MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 1328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019393	GCAACC	2	12	1768752	1768763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410861204
502	NC_019393	CTTTAT	2	12	1771328	1771339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861208
503	NC_019393	TAAAGG	2	12	1771748	1771759	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861209
504	NC_019393	CTTCAG	2	12	1775236	1775247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861213
505	NC_019393	AAAGAG	2	12	1776643	1776654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410861214
506	NC_019393	GGGATG	2	12	1782208	1782219	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410861219
507	NC_019393	TAAAGG	2	12	1785806	1785817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861221
508	NC_019393	AAGGGG	2	12	1786092	1786103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410861221
509	NC_019393	CAGCGC	2	12	1791537	1791548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410861223
510	NC_019393	AATATT	2	12	1792318	1792329	50 %	50 %	0 %	0 %	410861224
511	NC_019393	TATGAA	2	12	1793025	1793036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410861225
512	NC_019393	CTTTAC	2	12	1794224	1794235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861226
513	NC_019393	AAACAC	2	12	1797686	1797697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410861229
514	NC_019393	GAACAG	2	12	1798661	1798672	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861230
515	NC_019393	TAGGGT	2	12	1801185	1801196	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410861232
516	NC_019393	CTAACG	2	12	1801914	1801925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861234
517	NC_019393	GGGGTA	2	12	1805075	1805086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410861235
518	NC_019393	AAGAGC	2	12	1807977	1807988	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861239
519	NC_019393	TTTTGC	2	12	1811962	1811973	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861243
520	NC_019393	GAAGCG	2	12	1815016	1815027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861247
521	NC_019393	AATGGT	2	12	1815598	1815609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861247
522	NC_019393	GCTTTT	2	12	1816189	1816200	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861248
523	NC_019393	CAAATT	2	12	1817373	1817384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410861249
524	NC_019393	CATCAA	2	12	1823736	1823747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410861253
525	NC_019393	AGGGCC	2	12	1824235	1824246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410861253
526	NC_019393	TGCCGC	2	12	1826683	1826694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410861255
527	NC_019393	TACCGC	2	12	1827744	1827755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861256
528	NC_019393	AACCTG	2	12	1832022	1832033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861261
529	NC_019393	CATTGC	2	12	1833997	1834008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861263
530	NC_019393	TCGCCA	2	12	1834322	1834333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861264
531	NC_019393	GACGCA	2	12	1835612	1835623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410861265
532	NC_019393	AAAGAA	2	12	1841936	1841947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410861271
533	NC_019393	TCCGTT	2	12	1842652	1842663	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861272
534	NC_019393	CGGAAG	2	12	1843728	1843739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861273
535	NC_019393	CTTTCA	2	12	1845356	1845367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861274
536	NC_019393	GCAGGG	2	12	1847459	1847470	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410861277
537	NC_019393	ACGCCC	2	12	1848374	1848385	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410861277
538	NC_019393	CCGTTA	2	12	1851274	1851285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861280
539	NC_019393	CTAGTA	2	12	1855062	1855073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861283
540	NC_019393	TTTTCT	2	12	1856152	1856163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410861284
541	NC_019393	GCTACT	2	12	1856338	1856349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861284
542	NC_019393	AGATCT	2	12	1856383	1856394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861284
543	NC_019393	ATAAAA	2	12	1856853	1856864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410861284
544	NC_019393	AGAAGC	2	12	1867700	1867711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861293
545	NC_019393	GTAGCG	2	12	1869579	1869590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861295
546	NC_019393	CGTTAA	2	12	1869980	1869991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861295
547	NC_019393	CTCGCG	2	12	1879860	1879871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410861303
548	NC_019393	CTCAAT	2	12	1883691	1883702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410861305
549	NC_019393	TAGCGG	2	12	1884324	1884335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861305
550	NC_019393	CCGTAT	2	12	1893729	1893740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861315
551	NC_019393	AAGTAA	2	12	1897197	1897208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410861318
552	NC_019393	TTGATT	2	12	1900493	1900504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410861322
553	NC_019393	GCTTTC	2	12	1905477	1905488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861326
554	NC_019393	TCATTT	2	12	1905864	1905875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861326
555	NC_019393	CAGCAC	2	12	1905919	1905930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410861326
556	NC_019393	AGCGTT	2	12	1911937	1911948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861331
557	NC_019393	CTCTAT	2	12	1912555	1912566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861332
558	NC_019393	TGCTTA	2	12	1912758	1912769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861332
559	NC_019393	CAACTC	2	12	1922019	1922030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410861342
560	NC_019393	GCTTCG	2	12	1924602	1924613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410861346
561	NC_019393	TTTCGC	2	12	1924874	1924885	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861346
562	NC_019393	TGCTTC	2	12	1924988	1924999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861346
563	NC_019393	ATTTGA	2	12	1930773	1930784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861356
564	NC_019393	GCAGAA	2	12	1940424	1940435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861374
565	NC_019393	TAGGTT	2	12	1942039	1942050	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410861378
566	NC_019393	TTGGCG	2	12	1946878	1946889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410861389
567	NC_019393	ATTTAT	2	12	1953313	1953324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410861395
568	NC_019393	CAGCAT	2	12	1956891	1956902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861397
569	NC_019393	AGTGGT	2	12	1957324	1957335	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410861397
570	NC_019393	TAACGT	2	12	1958286	1958297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861397
571	NC_019393	GTATCG	2	12	1960112	1960123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861399
572	NC_019393	TAGGCG	2	12	1960666	1960677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861400
573	NC_019393	TAAGGG	2	12	1962412	1962423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410861400
574	NC_019393	GGGGCA	2	12	1963890	1963901	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410861403
575	NC_019393	TAACGC	2	12	1964625	1964636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861405
576	NC_019393	GCAGCC	2	12	1966191	1966202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410861406
577	NC_019393	GAAATT	2	12	1967191	1967202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410861407
578	NC_019393	GTAAAG	2	12	1968290	1968301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861407
579	NC_019393	CCCTAA	2	12	1969137	1969148	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410861407
580	NC_019393	ACCAAA	2	12	1969750	1969761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410861407
581	NC_019393	AAAGAC	2	12	1972375	1972386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410861407
582	NC_019393	AGCCAT	2	12	1972596	1972607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861407
583	NC_019393	CATTTT	2	12	1976927	1976938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861408
584	NC_019393	GCAATA	2	12	1981004	1981015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410861411
585	NC_019393	TTCATA	2	12	1981441	1981452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410861411
586	NC_019393	GCTCAC	2	12	1982718	1982729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861412
587	NC_019393	CTAACG	2	12	1983140	1983151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861412
588	NC_019393	TAAAGA	2	12	1992925	1992936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410861418
589	NC_019393	TATGGA	2	12	2003567	2003578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861426
590	NC_019393	CATGGC	2	12	2006773	2006784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861429
591	NC_019393	TATCGC	2	12	2006980	2006991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861429
592	NC_019393	GGAAAG	2	12	2014763	2014774	50 %	0 %	50 %	0 %	410861433
593	NC_019393	CGCAAG	2	12	2017433	2017444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410861436
594	NC_019393	CTTACC	2	12	2022990	2023001	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410861441
595	NC_019393	AAAGCC	2	12	2035546	2035557	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410861452
596	NC_019393	ATGGTG	2	12	2035846	2035857	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410861453
597	NC_019393	TGCTAT	2	12	2042800	2042811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861460
598	NC_019393	AAGAGG	2	12	2044776	2044787	50 %	0 %	50 %	0 %	410861460
599	NC_019393	TACCCA	2	12	2047959	2047970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410861464
600	NC_019393	TAGCGT	2	12	2050105	2050116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861466
601	NC_019393	AAGCTT	2	12	2055609	2055620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861469
602	NC_019393	TGCCTA	2	12	2057056	2057067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861471
603	NC_019393	GATATT	2	12	2058865	2058876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861473
604	NC_019393	TTGTTA	2	12	2059802	2059813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410861473
605	NC_019393	TTTGAA	2	12	2068203	2068214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861480
606	NC_019393	CAATAG	2	12	2070660	2070671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410861482
607	NC_019393	AAGATG	2	12	2071434	2071445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861482
608	NC_019393	GATATT	2	12	2073307	2073318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861483
609	NC_019393	AGCGGA	2	12	2077163	2077174	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861486
610	NC_019393	ACGTTA	2	12	2081660	2081671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861489
611	NC_019393	TCTAAA	2	12	2084808	2084819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410861492
612	NC_019393	CTCTTC	2	12	2085284	2085295	0 %	50 %	0 %	50 %	410861492
613	NC_019393	CGTACG	2	12	2095543	2095554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861501
614	NC_019393	CCAAAG	2	12	2096750	2096761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410861502
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616	NC_019393	CGATGG	2	12	2108365	2108376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861512
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621	NC_019393	GTCTTT	2	12	2128939	2128950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861533
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630	NC_019393	GTTACT	2	12	2169812	2169823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861571
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704	NC_019393	TGTTTA	2	12	2401816	2401827	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410861774
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708	NC_019393	AACGCC	2	12	2409246	2409257	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410861777
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710	NC_019393	TTAAAT	2	12	2415494	2415505	50 %	50 %	0 %	0 %	410861781
711	NC_019393	CCTATG	2	12	2417421	2417432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861782
712	NC_019393	TCAACT	2	12	2418833	2418844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410861784
713	NC_019393	ATTTGA	2	12	2420148	2420159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861786
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715	NC_019393	ATTCTC	2	12	2435645	2435656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861798
716	NC_019393	TCCTGT	2	12	2448717	2448728	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861813
717	NC_019393	GCAACA	2	12	2452089	2452100	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410861817
718	NC_019393	AAATCA	2	12	2453664	2453675	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410861819
719	NC_019393	CTATGT	2	12	2460554	2460565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861825
720	NC_019393	TAATTA	2	12	2460577	2460588	50 %	50 %	0 %	0 %	410861825
721	NC_019393	AGTGGA	2	12	2462265	2462276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410861826
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832	NC_019393	AGAAAA	2	12	2877238	2877249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410862181
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