MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	GCTTA	2	10	156	165	20 %	40 %	20 %	20 %	410863774
2	NC_019394	AAACC	2	10	3713	3722	60 %	0 %	0 %	40 %	410863780
3	NC_019394	GCCTT	2	10	5033	5042	0 %	40 %	20 %	40 %	410863783
4	NC_019394	AAAAT	2	10	5565	5574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019394	ACACC	2	10	10359	10368	40 %	0 %	0 %	60 %	410863791
6	NC_019394	CCTTA	2	10	11951	11960	20 %	40 %	0 %	40 %	410863794
7	NC_019394	GAAAT	2	10	13359	13368	60 %	20 %	20 %	0 %	410863795
8	NC_019394	TGCCA	2	10	13370	13379	20 %	20 %	20 %	40 %	410863795
9	NC_019394	TAGAA	2	10	14415	14424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019394	AAGTG	2	10	15795	15804	40 %	20 %	40 %	0 %	410863797
11	NC_019394	GCTAT	2	10	15851	15860	20 %	40 %	20 %	20 %	410863797
12	NC_019394	AAACG	2	10	16801	16810	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019394	CCGCT	2	10	19032	19041	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_019394	GCTTT	2	10	20868	20877	0 %	60 %	20 %	20 %	410863804
15	NC_019394	ACGCC	2	10	20964	20973	20 %	0 %	20 %	60 %	410863804
16	NC_019394	CTGTG	2	10	21971	21980	0 %	40 %	40 %	20 %	410863806
17	NC_019394	TCAGT	2	10	22963	22972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019394	TTTAA	2	10	26382	26391	40 %	60 %	0 %	0 %	410863814
19	NC_019394	ACAAG	2	10	26729	26738	60 %	0 %	20 %	20 %	410863814
20	NC_019394	AAGCA	2	10	29158	29167	60 %	0 %	20 %	20 %	410863819
21	NC_019394	AAAAG	2	10	30686	30695	80 %	0 %	20 %	0 %	410863821
22	NC_019394	AAACA	2	10	32294	32303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019394	TACAA	2	10	34438	34447	60 %	20 %	0 %	20 %	410863829
24	NC_019394	ATCAA	2	10	35897	35906	60 %	20 %	0 %	20 %	410863831
25	NC_019394	ATCTG	2	10	40401	40410	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019394	GCAAT	2	10	41416	41425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019394	TAGAG	2	10	43008	43017	40 %	20 %	40 %	0 %	410863839
28	NC_019394	GAAGT	2	10	43330	43339	40 %	20 %	40 %	0 %	410863839
29	NC_019394	TACAG	2	10	43612	43621	40 %	20 %	20 %	20 %	410863840
30	NC_019394	TGAGG	2	10	44362	44371	20 %	20 %	60 %	0 %	410863841
31	NC_019394	ATGAA	2	10	45372	45381	60 %	20 %	20 %	0 %	410863841
32	NC_019394	CAAAA	2	10	45794	45803	80 %	0 %	0 %	20 %	410863843
33	NC_019394	TTAAG	2	10	47891	47900	40 %	40 %	20 %	0 %	410863846
34	NC_019394	CCATT	2	10	48933	48942	20 %	40 %	0 %	40 %	410863846
35	NC_019394	AAATA	2	10	50282	50291	80 %	20 %	0 %	0 %	410863847
36	NC_019394	AATCA	2	10	52725	52734	60 %	20 %	0 %	20 %	410863850
37	NC_019394	CTAAG	2	10	53990	53999	40 %	20 %	20 %	20 %	410863851
38	NC_019394	ATTCT	2	10	54260	54269	20 %	60 %	0 %	20 %	410863851
39	NC_019394	GATAG	2	10	56013	56022	40 %	20 %	40 %	0 %	410863853
40	NC_019394	GTAAG	2	10	56237	56246	40 %	20 %	40 %	0 %	410863853
41	NC_019394	AATCC	2	10	57522	57531	40 %	20 %	0 %	40 %	410863854
42	NC_019394	CTTTG	2	10	58543	58552	0 %	60 %	20 %	20 %	410863854
43	NC_019394	CTTCA	2	10	63188	63197	20 %	40 %	0 %	40 %	410863859
44	NC_019394	TCCAT	2	10	63360	63369	20 %	40 %	0 %	40 %	410863859
45	NC_019394	GTATC	2	10	64882	64891	20 %	40 %	20 %	20 %	410863859
46	NC_019394	TATTT	2	10	64952	64961	20 %	80 %	0 %	0 %	410863859
47	NC_019394	AAGAG	2	10	65027	65036	60 %	0 %	40 %	0 %	410863859
48	NC_019394	TTGTT	2	10	66353	66362	0 %	80 %	20 %	0 %	410863859
49	NC_019394	GCTTT	2	10	67080	67089	0 %	60 %	20 %	20 %	410863859
50	NC_019394	CCACC	2	10	67632	67641	20 %	0 %	0 %	80 %	410863859
51	NC_019394	AGAGT	2	10	67643	67652	40 %	20 %	40 %	0 %	410863859
52	NC_019394	ATCTA	2	10	68393	68402	40 %	40 %	0 %	20 %	410863859
53	NC_019394	ATTTA	2	10	68636	68645	40 %	60 %	0 %	0 %	410863859
54	NC_019394	ATGTT	2	10	70485	70494	20 %	60 %	20 %	0 %	410863859
55	NC_019394	TATTT	2	10	75147	75156	20 %	80 %	0 %	0 %	410863859
56	NC_019394	GCTTA	2	10	77583	77592	20 %	40 %	20 %	20 %	410863860
57	NC_019394	GGAAT	2	10	78231	78240	40 %	20 %	40 %	0 %	410863861
58	NC_019394	CCGTT	2	10	78296	78305	0 %	40 %	20 %	40 %	410863861
59	NC_019394	GCCTT	2	10	80617	80626	0 %	40 %	20 %	40 %	410863865
60	NC_019394	TTGAT	2	10	81007	81016	20 %	60 %	20 %	0 %	410863865
61	NC_019394	TGAAA	2	10	81307	81316	60 %	20 %	20 %	0 %	410863866
62	NC_019394	CTGAC	2	10	81867	81876	20 %	20 %	20 %	40 %	410863866
63	NC_019394	TATCA	2	10	87677	87686	40 %	40 %	0 %	20 %	410863867
64	NC_019394	AACAG	2	10	88668	88677	60 %	0 %	20 %	20 %	410863868
65	NC_019394	AGTTT	2	10	90261	90270	20 %	60 %	20 %	0 %	410863871
66	NC_019394	ACAAA	2	10	90867	90876	80 %	0 %	0 %	20 %	410863872
67	NC_019394	GAAAA	2	10	95424	95433	80 %	0 %	20 %	0 %	410863874
68	NC_019394	TTAAT	2	10	95495	95504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019394	ACCTG	2	10	95665	95674	20 %	20 %	20 %	40 %	410863875
70	NC_019394	TGAAT	2	10	95834	95843	40 %	40 %	20 %	0 %	410863875
71	NC_019394	TTTGC	2	10	96362	96371	0 %	60 %	20 %	20 %	410863876
72	NC_019394	ATGAA	2	10	96824	96833	60 %	20 %	20 %	0 %	410863876
73	NC_019394	CCCTG	2	10	96887	96896	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_019394	AGAGA	2	10	98321	98330	60 %	0 %	40 %	0 %	410863878
75	NC_019394	TTTAA	2	10	101030	101039	40 %	60 %	0 %	0 %	410863881
76	NC_019394	ATTTT	2	10	102066	102075	20 %	80 %	0 %	0 %	410863881
77	NC_019394	TCTCT	2	10	102677	102686	0 %	60 %	0 %	40 %	410863882
78	NC_019394	TATTT	2	10	102914	102923	20 %	80 %	0 %	0 %	410863882
79	NC_019394	TTTTC	2	10	103041	103050	0 %	80 %	0 %	20 %	410863882
80	NC_019394	TCGAT	2	10	103341	103350	20 %	40 %	20 %	20 %	410863882
81	NC_019394	CCAGT	2	10	103877	103886	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_019394	AATAT	2	10	105337	105346	60 %	40 %	0 %	0 %	410863886
83	NC_019394	AATTC	2	10	105964	105973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019394	TCCCC	2	10	116200	116209	0 %	20 %	0 %	80 %	410863899
85	NC_019394	CTCAC	2	10	117145	117154	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_019394	AAATG	2	10	119567	119576	60 %	20 %	20 %	0 %	410863903
87	NC_019394	AATTA	2	10	121603	121612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019394	GCCAT	2	10	124298	124307	20 %	20 %	20 %	40 %	410863908
89	NC_019394	CAGGA	2	10	125219	125228	40 %	0 %	40 %	20 %	410863908
90	NC_019394	TTTGA	2	10	125993	126002	20 %	60 %	20 %	0 %	410863908
91	NC_019394	TTCAT	2	10	129250	129259	20 %	60 %	0 %	20 %	410863909
92	NC_019394	ACTCG	2	10	130271	130280	20 %	20 %	20 %	40 %	410863909
93	NC_019394	TTTTA	2	10	130574	130583	20 %	80 %	0 %	0 %	410863910
94	NC_019394	TACAG	2	10	133129	133138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019394	ATATC	2	10	133750	133759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019394	AATTC	2	10	134073	134082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019394	CTGAA	2	10	138493	138502	40 %	20 %	20 %	20 %	410863914
98	NC_019394	GTGAT	2	10	139121	139130	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019394	CAACC	2	10	141998	142007	40 %	0 %	0 %	60 %	410863918
100	NC_019394	CAAGT	2	10	143054	143063	40 %	20 %	20 %	20 %	410863918
101	NC_019394	TTTTC	2	10	146346	146355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019394	GACAC	2	10	146717	146726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019394	TTAAG	2	10	147335	147344	40 %	40 %	20 %	0 %	410863923
104	NC_019394	ATAAA	2	10	149742	149751	80 %	20 %	0 %	0 %	410863925
105	NC_019394	CATTT	2	10	149782	149791	20 %	60 %	0 %	20 %	410863925
106	NC_019394	GTAGA	2	10	151371	151380	40 %	20 %	40 %	0 %	410863926
107	NC_019394	GCGAG	2	10	152045	152054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019394	TGCGC	2	10	154083	154092	0 %	20 %	40 %	40 %	410863931
109	NC_019394	GTTTA	2	10	155689	155698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019394	TCAAA	2	10	156152	156161	60 %	20 %	0 %	20 %	410863934
111	NC_019394	ACTGA	2	10	157641	157650	40 %	20 %	20 %	20 %	410863935
112	NC_019394	TCTTT	2	10	157871	157880	0 %	80 %	0 %	20 %	410863935
113	NC_019394	GTTGA	2	10	158635	158644	20 %	40 %	40 %	0 %	410863936
114	NC_019394	ATTGG	2	10	161707	161716	20 %	40 %	40 %	0 %	410863938
115	NC_019394	TCGCC	2	10	165791	165800	0 %	20 %	20 %	60 %	410863939
116	NC_019394	GAATC	2	10	168122	168131	40 %	20 %	20 %	20 %	410863939
117	NC_019394	CTTTT	2	10	170357	170366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019394	AGGTT	2	10	171586	171595	20 %	40 %	40 %	0 %	410863940
119	NC_019394	TTTTC	2	10	172279	172288	0 %	80 %	0 %	20 %	410863941
120	NC_019394	TCATT	2	10	172645	172654	20 %	60 %	0 %	20 %	410863941
121	NC_019394	AAATG	2	10	174161	174170	60 %	20 %	20 %	0 %	410863942
122	NC_019394	ATAAA	2	10	174218	174227	80 %	20 %	0 %	0 %	410863942
123	NC_019394	AGCGA	2	10	174819	174828	40 %	0 %	40 %	20 %	410863942
124	NC_019394	TCACT	2	10	175698	175707	20 %	40 %	0 %	40 %	410863942
125	NC_019394	CGCAA	2	10	175841	175850	40 %	0 %	20 %	40 %	410863942
126	NC_019394	TGTGA	2	10	177578	177587	20 %	40 %	40 %	0 %	410863944
127	NC_019394	CTCCC	2	10	183570	183579	0 %	20 %	0 %	80 %	410863946
128	NC_019394	ATCGT	2	10	184405	184414	20 %	40 %	20 %	20 %	410863946
129	NC_019394	ATTTC	2	10	188594	188603	20 %	60 %	0 %	20 %	410863947
130	NC_019394	ATTGG	2	10	189441	189450	20 %	40 %	40 %	0 %	410863948
131	NC_019394	AGCAC	2	10	196887	196896	40 %	0 %	20 %	40 %	410863952
132	NC_019394	TCAAT	2	10	198070	198079	40 %	40 %	0 %	20 %	410863952
133	NC_019394	GGCCT	2	10	199052	199061	0 %	20 %	40 %	40 %	410863952
134	NC_019394	ACCGA	2	10	200715	200724	40 %	0 %	20 %	40 %	410863952
135	NC_019394	TGGGT	2	10	202497	202506	0 %	40 %	60 %	0 %	410863953
136	NC_019394	AAGCA	2	10	203203	203212	60 %	0 %	20 %	20 %	410863953
137	NC_019394	AGACC	2	10	206035	206044	40 %	0 %	20 %	40 %	410863954
138	NC_019394	ATTGT	2	10	210596	210605	20 %	60 %	20 %	0 %	410863954
139	NC_019394	TCCCG	2	10	210609	210618	0 %	20 %	20 %	60 %	410863954
140	NC_019394	ATTGA	2	10	212288	212297	40 %	40 %	20 %	0 %	410863955
141	NC_019394	ATCAA	2	10	213267	213276	60 %	20 %	0 %	20 %	410863956
142	NC_019394	CCCAA	2	10	215241	215250	40 %	0 %	0 %	60 %	410863958
143	NC_019394	AATTG	2	10	218751	218760	40 %	40 %	20 %	0 %	410863958
144	NC_019394	AAGCA	2	10	219515	219524	60 %	0 %	20 %	20 %	410863958
145	NC_019394	GTATT	2	10	219705	219714	20 %	60 %	20 %	0 %	410863958
146	NC_019394	TCACA	2	10	220168	220177	40 %	20 %	0 %	40 %	410863958
147	NC_019394	AGTTA	2	10	224604	224613	40 %	40 %	20 %	0 %	410863960
148	NC_019394	GTGCG	2	10	225778	225787	0 %	20 %	60 %	20 %	410863960
149	NC_019394	TCCAC	2	10	228407	228416	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_019394	GAAAG	2	10	229221	229230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019394	AAAGC	2	10	231380	231389	60 %	0 %	20 %	20 %	410863964
152	NC_019394	TCGTT	2	10	234038	234047	0 %	60 %	20 %	20 %	410863966
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155	NC_019394	TTAAA	2	10	238882	238891	60 %	40 %	0 %	0 %	410863969
156	NC_019394	CATCT	2	10	239454	239463	20 %	40 %	0 %	40 %	410863970
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159	NC_019394	GCAGT	2	10	241149	241158	20 %	20 %	40 %	20 %	410863972
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171	NC_019394	AAGCA	2	10	267526	267535	60 %	0 %	20 %	20 %	410864003
172	NC_019394	AAAAG	2	10	269054	269063	80 %	0 %	20 %	0 %	410864005
173	NC_019394	AAACA	2	10	270662	270671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_019394	TACAA	2	10	272806	272815	60 %	20 %	0 %	20 %	410864013
175	NC_019394	ATCAA	2	10	274265	274274	60 %	20 %	0 %	20 %	410864015
176	NC_019394	CGACA	2	10	277146	277155	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_019394	ATCAC	2	10	277182	277191	40 %	20 %	0 %	40 %	410864020
178	NC_019394	GATGT	2	10	277529	277538	20 %	40 %	40 %	0 %	410864020
179	NC_019394	ATCAC	2	10	280130	280139	40 %	20 %	0 %	40 %	410864022
180	NC_019394	GCAAC	2	10	280774	280783	40 %	0 %	20 %	40 %	410864024
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182	NC_019394	ATGAA	2	10	288599	288608	60 %	20 %	20 %	0 %	410864032
183	NC_019394	GCTAG	2	10	290336	290345	20 %	20 %	40 %	20 %	410864033
184	NC_019394	ACTTT	2	10	298058	298067	20 %	60 %	0 %	20 %	410864044
185	NC_019394	TTATT	2	10	299980	299989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019394	TGAAA	2	10	303033	303042	60 %	20 %	20 %	0 %	410864049
187	NC_019394	GTGAT	2	10	303098	303107	20 %	40 %	40 %	0 %	410864049

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.