MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans H24 chromosome

Total Repeats: 2455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019396	CATGG	2	10	536	545	20 %	20 %	40 %	20 %	414341024
2	NC_019396	TGCCT	2	10	3524	3533	0 %	40 %	20 %	40 %	414341027
3	NC_019396	GGCAT	2	10	3738	3747	20 %	20 %	40 %	20 %	414341027
4	NC_019396	CGCTG	2	10	4178	4187	0 %	20 %	40 %	40 %	414341027
5	NC_019396	CCAGC	2	10	4315	4324	20 %	0 %	20 %	60 %	414341028
6	NC_019396	TCCCG	2	10	6798	6807	0 %	20 %	20 %	60 %	414341031
7	NC_019396	GACAG	2	10	6969	6978	40 %	0 %	40 %	20 %	414341031
8	NC_019396	GGCAA	2	10	7395	7404	40 %	0 %	40 %	20 %	414341031
9	NC_019396	ACGCG	2	10	8771	8780	20 %	0 %	40 %	40 %	414341032
10	NC_019396	CGTGC	2	10	9359	9368	0 %	20 %	40 %	40 %	414341032
11	NC_019396	GTTCA	2	10	9855	9864	20 %	40 %	20 %	20 %	414341033
12	NC_019396	CGCTT	2	10	13147	13156	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019396	GACGA	2	10	14378	14387	40 %	0 %	40 %	20 %	414341038
14	NC_019396	TCCAG	2	10	14964	14973	20 %	20 %	20 %	40 %	414341038
15	NC_019396	GCGCG	2	10	17479	17488	0 %	0 %	60 %	40 %	414341040
16	NC_019396	AGAAC	2	10	18554	18563	60 %	0 %	20 %	20 %	414341041
17	NC_019396	GGCCA	2	10	19253	19262	20 %	0 %	40 %	40 %	414341042
18	NC_019396	ACCTC	2	10	22079	22088	20 %	20 %	0 %	60 %	414341046
19	NC_019396	CCGGA	2	10	23070	23079	20 %	0 %	40 %	40 %	414341047
20	NC_019396	ACTCA	2	10	23410	23419	40 %	20 %	0 %	40 %	414341048
21	NC_019396	CACGC	2	10	24373	24382	20 %	0 %	20 %	60 %	414341049
22	NC_019396	CAGCG	2	10	29245	29254	20 %	0 %	40 %	40 %	414341053
23	NC_019396	TCGGC	2	10	30272	30281	0 %	20 %	40 %	40 %	414341054
24	NC_019396	TGACA	2	10	31012	31021	40 %	20 %	20 %	20 %	414341055
25	NC_019396	ACTTC	2	10	31340	31349	20 %	40 %	0 %	40 %	414341056
26	NC_019396	CAGCG	2	10	32155	32164	20 %	0 %	40 %	40 %	414341057
27	NC_019396	CATGG	2	10	33321	33330	20 %	20 %	40 %	20 %	414341058
28	NC_019396	GAGAA	2	10	37090	37099	60 %	0 %	40 %	0 %	414341061
29	NC_019396	AACCC	2	10	37154	37163	40 %	0 %	0 %	60 %	414341061
30	NC_019396	ACTGC	2	10	39125	39134	20 %	20 %	20 %	40 %	414341063
31	NC_019396	GCACA	2	10	40159	40168	40 %	0 %	20 %	40 %	414341063
32	NC_019396	CCACG	2	10	41915	41924	20 %	0 %	20 %	60 %	414341064
33	NC_019396	CCCGA	2	10	42118	42127	20 %	0 %	20 %	60 %	414341064
34	NC_019396	AGAAT	2	10	42549	42558	60 %	20 %	20 %	0 %	414341064
35	NC_019396	CGTCA	2	10	43718	43727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019396	CTGTT	2	10	45497	45506	0 %	60 %	20 %	20 %	414341068
37	NC_019396	CACAA	2	10	45550	45559	60 %	0 %	0 %	40 %	414341068
38	NC_019396	AAGCA	2	10	46841	46850	60 %	0 %	20 %	20 %	414341069
39	NC_019396	CTGAC	2	10	48924	48933	20 %	20 %	20 %	40 %	414341073
40	NC_019396	CAACG	2	10	50749	50758	40 %	0 %	20 %	40 %	414341073
41	NC_019396	CGTTA	2	10	52393	52402	20 %	40 %	20 %	20 %	414341075
42	NC_019396	TGGCA	2	10	54990	54999	20 %	20 %	40 %	20 %	414341078
43	NC_019396	ACGCA	2	10	56424	56433	40 %	0 %	20 %	40 %	414341079
44	NC_019396	ATACG	2	10	56587	56596	40 %	20 %	20 %	20 %	414341079
45	NC_019396	TCTCT	2	10	57878	57887	0 %	60 %	0 %	40 %	414341080
46	NC_019396	TGGCC	2	10	58312	58321	0 %	20 %	40 %	40 %	414341080
47	NC_019396	CGATC	2	10	61918	61927	20 %	20 %	20 %	40 %	414341083
48	NC_019396	CGAAC	2	10	65975	65984	40 %	0 %	20 %	40 %	414341088
49	NC_019396	CGACC	2	10	78281	78290	20 %	0 %	20 %	60 %	414341097
50	NC_019396	CGATG	2	10	78674	78683	20 %	20 %	40 %	20 %	414341097
51	NC_019396	TGCAG	2	10	80619	80628	20 %	20 %	40 %	20 %	414341098
52	NC_019396	CAGAC	2	10	81249	81258	40 %	0 %	20 %	40 %	414341098
53	NC_019396	GTCCC	2	10	88674	88683	0 %	20 %	20 %	60 %	414341108
54	NC_019396	GCTCC	2	10	89902	89911	0 %	20 %	20 %	60 %	414341109
55	NC_019396	CAATG	2	10	91485	91494	40 %	20 %	20 %	20 %	414341110
56	NC_019396	CCCCG	2	10	92056	92065	0 %	0 %	20 %	80 %	414341110
57	NC_019396	TTGTT	2	10	93068	93077	0 %	80 %	20 %	0 %	414341110
58	NC_019396	TTTGA	2	10	93645	93654	20 %	60 %	20 %	0 %	414341112
59	NC_019396	ACCGG	2	10	94147	94156	20 %	0 %	40 %	40 %	414341112
60	NC_019396	GCCCG	2	10	97023	97032	0 %	0 %	40 %	60 %	414341115
61	NC_019396	ATCTG	2	10	97907	97916	20 %	40 %	20 %	20 %	414341116
62	NC_019396	CGCCC	2	10	98042	98051	0 %	0 %	20 %	80 %	414341116
63	NC_019396	TGCAC	2	10	98169	98178	20 %	20 %	20 %	40 %	414341116
64	NC_019396	GTCCA	2	10	101271	101280	20 %	20 %	20 %	40 %	414341121
65	NC_019396	GGTAC	2	10	102708	102717	20 %	20 %	40 %	20 %	414341122
66	NC_019396	CGACC	2	10	103386	103395	20 %	0 %	20 %	60 %	414341123
67	NC_019396	GCATC	2	10	104212	104221	20 %	20 %	20 %	40 %	414341124
68	NC_019396	CAGGC	2	10	106099	106108	20 %	0 %	40 %	40 %	414341126
69	NC_019396	TGCCC	2	10	106478	106487	0 %	20 %	20 %	60 %	414341127
70	NC_019396	CTGAT	2	10	106972	106981	20 %	40 %	20 %	20 %	414341127
71	NC_019396	GCATG	2	10	107256	107265	20 %	20 %	40 %	20 %	414341128
72	NC_019396	ACGGC	2	10	109407	109416	20 %	0 %	40 %	40 %	414341130
73	NC_019396	GACCA	2	10	111358	111367	40 %	0 %	20 %	40 %	414341132
74	NC_019396	GCAGG	2	10	113269	113278	20 %	0 %	60 %	20 %	414341136
75	NC_019396	CGAAT	2	10	117739	117748	40 %	20 %	20 %	20 %	414341139
76	NC_019396	GCCGC	2	10	118082	118091	0 %	0 %	40 %	60 %	414341139
77	NC_019396	CGTTC	2	10	118722	118731	0 %	40 %	20 %	40 %	414341139
78	NC_019396	TGGCC	2	10	118917	118926	0 %	20 %	40 %	40 %	414341139
79	NC_019396	GCGTG	2	10	120931	120940	0 %	20 %	60 %	20 %	414341140
80	NC_019396	AGACG	2	10	121578	121587	40 %	0 %	40 %	20 %	414341140
81	NC_019396	CGAGC	2	10	124284	124293	20 %	0 %	40 %	40 %	414341143
82	NC_019396	GCGTG	2	10	125211	125220	0 %	20 %	60 %	20 %	414341144
83	NC_019396	CACTA	2	10	125386	125395	40 %	20 %	0 %	40 %	414341144
84	NC_019396	CGCCC	2	10	125492	125501	0 %	0 %	20 %	80 %	414341144
85	NC_019396	CCGTC	2	10	125943	125952	0 %	20 %	20 %	60 %	414341144
86	NC_019396	GGACC	2	10	127603	127612	20 %	0 %	40 %	40 %	414341146
87	NC_019396	GACGT	2	10	131837	131846	20 %	20 %	40 %	20 %	414341152
88	NC_019396	TGCCC	2	10	132564	132573	0 %	20 %	20 %	60 %	414341152
89	NC_019396	CGTGA	2	10	135767	135776	20 %	20 %	40 %	20 %	414341156
90	NC_019396	TGATC	2	10	136123	136132	20 %	40 %	20 %	20 %	414341156
91	NC_019396	ATCTC	2	10	136134	136143	20 %	40 %	0 %	40 %	414341156
92	NC_019396	TGATC	2	10	137427	137436	20 %	40 %	20 %	20 %	414341157
93	NC_019396	CCGCG	2	10	138882	138891	0 %	0 %	40 %	60 %	414341159
94	NC_019396	GCCGC	2	10	139172	139181	0 %	0 %	40 %	60 %	414341160
95	NC_019396	GCTCT	2	10	145244	145253	0 %	40 %	20 %	40 %	414341166
96	NC_019396	GCCAG	2	10	147015	147024	20 %	0 %	40 %	40 %	414341168
97	NC_019396	TGCCA	2	10	147743	147752	20 %	20 %	20 %	40 %	414341169
98	NC_019396	TCGGC	2	10	148029	148038	0 %	20 %	40 %	40 %	414341169
99	NC_019396	CGTTC	2	10	148577	148586	0 %	40 %	20 %	40 %	414341170
100	NC_019396	CCTGT	2	10	151096	151105	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019396	CGGCA	2	10	153150	153159	20 %	0 %	40 %	40 %	414341173
102	NC_019396	GATCT	2	10	155278	155287	20 %	40 %	20 %	20 %	414341174
103	NC_019396	CGGAA	2	10	158139	158148	40 %	0 %	40 %	20 %	414341177
104	NC_019396	TGCCC	2	10	158739	158748	0 %	20 %	20 %	60 %	414341177
105	NC_019396	CCCGT	2	10	160317	160326	0 %	20 %	20 %	60 %	414341180
106	NC_019396	TGCCC	2	10	164196	164205	0 %	20 %	20 %	60 %	414341183
107	NC_019396	TCTGC	2	10	166416	166425	0 %	40 %	20 %	40 %	414341186
108	NC_019396	TCAGG	2	10	167709	167718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019396	GCCCG	2	10	168384	168393	0 %	0 %	40 %	60 %	414341189
110	NC_019396	AAAAG	2	10	168570	168579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019396	ACGAG	2	10	173783	173792	40 %	0 %	40 %	20 %	414341193
112	NC_019396	GGATC	2	10	174116	174125	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019396	GCAGA	2	10	176950	176959	40 %	0 %	40 %	20 %	414341196
114	NC_019396	GTGCC	2	10	177668	177677	0 %	20 %	40 %	40 %	414341196
115	NC_019396	TGCTG	2	10	179267	179276	0 %	40 %	40 %	20 %	414341197
116	NC_019396	GATGC	2	10	182747	182756	20 %	20 %	40 %	20 %	414341200
117	NC_019396	CCATG	2	10	183033	183042	20 %	20 %	20 %	40 %	414341200
118	NC_019396	ACCCG	2	10	185374	185383	20 %	0 %	20 %	60 %	414341202
119	NC_019396	GCGGG	2	10	186860	186869	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019396	CGCGG	2	10	187585	187594	0 %	0 %	60 %	40 %	414341206
121	NC_019396	GACGG	2	10	190725	190734	20 %	0 %	60 %	20 %	414341210
122	NC_019396	ATGCA	2	10	190981	190990	40 %	20 %	20 %	20 %	414341210
123	NC_019396	GCGTC	2	10	191371	191380	0 %	20 %	40 %	40 %	414341210
124	NC_019396	GAGCC	2	10	192081	192090	20 %	0 %	40 %	40 %	414341212
125	NC_019396	GCAGC	2	10	196864	196873	20 %	0 %	40 %	40 %	414341216
126	NC_019396	TTCAC	2	10	199369	199378	20 %	40 %	0 %	40 %	414341218
127	NC_019396	ACAAG	2	10	200346	200355	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019396	CAAGG	2	10	202082	202091	40 %	0 %	40 %	20 %	414341219
129	NC_019396	CAGGA	2	10	203639	203648	40 %	0 %	40 %	20 %	414341221
130	NC_019396	CGTCC	2	10	204086	204095	0 %	20 %	20 %	60 %	414341221
131	NC_019396	TGCCC	2	10	204156	204165	0 %	20 %	20 %	60 %	414341221
132	NC_019396	TGGAA	2	10	204696	204705	40 %	20 %	40 %	0 %	414341221
133	NC_019396	GAGCA	2	10	207997	208006	40 %	0 %	40 %	20 %	414341225
134	NC_019396	GCCCC	2	10	208513	208522	0 %	0 %	20 %	80 %	414341225
135	NC_019396	CATCC	2	10	209629	209638	20 %	20 %	0 %	60 %	414341225
136	NC_019396	GCCAT	2	10	209663	209672	20 %	20 %	20 %	40 %	414341225
137	NC_019396	CCGGA	2	10	211936	211945	20 %	0 %	40 %	40 %	414341228
138	NC_019396	GTTGA	2	10	213398	213407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019396	CGGAT	2	10	213719	213728	20 %	20 %	40 %	20 %	414341230
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141	NC_019396	CATGA	2	10	214721	214730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019396	TGCTG	2	10	217810	217819	0 %	40 %	40 %	20 %	414341232
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144	NC_019396	TGGCC	2	10	223105	223114	0 %	20 %	40 %	40 %	414341235
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148	NC_019396	GAATG	2	10	234465	234474	40 %	20 %	40 %	0 %	414341247
149	NC_019396	TTGAA	2	10	235120	235129	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019396	TCTGC	2	10	235238	235247	0 %	40 %	20 %	40 %	414341248
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202	NC_019396	CTGAC	2	10	309123	309132	20 %	20 %	20 %	40 %	414341323
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234	NC_019396	GACCG	2	10	361849	361858	20 %	0 %	40 %	40 %	414341373
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243	NC_019396	GTAAT	2	10	373886	373895	40 %	40 %	20 %	0 %	414341385
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246	NC_019396	ACAGC	2	10	378456	378465	40 %	0 %	20 %	40 %	414341388
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251	NC_019396	TGGCA	2	10	392489	392498	20 %	20 %	40 %	20 %	414341404
252	NC_019396	TGTCT	2	10	392698	392707	0 %	60 %	20 %	20 %	414341405
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260	NC_019396	GAACA	2	10	402605	402614	60 %	0 %	20 %	20 %	414341413
261	NC_019396	GCCAT	2	10	403312	403321	20 %	20 %	20 %	40 %	414341415
262	NC_019396	GTGAT	2	10	403705	403714	20 %	40 %	40 %	0 %	414341415
263	NC_019396	GACCA	2	10	404359	404368	40 %	0 %	20 %	40 %	414341415
264	NC_019396	CCGAT	2	10	406041	406050	20 %	20 %	20 %	40 %	414341416
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395	NC_019396	CGGAC	2	10	588463	588472	20 %	0 %	40 %	40 %	414341607
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447	NC_019396	CGCTG	2	10	655368	655377	0 %	20 %	40 %	40 %	414341665
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457	NC_019396	GAATG	2	10	665718	665727	40 %	20 %	40 %	0 %	414341675
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482	NC_019396	GGGAG	2	10	697923	697932	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
483	NC_019396	GATCG	2	10	700557	700566	20 %	20 %	40 %	20 %	414341710
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496	NC_019396	GCTCC	2	10	727521	727530	0 %	20 %	20 %	60 %	414341734
497	NC_019396	GCAAT	2	10	730386	730395	40 %	20 %	20 %	20 %	414341735
498	NC_019396	AGACC	2	10	731548	731557	40 %	0 %	20 %	40 %	414341736
499	NC_019396	GCAGA	2	10	732398	732407	40 %	0 %	40 %	20 %	414341736
500	NC_019396	GAACG	2	10	732481	732490	40 %	0 %	40 %	20 %	414341736

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