MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 378

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	AG	3	6	827	832	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
2	NC_019394	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	410863775
3	NC_019394	GA	3	6	1134	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
4	NC_019394	CG	3	6	2643	2648	0 %	0 %	50 %	50 %	410863778
5	NC_019394	AT	3	6	3333	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	410863780
6	NC_019394	TG	3	6	6025	6030	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
7	NC_019394	GT	3	6	6042	6047	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
8	NC_019394	TA	3	6	6085	6090	50 %	50 %	0 %	0 %	410863786
9	NC_019394	GC	3	6	7901	7906	0 %	0 %	50 %	50 %	410863789
10	NC_019394	TG	3	6	8064	8069	0 %	50 %	50 %	0 %	410863790
11	NC_019394	TC	3	6	8180	8185	0 %	50 %	0 %	50 %	410863790
12	NC_019394	AG	3	6	8297	8302	50 %	0 %	50 %	0 %	410863790
13	NC_019394	AG	3	6	9221	9226	50 %	0 %	50 %	0 %	410863791
14	NC_019394	AG	3	6	9799	9804	50 %	0 %	50 %	0 %	410863791
15	NC_019394	AC	3	6	11213	11218	50 %	0 %	0 %	50 %	410863793
16	NC_019394	TG	3	6	12125	12130	0 %	50 %	50 %	0 %	410863794
17	NC_019394	AG	3	6	14917	14922	50 %	0 %	50 %	0 %	410863797
18	NC_019394	CT	3	6	14958	14963	0 %	50 %	0 %	50 %	410863797
19	NC_019394	AT	3	6	17637	17642	50 %	50 %	0 %	0 %	410863800
20	NC_019394	AG	4	8	17695	17702	50 %	0 %	50 %	0 %	410863801
21	NC_019394	GC	3	6	17723	17728	0 %	0 %	50 %	50 %	410863801
22	NC_019394	AG	3	6	17812	17817	50 %	0 %	50 %	0 %	410863801
23	NC_019394	CA	3	6	17995	18000	50 %	0 %	0 %	50 %	410863801
24	NC_019394	AC	3	6	18091	18096	50 %	0 %	0 %	50 %	410863801
25	NC_019394	AG	3	6	18424	18429	50 %	0 %	50 %	0 %	410863802
26	NC_019394	CA	3	6	18623	18628	50 %	0 %	0 %	50 %	410863802
27	NC_019394	GA	3	6	19188	19193	50 %	0 %	50 %	0 %	410863803
28	NC_019394	AT	3	6	19720	19725	50 %	50 %	0 %	0 %	410863803
29	NC_019394	AG	3	6	20070	20075	50 %	0 %	50 %	0 %	410863803
30	NC_019394	CA	3	6	20212	20217	50 %	0 %	0 %	50 %	410863804
31	NC_019394	CA	3	6	20833	20838	50 %	0 %	0 %	50 %	410863804
32	NC_019394	TC	3	6	22043	22048	0 %	50 %	0 %	50 %	410863806
33	NC_019394	TC	5	10	22365	22374	0 %	50 %	0 %	50 %	410863806
34	NC_019394	TA	3	6	25215	25220	50 %	50 %	0 %	0 %	410863811
35	NC_019394	CT	3	6	27746	27751	0 %	50 %	0 %	50 %	410863816
36	NC_019394	TA	3	6	27782	27787	50 %	50 %	0 %	0 %	410863816
37	NC_019394	AG	3	6	28691	28696	50 %	0 %	50 %	0 %	410863818
38	NC_019394	CT	3	6	29444	29449	0 %	50 %	0 %	50 %	410863820
39	NC_019394	AT	3	6	29510	29515	50 %	50 %	0 %	0 %	410863820
40	NC_019394	AC	3	6	31585	31590	50 %	0 %	0 %	50 %	410863823
41	NC_019394	AC	3	6	33912	33917	50 %	0 %	0 %	50 %	410863827
42	NC_019394	CT	3	6	34610	34615	0 %	50 %	0 %	50 %	410863829
43	NC_019394	AG	3	6	35002	35007	50 %	0 %	50 %	0 %	410863830
44	NC_019394	TC	3	6	35406	35411	0 %	50 %	0 %	50 %	410863830
45	NC_019394	TA	4	8	35972	35979	50 %	50 %	0 %	0 %	410863831
46	NC_019394	TA	4	8	39296	39303	50 %	50 %	0 %	0 %	410863836
47	NC_019394	TC	3	6	40649	40654	0 %	50 %	0 %	50 %	410863837
48	NC_019394	TG	3	6	40725	40730	0 %	50 %	50 %	0 %	410863837
49	NC_019394	AG	3	6	44341	44346	50 %	0 %	50 %	0 %	410863841
50	NC_019394	AT	3	6	44349	44354	50 %	50 %	0 %	0 %	410863841
51	NC_019394	TC	3	6	44806	44811	0 %	50 %	0 %	50 %	410863841
52	NC_019394	GA	3	6	45235	45240	50 %	0 %	50 %	0 %	410863841
53	NC_019394	GA	3	6	45435	45440	50 %	0 %	50 %	0 %	410863842
54	NC_019394	CA	3	6	46200	46205	50 %	0 %	0 %	50 %	410863843
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59	NC_019394	CT	3	6	52661	52666	0 %	50 %	0 %	50 %	410863850
60	NC_019394	CA	3	6	53195	53200	50 %	0 %	0 %	50 %	410863850
61	NC_019394	TC	3	6	53875	53880	0 %	50 %	0 %	50 %	410863851
62	NC_019394	TC	3	6	53966	53971	0 %	50 %	0 %	50 %	410863851
63	NC_019394	CT	3	6	54146	54151	0 %	50 %	0 %	50 %	410863851
64	NC_019394	CT	3	6	56213	56218	0 %	50 %	0 %	50 %	410863853
65	NC_019394	AG	3	6	56481	56486	50 %	0 %	50 %	0 %	410863853
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68	NC_019394	AT	3	6	59001	59006	50 %	50 %	0 %	0 %	410863854
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70	NC_019394	GA	3	6	60719	60724	50 %	0 %	50 %	0 %	410863855
71	NC_019394	TC	3	6	61315	61320	0 %	50 %	0 %	50 %	410863856
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82	NC_019394	AG	3	6	71055	71060	50 %	0 %	50 %	0 %	410863859
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91	NC_019394	GC	3	6	75675	75680	0 %	0 %	50 %	50 %	410863859
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104	NC_019394	TA	3	6	80928	80933	50 %	50 %	0 %	0 %	410863865
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108	NC_019394	AT	3	6	83344	83349	50 %	50 %	0 %	0 %	410863867
109	NC_019394	TA	3	6	86197	86202	50 %	50 %	0 %	0 %	410863867
110	NC_019394	AG	3	6	88109	88114	50 %	0 %	50 %	0 %	410863868
111	NC_019394	AT	3	6	90560	90565	50 %	50 %	0 %	0 %	410863872
112	NC_019394	TA	3	6	91435	91440	50 %	50 %	0 %	0 %	410863872
113	NC_019394	AC	3	6	91788	91793	50 %	0 %	0 %	50 %	410863872
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124	NC_019394	TA	3	6	101232	101237	50 %	50 %	0 %	0 %	410863881
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.