MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	GCGTTT	2	12	2766	2777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410863778
2	NC_019394	AATACC	2	12	6797	6808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410863787
3	NC_019394	GCCTTT	2	12	8070	8081	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410863790
4	NC_019394	ACAAGG	2	12	15389	15400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410863797
5	NC_019394	CAAGAG	2	12	15682	15693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410863797
6	NC_019394	GGAGCA	2	12	16338	16349	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410863797
7	NC_019394	TCGCTA	2	12	16468	16479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019394	AAACGA	2	12	24823	24834	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410863811
9	NC_019394	AAAAGA	2	12	26020	26031	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410863813
10	NC_019394	TAAATC	2	12	33490	33501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410863827
11	NC_019394	TCAACT	2	12	39721	39732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863836
12	NC_019394	ACTTAA	2	12	43037	43048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410863839
13	NC_019394	TATCTC	2	12	50606	50617	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410863847
14	NC_019394	TCTAGA	2	12	51344	51355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410863848
15	NC_019394	TATCGA	3	18	57308	57325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410863854
16	NC_019394	CCCTCA	2	12	57778	57789	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	410863854
17	NC_019394	TATTGA	2	12	60684	60695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410863855
18	NC_019394	GCATAC	2	12	63466	63477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410863859
19	NC_019394	CAATTG	2	12	65314	65325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410863859
20	NC_019394	TTCTGC	2	12	65737	65748	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410863859
21	NC_019394	TATCGT	2	12	74056	74067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410863859
22	NC_019394	TTATCA	2	12	74169	74180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410863859
23	NC_019394	TTCTTA	2	12	74907	74918	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410863859
24	NC_019394	TTTAAA	2	12	76678	76689	50 %	50 %	0 %	0 %	410863860
25	NC_019394	AAATTT	2	12	103573	103584	50 %	50 %	0 %	0 %	410863883
26	NC_019394	TTGATG	2	12	104582	104593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410863885
27	NC_019394	ACCAGA	2	12	107610	107621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410863890
28	NC_019394	GTGACG	2	12	109454	109465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410863893
29	NC_019394	CCAACA	2	12	109957	109968	50 %	0 %	0 %	50 %	410863894
30	NC_019394	TTCACC	2	12	112286	112297	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410863896
31	NC_019394	TTTTTG	2	12	125878	125889	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410863908
32	NC_019394	ATCAAA	2	12	128936	128947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410863909
33	NC_019394	ATACCA	2	12	129575	129586	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410863909
34	NC_019394	ATACTG	2	12	135873	135884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019394	TATGAT	2	12	136469	136480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019394	TACTAT	2	12	137630	137641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410863913
37	NC_019394	GCAACA	2	12	143871	143882	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410863920
38	NC_019394	CAAACT	2	12	146529	146540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019394	AAGCTC	2	12	152363	152374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410863928
40	NC_019394	GCCGAG	2	12	154147	154158	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410863931
41	NC_019394	TTGTTT	2	12	154502	154513	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410863932
42	NC_019394	TGCCAG	2	12	167545	167556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410863939
43	NC_019394	ATGACT	2	12	171981	171992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410863941
44	NC_019394	TATGAC	2	12	172028	172039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410863941
45	NC_019394	TGTAGG	2	12	172552	172563	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410863941
46	NC_019394	CGAGCA	2	12	174446	174457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863942
47	NC_019394	TTCCAT	2	12	177005	177016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410863943
48	NC_019394	ATCGAC	2	12	181493	181504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410863946
49	NC_019394	AATCTT	2	12	181859	181870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410863946
50	NC_019394	CATTGT	2	12	182712	182723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410863946
51	NC_019394	TCAAAG	2	12	186137	186148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410863946
52	NC_019394	GGCAGA	2	12	186523	186534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410863946
53	NC_019394	CAGCGG	2	12	189118	189129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410863948
54	NC_019394	CATTGC	2	12	192931	192942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410863949
55	NC_019394	GTAAAT	2	12	202532	202543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410863953
56	NC_019394	GGCAAG	2	12	202566	202577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410863953
57	NC_019394	ATATTG	2	12	208187	208198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410863954
58	NC_019394	TGGCTT	2	12	213331	213342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410863956
59	NC_019394	TAAACC	2	12	214435	214446	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410863957
60	NC_019394	AATTGA	2	12	216496	216507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410863958
61	NC_019394	TAAGTG	2	12	223160	223171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863960
62	NC_019394	GTAATT	2	12	242660	242671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410863975
63	NC_019394	ATTGCC	2	12	249962	249973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410863982
64	NC_019394	TTTACA	2	12	251580	251591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410863982
65	NC_019394	CTTACG	2	12	251637	251648	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410863982
66	NC_019394	ATCTAC	2	12	255081	255092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863986
67	NC_019394	AATGGC	2	12	255263	255274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410863986
68	NC_019394	TTCATC	2	12	255312	255323	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410863986
69	NC_019394	TGTTTT	2	12	255963	255974	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410863986
70	NC_019394	TTACTT	2	12	257970	257981	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410863988
71	NC_019394	GCACTT	2	12	258572	258583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410863988
72	NC_019394	AAACGA	2	12	263191	263202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410863995
73	NC_019394	AAAAGA	2	12	264388	264399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410863997
74	NC_019394	TAAATC	2	12	271858	271869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410864011
75	NC_019394	TGCAAA	2	12	283334	283345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410864027
76	NC_019394	TCAAAT	2	12	284438	284449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410864028
77	NC_019394	TTTCTA	2	12	286482	286493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019394	ATTAAT	2	12	289715	289726	50 %	50 %	0 %	0 %	410864033
79	NC_019394	CCCTCC	2	12	292135	292146	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	410864036
80	NC_019394	TTAACA	2	12	295551	295562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410864042
81	NC_019394	TATTTT	2	12	295911	295922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019394	ATTTTC	2	12	297160	297171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410864043
83	NC_019394	CTAAAT	2	12	300374	300385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410864046

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.