MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconobacter oxydans H24 plasmid unnamed

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019397	AGA	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019397	CCA	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019397	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019397	CGT	2	6	2531	2536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019397	GAG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019397	AAT	2	6	8258	8263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019397	CAG	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019397	GTC	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019397	GGC	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019397	TCA	2	6	10583	10588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019397	GCT	2	6	10609	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019397	ATG	2	6	10696	10701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019397	TAT	2	6	11144	11149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019397	TTG	2	6	11158	11163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019397	ATA	2	6	11234	11239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019397	AGA	2	6	11246	11251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019397	AAT	2	6	11357	11362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019397	CAG	2	6	11396	11401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019397	AGC	2	6	11608	11613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019397	AGA	2	6	11715	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019397	GGC	2	6	12547	12552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019397	ACA	2	6	14577	14582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019397	CCT	2	6	14606	14611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019397	GTC	2	6	14900	14905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019397	GGA	2	6	15055	15060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019397	AAC	2	6	15112	15117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019397	GAC	2	6	15125	15130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019397	TCC	2	6	15132	15137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019397	GCC	2	6	15146	15151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019397	TTG	2	6	15845	15850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019397	GTT	2	6	18627	18632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019397	CAT	2	6	18667	18672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019397	TGG	2	6	18818	18823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019397	TAA	2	6	18853	18858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019397	TAA	2	6	18866	18871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019397	AAT	2	6	19994	19999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019397	CTG	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019397	GTC	2	6	20572	20577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019397	GGA	2	6	20662	20667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019397	GCC	2	6	22439	22444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019397	ATG	2	6	24055	24060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019397	TAC	2	6	25528	25533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019397	GAT	2	6	27274	27279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019397	TTG	2	6	29014	29019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019397	AGG	2	6	29025	29030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019397	AGA	2	6	29044	29049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019397	CTT	2	6	29062	29067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019397	AAG	2	6	30640	30645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019397	TAT	2	6	31148	31153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019397	GGT	2	6	32209	32214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019397	TCG	2	6	32224	32229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019397	GCA	2	6	32236	32241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019397	TGA	2	6	33623	33628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019397	GCG	2	6	33645	33650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019397	CAT	2	6	33660	33665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019397	GCA	2	6	33757	33762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019397	AAC	2	6	33800	33805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019397	GCT	2	6	33910	33915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019397	ATC	2	6	36155	36160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019397	TGT	2	6	36178	36183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019397	ACT	2	6	36326	36331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019397	AGT	2	6	37749	37754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019397	TGC	2	6	37808	37813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019397	TGC	2	6	40269	40274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019397	CGA	2	6	45946	45951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019397	AGG	2	6	45970	45975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019397	TAG	2	6	47176	47181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019397	CTG	2	6	47233	47238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019397	AAT	2	6	47253	47258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019397	CTG	2	6	47673	47678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019397	AAT	2	6	47693	47698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019397	CTG	2	6	48113	48118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019397	AAT	2	6	48133	48138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019397	CTG	2	6	48553	48558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019397	AAT	2	6	48573	48578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019397	CTG	2	6	48993	48998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019397	AAT	2	6	49013	49018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019397	GGC	2	6	49939	49944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019397	GAA	2	6	50680	50685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019397	CGG	2	6	50723	50728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019397	GGA	2	6	50764	50769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019397	GAA	2	6	54770	54775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019397	GCA	2	6	55274	55279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019397	TGC	2	6	60450	60455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019397	ATG	2	6	60646	60651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019397	ACC	2	6	60658	60663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019397	CAT	2	6	60676	60681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019397	ATC	2	6	60733	60738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019397	CGC	2	6	60748	60753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019397	ATA	2	6	60820	60825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019397	TAG	2	6	60885	60890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019397	TTC	2	6	60893	60898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019397	AGG	2	6	60925	60930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019397	AAG	2	6	61696	61701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019397	AGG	2	6	63720	63725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019397	CTC	2	6	63768	63773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019397	CGC	2	6	63782	63787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019397	CGC	2	6	63806	63811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019397	GCC	2	6	64591	64596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019397	CAC	2	6	65089	65094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019397	GCC	2	6	65382	65387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019397	GGC	2	6	65394	65399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019397	TTC	2	6	66676	66681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019397	AGG	2	6	66750	66755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019397	CTT	2	6	67193	67198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019397	ACC	2	6	67241	67246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019397	GGA	2	6	67710	67715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019397	ATC	2	6	71429	71434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019397	GAC	2	6	71443	71448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019397	GGC	2	6	71520	71525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019397	TAA	2	6	74275	74280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019397	CCA	2	6	74339	74344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019397	GCC	2	6	75170	75175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_019397	GCC	2	6	76964	76969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019397	CAG	2	6	78318	78323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019397	CGT	2	6	78404	78409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019397	TCG	2	6	78434	78439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019397	ATG	2	6	79101	79106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019397	TCA	2	6	79201	79206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019397	ATC	2	6	79235	79240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019397	ATG	2	6	79243	79248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019397	TTC	2	6	80305	80310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019397	CAC	2	6	80369	80374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019397	GCC	2	6	80428	80433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019397	CTC	2	6	80543	80548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019397	ACG	2	6	80594	80599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019397	TCG	2	6	80834	80839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019397	CGC	2	6	80853	80858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019397	GTG	2	6	83010	83015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019397	ATG	2	6	85904	85909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019397	TAG	2	6	86820	86825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019397	TGA	3	9	91414	91422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019397	AAT	2	6	91481	91486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019397	TTC	3	9	91495	91503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019397	AAT	2	6	91541	91546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019397	GGA	2	6	91551	91556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019397	GCG	2	6	95069	95074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019397	CTC	2	6	95521	95526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019397	ATC	2	6	103831	103836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_019397	CCG	2	6	200838	200843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_019397	CGG	2	6	202014	202019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_019397	ATA	2	6	202117	202122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_019397	TTA	2	6	204774	204779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019397	TCC	2	6	204812	204817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.