	40 %	60 %	414344744
108	NC_019397	GCTCT	2	10	174788	174797	0 %	40 %	20 %	40 %	414344746
109	NC_019397	TCAGA	2	10	175698	175707	40 %	20 %	20 %	20 %	414344748
110	NC_019397	GCTTT	2	10	179618	179627	0 %	60 %	20 %	20 %	414344751
111	NC_019397	AGATG	2	10	182313	182322	40 %	20 %	40 %	0 %	414344755
112	NC_019397	TGGTT	2	10	186397	186406	0 %	60 %	40 %	0 %	414344759
113	NC_019397	ATCTA	2	10	189124	189133	40 %	40 %	0 %	20 %	414344760
114	NC_019397	TTTGT	2	10	190205	190214	0 %	80 %	20 %	0 %	414344761
115	NC_019397	ACGCA	2	10	193544	193553	40 %	0 %	20 %	40 %	414344765
116	NC_019397	AACCC	2	10	195295	195304	40 %	0 %	0 %	60 %	414344768
117	NC_019397	GTTGC	2	10	197364	197373	0 %	40 %	40 %	20 %	414344769
118	NC_019397	GGCAA	2	10	199609	199618	40 %	0 %	40 %	20 %	414344771
119	NC_019397	CTGAT	2	10	201585	201594	20 %	40 %	20 %	20 %	414344774
120	NC_019397	TATGC	2	10	201656	201665	20 %	40 %	20 %	20 %	414344774
121	NC_019397	ACAAG	2	10	204333	204342	60 %	0 %	20 %	20 %	414344777
122	NC_019397	ATGCA	2	10	207578	207587	40 %	20 %	20 %	20 %	414344779
123	NC_019397	TCAGT	2	10	208417	208426	20 %	40 %	20 %	20 %	414344780
124	NC_019397	ATGAA	2	10	210132	210141	60 %	20 %	20 %	0 %	414344781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.