MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	GCTTA	2	10	156	165	20 %	40 %	20 %	20 %	410863774
2	NC_019394	AAACC	2	10	3713	3722	60 %	0 %	0 %	40 %	410863780
3	NC_019394	GCCTT	2	10	5033	5042	0 %	40 %	20 %	40 %	410863783
4	NC_019394	ACACC	2	10	10359	10368	40 %	0 %	0 %	60 %	410863791
5	NC_019394	CCTTA	2	10	11951	11960	20 %	40 %	0 %	40 %	410863794
6	NC_019394	GAAAT	2	10	13359	13368	60 %	20 %	20 %	0 %	410863795
7	NC_019394	TGCCA	2	10	13370	13379	20 %	20 %	20 %	40 %	410863795
8	NC_019394	AAGTG	2	10	15795	15804	40 %	20 %	40 %	0 %	410863797
9	NC_019394	GCTAT	2	10	15851	15860	20 %	40 %	20 %	20 %	410863797
10	NC_019394	GCTTT	2	10	20868	20877	0 %	60 %	20 %	20 %	410863804
11	NC_019394	ACGCC	2	10	20964	20973	20 %	0 %	20 %	60 %	410863804
12	NC_019394	CTGTG	2	10	21971	21980	0 %	40 %	40 %	20 %	410863806
13	NC_019394	TTTAA	2	10	26382	26391	40 %	60 %	0 %	0 %	410863814
14	NC_019394	ACAAG	2	10	26729	26738	60 %	0 %	20 %	20 %	410863814
15	NC_019394	AAGCA	2	10	29158	29167	60 %	0 %	20 %	20 %	410863819
16	NC_019394	AAAAG	2	10	30686	30695	80 %	0 %	20 %	0 %	410863821
17	NC_019394	TACAA	2	10	34438	34447	60 %	20 %	0 %	20 %	410863829
18	NC_019394	ATCAA	2	10	35897	35906	60 %	20 %	0 %	20 %	410863831
19	NC_019394	TAGAG	2	10	43008	43017	40 %	20 %	40 %	0 %	410863839
20	NC_019394	GAAGT	2	10	43330	43339	40 %	20 %	40 %	0 %	410863839
21	NC_019394	TACAG	2	10	43612	43621	40 %	20 %	20 %	20 %	410863840
22	NC_019394	TGAGG	2	10	44362	44371	20 %	20 %	60 %	0 %	410863841
23	NC_019394	ATGAA	2	10	45372	45381	60 %	20 %	20 %	0 %	410863841
24	NC_019394	CAAAA	2	10	45794	45803	80 %	0 %	0 %	20 %	410863843
25	NC_019394	TTAAG	2	10	47891	47900	40 %	40 %	20 %	0 %	410863846
26	NC_019394	CCATT	2	10	48933	48942	20 %	40 %	0 %	40 %	410863846
27	NC_019394	AAATA	2	10	50282	50291	80 %	20 %	0 %	0 %	410863847
28	NC_019394	AATCA	2	10	52725	52734	60 %	20 %	0 %	20 %	410863850
29	NC_019394	CTAAG	2	10	53990	53999	40 %	20 %	20 %	20 %	410863851
30	NC_019394	ATTCT	2	10	54260	54269	20 %	60 %	0 %	20 %	410863851
31	NC_019394	GATAG	2	10	56013	56022	40 %	20 %	40 %	0 %	410863853
32	NC_019394	GTAAG	2	10	56237	56246	40 %	20 %	40 %	0 %	410863853
33	NC_019394	AATCC	2	10	57522	57531	40 %	20 %	0 %	40 %	410863854
34	NC_019394	CTTTG	2	10	58543	58552	0 %	60 %	20 %	20 %	410863854
35	NC_019394	CTTCA	2	10	63188	63197	20 %	40 %	0 %	40 %	410863859
36	NC_019394	TCCAT	2	10	63360	63369	20 %	40 %	0 %	40 %	410863859
37	NC_019394	GTATC	2	10	64882	64891	20 %	40 %	20 %	20 %	410863859
38	NC_019394	TATTT	2	10	64952	64961	20 %	80 %	0 %	0 %	410863859
39	NC_019394	AAGAG	2	10	65027	65036	60 %	0 %	40 %	0 %	410863859
40	NC_019394	TTGTT	2	10	66353	66362	0 %	80 %	20 %	0 %	410863859
41	NC_019394	GCTTT	2	10	67080	67089	0 %	60 %	20 %	20 %	410863859
42	NC_019394	CCACC	2	10	67632	67641	20 %	0 %	0 %	80 %	410863859
43	NC_019394	AGAGT	2	10	67643	67652	40 %	20 %	40 %	0 %	410863859
44	NC_019394	ATCTA	2	10	68393	68402	40 %	40 %	0 %	20 %	410863859
45	NC_019394	ATTTA	2	10	68636	68645	40 %	60 %	0 %	0 %	410863859
46	NC_019394	ATGTT	2	10	70485	70494	20 %	60 %	20 %	0 %	410863859
47	NC_019394	TATTT	2	10	75147	75156	20 %	80 %	0 %	0 %	410863859
48	NC_019394	GCTTA	2	10	77583	77592	20 %	40 %	20 %	20 %	410863860
49	NC_019394	GGAAT	2	10	78231	78240	40 %	20 %	40 %	0 %	410863861
50	NC_019394	CCGTT	2	10	78296	78305	0 %	40 %	20 %	40 %	410863861
51	NC_019394	GCCTT	2	10	80617	80626	0 %	40 %	20 %	40 %	410863865
52	NC_019394	TTGAT	2	10	81007	81016	20 %	60 %	20 %	0 %	410863865
53	NC_019394	TGAAA	2	10	81307	81316	60 %	20 %	20 %	0 %	410863866
54	NC_019394	CTGAC	2	10	81867	81876	20 %	20 %	20 %	40 %	410863866
55	NC_019394	TATCA	2	10	87677	87686	40 %	40 %	0 %	20 %	410863867
56	NC_019394	AACAG	2	10	88668	88677	60 %	0 %	20 %	20 %	410863868
57	NC_019394	AGTTT	2	10	90261	90270	20 %	60 %	20 %	0 %	410863871
58	NC_019394	ACAAA	2	10	90867	90876	80 %	0 %	0 %	20 %	410863872
59	NC_019394	GAAAA	2	10	95424	95433	80 %	0 %	20 %	0 %	410863874
60	NC_019394	ACCTG	2	10	95665	95674	20 %	20 %	20 %	40 %	410863875
61	NC_019394	TGAAT	2	10	95834	95843	40 %	40 %	20 %	0 %	410863875
62	NC_019394	TTTGC	2	10	96362	96371	0 %	60 %	20 %	20 %	410863876
63	NC_019394	ATGAA	2	10	96824	96833	60 %	20 %	20 %	0 %	410863876
64	NC_019394	AGAGA	2	10	98321	98330	60 %	0 %	40 %	0 %	410863878
65	NC_019394	TTTAA	2	10	101030	101039	40 %	60 %	0 %	0 %	410863881
66	NC_019394	ATTTT	2	10	102066	102075	20 %	80 %	0 %	0 %	410863881
67	NC_019394	TCTCT	2	10	102677	102686	0 %	60 %	0 %	40 %	410863882
68	NC_019394	TATTT	2	10	102914	102923	20 %	80 %	0 %	0 %	410863882
69	NC_019394	TTTTC	2	10	103041	103050	0 %	80 %	0 %	20 %	410863882
70	NC_019394	TCGAT	2	10	103341	103350	20 %	40 %	20 %	20 %	410863882
71	NC_019394	AATAT	2	10	105337	105346	60 %	40 %	0 %	0 %	410863886
72	NC_019394	TCCCC	2	10	116200	116209	0 %	20 %	0 %	80 %	410863899
73	NC_019394	AAATG	2	10	119567	119576	60 %	20 %	20 %	0 %	410863903
74	NC_019394	GCCAT	2	10	124298	124307	20 %	20 %	20 %	40 %	410863908
75	NC_019394	CAGGA	2	10	125219	125228	40 %	0 %	40 %	20 %	410863908
76	NC_019394	TTTGA	2	10	125993	126002	20 %	60 %	20 %	0 %	410863908
77	NC_019394	TTCAT	2	10	129250	129259	20 %	60 %	0 %	20 %	410863909
78	NC_019394	ACTCG	2	10	130271	130280	20 %	20 %	20 %	40 %	410863909
79	NC_019394	TTTTA	2	10	130574	130583	20 %	80 %	0 %	0 %	410863910
80	NC_019394	CTGAA	2	10	138493	138502	40 %	20 %	20 %	20 %	410863914
81	NC_019394	CAACC	2	10	141998	142007	40 %	0 %	0 %	60 %	410863918
82	NC_019394	CAAGT	2	10	143054	143063	40 %	20 %	20 %	20 %	410863918
83	NC_019394	TTAAG	2	10	147335	147344	40 %	40 %	20 %	0 %	410863923
84	NC_019394	ATAAA	2	10	149742	149751	80 %	20 %	0 %	0 %	410863925
85	NC_019394	CATTT	2	10	149782	149791	20 %	60 %	0 %	20 %	410863925
86	NC_019394	GTAGA	2	10	151371	151380	40 %	20 %	40 %	0 %	410863926
87	NC_019394	TGCGC	2	10	154083	154092	0 %	20 %	40 %	40 %	410863931
88	NC_019394	TCAAA	2	10	156152	156161	60 %	20 %	0 %	20 %	410863934
89	NC_019394	ACTGA	2	10	157641	157650	40 %	20 %	20 %	20 %	410863935
90	NC_019394	TCTTT	2	10	157871	157880	0 %	80 %	0 %	20 %	410863935
91	NC_019394	GTTGA	2	10	158635	158644	20 %	40 %	40 %	0 %	410863936
92	NC_019394	ATTGG	2	10	161707	161716	20 %	40 %	40 %	0 %	410863938
93	NC_019394	TCGCC	2	10	165791	165800	0 %	20 %	20 %	60 %	410863939
94	NC_019394	GAATC	2	10	168122	168131	40 %	20 %	20 %	20 %	410863939
95	NC_019394	AGGTT	2	10	171586	171595	20 %	40 %	40 %	0 %	410863940
96	NC_019394	TTTTC	2	10	172279	172288	0 %	80 %	0 %	20 %	410863941
97	NC_019394	TCATT	2	10	172645	172654	20 %	60 %	0 %	20 %	410863941
98	NC_019394	AAATG	2	10	174161	174170	60 %	20 %	20 %	0 %	410863942
99	NC_019394	ATAAA	2	10	174218	174227	80 %	20 %	0 %	0 %	410863942
100	NC_019394	AGCGA	2	10	174819	174828	40 %	0 %	40 %	20 %	410863942
101	NC_019394	TCACT	2	10	175698	175707	20 %	40 %	0 %	40 %	410863942
102	NC_019394	CGCAA	2	10	175841	175850	40 %	0 %	20 %	40 %	410863942
103	NC_019394	TGTGA	2	10	177578	177587	20 %	40 %	40 %	0 %	410863944
104	NC_019394	CTCCC	2	10	183570	183579	0 %	20 %	0 %	80 %	410863946
105	NC_019394	ATCGT	2	10	184405	184414	20 %	40 %	20 %	20 %	410863946
106	NC_019394	ATTTC	2	10	188594	188603	20 %	60 %	0 %	20 %	410863947
107	NC_019394	ATTGG	2	10	189441	189450	20 %	40 %	40 %	0 %	410863948
108	NC_019394	AGCAC	2	10	196887	196896	40 %	0 %	20 %	40 %	410863952
109	NC_019394	TCAAT	2	10	198070	198079	40 %	40 %	0 %	20 %	410863952
110	NC_019394	GGCCT	2	10	199052	199061	0 %	20 %	40 %	40 %	410863952
111	NC_019394	ACCGA	2	10	200715	200724	40 %	0 %	20 %	40 %	410863952
112	NC_019394	TGGGT	2	10	202497	202506	0 %	40 %	60 %	0 %	410863953
113	NC_019394	AAGCA	2	10	203203	203212	60 %	0 %	20 %	20 %	410863953
114	NC_019394	AGACC	2	10	206035	206044	40 %	0 %	20 %	40 %	410863954
115	NC_019394	ATTGT	2	10	210596	210605	20 %	60 %	20 %	0 %	410863954
116	NC_019394	TCCCG	2	10	210609	210618	0 %	20 %	20 %	60 %	410863954
117	NC_019394	ATTGA	2	10	212288	212297	40 %	40 %	20 %	0 %	410863955
118	NC_019394	ATCAA	2	10	213267	213276	60 %	20 %	0 %	20 %	410863956
119	NC_019394	CCCAA	2	10	215241	215250	40 %	0 %	0 %	60 %	410863958
120	NC_019394	AATTG	2	10	218751	218760	40 %	40 %	20 %	0 %	410863958
121	NC_019394	AAGCA	2	10	219515	219524	60 %	0 %	20 %	20 %	410863958
122	NC_019394	GTATT	2	10	219705	219714	20 %	60 %	20 %	0 %	410863958
123	NC_019394	TCACA	2	10	220168	220177	40 %	20 %	0 %	40 %	410863958
124	NC_019394	AGTTA	2	10	224604	224613	40 %	40 %	20 %	0 %	410863960
125	NC_019394	GTGCG	2	10	225778	225787	0 %	20 %	60 %	20 %	410863960
126	NC_019394	AAAGC	2	10	231380	231389	60 %	0 %	20 %	20 %	410863964
127	NC_019394	TCGTT	2	10	234038	234047	0 %	60 %	20 %	20 %	410863966
128	NC_019394	CAAAT	2	10	235650	235659	60 %	20 %	0 %	20 %	410863966
129	NC_019394	CAAAA	2	10	237398	237407	80 %	0 %	0 %	20 %	410863968
130	NC_019394	TTAAA	2	10	238882	238891	60 %	40 %	0 %	0 %	410863969
131	NC_019394	CATCT	2	10	239454	239463	20 %	40 %	0 %	40 %	410863970
132	NC_019394	ACCAA	2	10	239644	239653	60 %	0 %	0 %	40 %	410863970
133	NC_019394	ATTAA	2	10	239674	239683	60 %	40 %	0 %	0 %	410863970
134	NC_019394	GCAGT	2	10	241149	241158	20 %	20 %	40 %	20 %	410863972
135	NC_019394	CAGTG	2	10	242702	242711	20 %	20 %	40 %	20 %	410863975
136	NC_019394	TCAAT	2	10	245682	245691	40 %	40 %	0 %	20 %	410863978
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159	NC_019394	GTGAT	2	10	303098	303107	20 %	40 %	40 %	0 %	410864049

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.