MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconobacter oxydans H24 chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019396	ATTCCT	2	12	9425	9436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019396	GTGGCT	2	12	90242	90253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019396	CAGTCG	2	12	226877	226888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019396	CAGACG	2	12	262433	262444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019396	CCGAAC	2	12	435940	435951	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019396	TATCAG	2	12	466498	466509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019396	GGGATA	2	12	471733	471744	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019396	CGCAAG	2	12	490517	490528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019396	CGTCAG	2	12	538041	538052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019396	AAGCGG	2	12	594324	594335	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019396	AGGATC	2	12	642789	642800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019396	TCGTTC	2	12	667395	667406	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019396	TTCAAT	2	12	677748	677759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019396	TCTCCC	2	12	690946	690957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019396	CAGCAC	2	12	799667	799678	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019396	TTTCGC	2	12	805221	805232	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019396	CTCGCC	2	12	817621	817632	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019396	TTCTCA	2	12	818956	818967	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019396	CGATCA	2	12	832698	832709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019396	AAATAA	2	12	951375	951386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019396	CTCGCC	2	12	971349	971360	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019396	TTCTCA	2	12	972684	972695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019396	ACCCTT	2	12	998483	998494	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019396	TACGTC	2	12	999866	999877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019396	ACCAAG	2	12	1005843	1005854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019396	AACAGA	2	12	1057953	1057964	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019396	CCTATC	2	12	1088116	1088127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019396	AGTATG	2	12	1121062	1121073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019396	GCCATA	2	12	1122669	1122680	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019396	ATCGGC	2	12	1127132	1127143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019396	GATGAA	2	12	1188602	1188613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019396	GAACAC	2	12	1276597	1276608	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019396	TGGATC	2	12	1357156	1357167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019396	AATTGA	2	12	1414710	1414721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019396	GAAAAA	2	12	1419179	1419190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019396	CTTTCT	2	12	1434011	1434022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019396	GTTTCA	2	12	1513136	1513147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019396	GTTTGT	2	12	1534044	1534055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019396	GCAGGA	2	12	1572548	1572559	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019396	AAGAGC	2	12	1637431	1637442	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019396	ATCCTT	2	12	1668596	1668607	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019396	GCGCAG	2	12	1707179	1707190	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019396	TGAGAA	2	12	1753341	1753352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019396	GGCGAG	2	12	1754676	1754687	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019396	CCTGGT	2	12	1807087	1807098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019396	GGCAAA	2	12	1824623	1824634	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019396	AAATGA	2	12	1834065	1834076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019396	TTGCGC	2	12	1923729	1923740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019396	TAAAAA	2	12	1986274	1986285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019396	GGACTG	2	12	2039117	2039128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019396	TTTGTA	2	12	2143226	2143237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019396	TGAGAA	2	12	2182598	2182609	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019396	GGCGAG	2	12	2183933	2183944	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019396	GACGGA	2	12	2293394	2293405	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019396	AAAAGA	2	12	2325605	2325616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019396	TGACGA	2	12	2369983	2369994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019396	CAGCGC	2	12	2463385	2463396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019396	CTCTGT	2	12	2589056	2589067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019396	ACACCC	2	12	2638651	2638662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019396	TGTCTC	2	12	2667365	2667376	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019396	AAAATA	2	12	2667562	2667573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019396	GCTTGT	14	84	2668696	2668779	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019396	TCCCTA	2	12	2726170	2726181	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019396	ACAAAT	2	12	2729070	2729081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019396	TGGCAG	2	12	2778349	2778360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019396	GCCTCT	2	12	2795461	2795472	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019396	GAGCCA	2	12	2910431	2910442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019396	TCCCCT	2	12	3049879	3049890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019396	ATTTGA	2	12	3062196	3062207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019396	CTGTCA	2	12	3069905	3069916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019396	CTGCCG	2	12	3134505	3134516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019396	GCAACA	2	12	3198748	3198759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019396	TATCAA	2	12	3204350	3204361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019396	TTTAAT	2	12	3272116	3272127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019396	GCGTCC	2	12	3302072	3302083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019396	CTTCCG	2	12	3361732	3361743	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019396	CAAATA	2	12	3365408	3365419	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019396	TCCCCC	2	12	3376446	3376457	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_019396	CGGAAC	2	12	3376490	3376501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019396	CTCTGA	2	12	3387998	3388009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019396	TGACGA	2	12	3424848	3424859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019396	ACCTCA	2	12	3435777	3435788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019396	CTCGCC	2	12	3447416	3447427	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019396	TTCTCA	2	12	3448751	3448762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019396	ATGAAA	2	12	3453717	3453728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019396	TCGTTA	2	12	3459152	3459163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.