MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	ACT	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019394	TTC	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019394	GTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019394	TCT	2	6	3184	3189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019394	AAT	2	6	3218	3223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019394	CAG	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019394	CTT	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019394	AAC	2	6	5459	5464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019394	ATA	2	6	5499	5504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019394	ACT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019394	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019394	TGC	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019394	ACC	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019394	TTG	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019394	AAT	2	6	6383	6388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019394	GTA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019394	GTT	2	6	7442	7447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019394	TGT	2	6	7460	7465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019394	GAA	2	6	7658	7663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019394	AGG	2	6	8692	8697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019394	TAA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019394	AAC	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019394	TTA	2	6	14529	14534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019394	TTA	2	6	14545	14550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019394	ACC	2	6	14614	14619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019394	AAT	2	6	16767	16772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019394	TCT	2	6	16929	16934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019394	AGG	2	6	16988	16993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019394	GGT	3	9	17206	17214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019394	ATT	2	6	17241	17246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019394	TGG	2	6	17249	17254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019394	TTG	2	6	17255	17260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019394	GCT	2	6	17261	17266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019394	GCT	2	6	17279	17284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019394	AGA	2	6	17347	17352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019394	CAA	2	6	17359	17364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019394	TCA	2	6	17447	17452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019394	AGT	2	6	18340	18345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019394	CCA	2	6	20148	20153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019394	GTG	2	6	20167	20172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019394	TTG	2	6	21257	21262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019394	TGG	2	6	21644	21649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019394	CGA	2	6	23588	23593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019394	ATT	2	6	23640	23645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019394	CTT	2	6	23664	23669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019394	ATT	2	6	24078	24083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019394	AGG	2	6	24137	24142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019394	AAT	2	6	24632	24637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019394	ATC	2	6	25404	25409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019394	TGG	2	6	26993	26998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019394	TTC	2	6	27061	27066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019394	TAA	2	6	28006	28011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019394	GTT	2	6	30051	30056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019394	ATT	2	6	30154	30159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019394	ATT	2	6	30185	30190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019394	AAT	2	6	31008	31013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019394	TTA	2	6	31388	31393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019394	CCA	2	6	31402	31407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019394	AGT	2	6	32220	32225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019394	TTC	2	6	32230	32235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019394	TGG	2	6	32240	32245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019394	TGG	2	6	32271	32276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019394	AAC	2	6	32311	32316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019394	TGG	2	6	32829	32834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019394	TTG	2	6	34125	34130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019394	ACC	2	6	34421	34426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019394	ATT	2	6	35740	35745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019394	ATC	2	6	36404	36409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019394	GTT	2	6	36424	36429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019394	GAG	2	6	36433	36438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019394	TTA	2	6	36454	36459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019394	ACA	2	6	36485	36490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019394	TCC	2	6	36810	36815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019394	TAC	2	6	36870	36875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019394	ATG	2	6	36897	36902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019394	GTC	2	6	37326	37331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019394	GAG	2	6	37379	37384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019394	CTA	2	6	37696	37701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019394	TGC	2	6	37763	37768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019394	AAT	2	6	37771	37776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019394	TTC	2	6	37804	37809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019394	TCT	2	6	38031	38036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019394	GAA	2	6	38126	38131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019394	TTA	2	6	38142	38147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019394	ACT	2	6	38228	38233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019394	GAC	2	6	38755	38760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019394	ACC	2	6	38892	38897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019394	CAC	2	6	38928	38933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019394	GAA	2	6	38968	38973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019394	GAA	2	6	38991	38996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019394	TTA	2	6	40296	40301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019394	TGG	2	6	40595	40600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019394	TTA	2	6	41144	41149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019394	ATT	2	6	41311	41316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019394	TTA	2	6	41404	41409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019394	CTT	2	6	41428	41433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019394	CAG	2	6	41443	41448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019394	AAG	2	6	41467	41472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019394	TTA	2	6	42543	42548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019394	AGC	2	6	42700	42705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019394	GTT	2	6	42759	42764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019394	TGC	2	6	54460	54465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019394	TAA	2	6	54502	54507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019394	ATA	2	6	54508	54513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019394	TCA	2	6	55795	55800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019394	TAA	2	6	56935	56940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019394	GGT	2	6	56953	56958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019394	ATT	2	6	57044	57049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019394	GTT	2	6	57083	57088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019394	ATT	2	6	62908	62913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019394	CAT	2	6	78152	78157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019394	TAA	2	6	78159	78164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019394	GAA	2	6	78726	78731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019394	GAT	2	6	79308	79313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019394	TTA	2	6	94522	94527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019394	CCA	2	6	94572	94577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019394	GTA	2	6	94636	94641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019394	ATA	2	6	94646	94651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019394	CAA	2	6	95538	95543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019394	ACC	2	6	96936	96941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019394	CTA	2	6	96942	96947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019394	TAT	3	9	97008	97016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019394	ATT	2	6	98033	98038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019394	TAG	2	6	98041	98046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019394	TGC	2	6	98756	98761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019394	ACT	2	6	98775	98780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019394	TGA	2	6	98822	98827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019394	AGG	2	6	98835	98840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019394	ATA	2	6	99238	99243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019394	TAT	2	6	99317	99322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019394	AGA	2	6	99332	99337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019394	ATA	2	6	99414	99419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019394	GAC	2	6	99426	99431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019394	TTG	2	6	99433	99438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019394	AGC	2	6	99449	99454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019394	TAA	2	6	99496	99501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019394	GCG	2	6	99522	99527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019394	AAG	2	6	99546	99551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019394	GCG	2	6	99569	99574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019394	TAT	2	6	99716	99721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019394	CAA	2	6	103844	103849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_019394	TCC	2	6	145259	145264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_019394	TAC	2	6	146269	146274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_019394	GAA	2	6	146451	146456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_019394	TTG	2	6	170406	170411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.