MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconobacter oxydans H24 plasmid unnamed

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019397	GCCA	2	8	2577	2584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019397	GATC	2	8	8828	8835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019397	GGTC	2	8	9515	9522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019397	ATTG	2	8	11057	11064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019397	AATC	2	8	11096	11103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019397	ATTT	2	8	11190	11197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019397	GGAA	2	8	11548	11555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019397	CACG	2	8	11593	11600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019397	TCGC	2	8	11633	11640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019397	GACG	2	8	11758	11765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019397	GCTC	2	8	15013	15020	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019397	CAGC	2	8	20628	20635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019397	CATC	2	8	22356	22363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019397	CGCC	2	8	32147	32154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_019397	TTAT	2	8	33142	33149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019397	GCTC	2	8	33694	33701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019397	CGGA	2	8	39540	39547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019397	TGCA	2	8	46085	46092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019397	TGCA	2	8	47185	47192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019397	TGCA	2	8	47214	47221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019397	TGCA	2	8	47625	47632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019397	TGCA	2	8	47654	47661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019397	TGCA	2	8	48065	48072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019397	TGCA	2	8	48094	48101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019397	TGCA	2	8	48505	48512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019397	TGCA	2	8	48534	48541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019397	TGCA	2	8	48945	48952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019397	TGCA	2	8	48974	48981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019397	GCGG	2	8	49511	49518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019397	GCCC	2	8	54801	54808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_019397	GTCC	2	8	54821	54828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019397	AGTT	2	8	60574	60581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019397	GAAG	2	8	61665	61672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019397	CCGG	2	8	63748	63755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019397	GGGT	2	8	65115	65122	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019397	ACGC	2	8	66687	66694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019397	TCAA	3	12	67606	67617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019397	CTGG	2	8	71483	71490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019397	AAGG	2	8	73099	73106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019397	AAAT	2	8	77468	77475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019397	CCAC	2	8	78330	78337	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_019397	GACG	2	8	80503	80510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019397	AACT	2	8	96088	96095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019397	TACT	2	8	96096	96103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019397	CCAA	2	8	108858	108865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019397	GGCG	2	8	108890	108897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019397	TCCA	2	8	115923	115930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019397	ATGA	2	8	124692	124699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019397	AGCG	2	8	124814	124821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019397	TTTA	2	8	125084	125091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019397	TCTT	2	8	125285	125292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019397	TGAG	2	8	125353	125360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019397	GGAA	2	8	127659	127666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019397	CAGG	2	8	127713	127720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019397	CAAC	2	8	143017	143024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019397	TGAT	2	8	143045	143052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019397	ATCA	2	8	143066	143073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019397	TGAT	2	8	143090	143097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019397	TTAT	2	8	147745	147752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019397	TCAA	2	8	149195	149202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019397	CAAC	2	8	149238	149245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019397	ACAG	2	8	159454	159461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019397	AATG	2	8	166163	166170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019397	GTTG	2	8	166525	166532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019397	GCCA	2	8	175039	175046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019397	TCGA	2	8	181046	181053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019397	GTTG	2	8	181958	181965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019397	CATG	2	8	181978	181985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019397	GGTT	2	8	184057	184064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019397	TCAA	2	8	192272	192279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019397	CAAC	2	8	192315	192322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019397	TCCC	2	8	192333	192340	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_019397	GATG	2	8	194163	194170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019397	TGGT	2	8	194259	194266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019397	TGAT	2	8	195159	195166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019397	GTCT	2	8	199791	199798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019397	TCTT	2	8	200048	200055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019397	CAAT	2	8	202164	202171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.