MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 1489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019393	TCACCT	2	12	1595060	1595071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410861067
502	NC_019393	TCAGGC	2	12	1617366	1617377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861089
503	NC_019393	GATAGC	2	12	1619006	1619017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410861090
504	NC_019393	TACTCG	2	12	1620103	1620114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861090
505	NC_019393	GCAGAC	2	12	1624574	1624585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410861094
506	NC_019393	AGCCTG	2	12	1624626	1624637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861094
507	NC_019393	CCTCTA	2	12	1624888	1624899	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410861095
508	NC_019393	GCTTTC	2	12	1633354	1633365	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861104
509	NC_019393	ATGGGA	2	12	1639095	1639106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410861110
510	NC_019393	AAGCTA	2	12	1639332	1639343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410861110
511	NC_019393	CAATAT	2	12	1641071	1641082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410861112
512	NC_019393	AGACAC	2	12	1645266	1645277	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410861114
513	NC_019393	TGGTAT	3	18	1651560	1651577	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410861114
514	NC_019393	ACTGTG	2	12	1658446	1658457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861114
515	NC_019393	TACCCT	2	12	1659342	1659353	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410861114
516	NC_019393	GCATCT	2	12	1662862	1662873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861114
517	NC_019393	TGCTTA	2	12	1667684	1667695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_019393	TGAGCT	2	12	1669242	1669253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861120
519	NC_019393	TTGAAT	2	12	1669550	1669561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861120
520	NC_019393	CAATAG	2	12	1670635	1670646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410861120
521	NC_019393	TAAATA	2	12	1671586	1671597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019393	ACTTCA	2	12	1672310	1672321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410861122
523	NC_019393	CAGAAG	2	12	1686247	1686258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861131
524	NC_019393	GGCAAG	2	12	1689640	1689651	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861133
525	NC_019393	GGTGAA	2	12	1689766	1689777	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410861133
526	NC_019393	CTTTTG	2	12	1691719	1691730	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_019393	AAAACA	2	12	1703419	1703430	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410861141
528	NC_019393	GTTGAA	2	12	1703797	1703808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861141
529	NC_019393	TGAAGC	2	12	1714995	1715006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410861153
530	NC_019393	CGTGGT	2	12	1719456	1719467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410861158
531	NC_019393	TTTAAC	2	12	1722916	1722927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410861162
532	NC_019393	AGTTCA	2	12	1723735	1723746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861163
533	NC_019393	GCGCCA	2	12	1726311	1726322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410861166
534	NC_019393	ACCAAT	2	12	1730830	1730841	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410861169
535	NC_019393	TTCATC	2	12	1732536	1732547	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861172
536	NC_019393	ACCCTA	2	12	1732937	1732948	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410861172
537	NC_019393	AAATCA	2	12	1737257	1737268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410861177
538	NC_019393	CTGGTG	2	12	1739593	1739604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410861179
539	NC_019393	GTTAAT	2	12	1744411	1744422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019393	AGCCAA	2	12	1746590	1746601	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410861187
541	NC_019393	CTATCG	2	12	1749172	1749183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861189
542	NC_019393	GTTGAA	2	12	1749585	1749596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861189
543	NC_019393	CAGCTT	2	12	1750651	1750662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861191
544	NC_019393	TAGGGT	2	12	1750957	1750968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410861192
545	NC_019393	TGTTGG	2	12	1751456	1751467	0 %	50 %	50 %	0 %	410861192
546	NC_019393	TAGTGA	2	12	1751779	1751790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861192
547	NC_019393	CGATGT	2	12	1752197	1752208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861192
548	NC_019393	AGGCTC	2	12	1758989	1759000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861197
549	NC_019393	AGAAAC	2	12	1759155	1759166	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410861197
550	NC_019393	TACGCC	2	12	1759935	1759946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861198
551	NC_019393	CAAAAA	2	12	1760956	1760967	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410861198
552	NC_019393	TGAACT	2	12	1764743	1764754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861200
553	NC_019393	TAGAGT	2	12	1765066	1765077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861200
554	NC_019393	GATTTA	2	12	1765206	1765217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861200
555	NC_019393	TGCGCT	2	12	1767593	1767604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_019393	GCAACC	2	12	1768752	1768763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410861204
557	NC_019393	CTTTAT	2	12	1771328	1771339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861208
558	NC_019393	TAAAGG	2	12	1771748	1771759	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861209
559	NC_019393	CTTCAG	2	12	1775236	1775247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861213
560	NC_019393	AAAGAG	2	12	1776643	1776654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410861214
561	NC_019393	GGGATG	2	12	1782208	1782219	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410861219
562	NC_019393	TAAAGG	2	12	1785806	1785817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861221
563	NC_019393	AAGGGG	2	12	1786092	1786103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410861221
564	NC_019393	CAGCGC	2	12	1791537	1791548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410861223
565	NC_019393	AATATT	2	12	1792318	1792329	50 %	50 %	0 %	0 %	410861224
566	NC_019393	TATGAA	2	12	1793025	1793036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410861225
567	NC_019393	CTTTAC	2	12	1794224	1794235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861226
568	NC_019393	AAACAC	2	12	1797686	1797697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410861229
569	NC_019393	GAACAG	2	12	1798661	1798672	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861230
570	NC_019393	TAGGGT	2	12	1801185	1801196	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410861232
571	NC_019393	CTAACG	2	12	1801914	1801925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861234
572	NC_019393	GGGGTA	2	12	1805075	1805086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410861235
573	NC_019393	AAGAGC	2	12	1807977	1807988	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861239
574	NC_019393	TGCATT	2	12	1810594	1810605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_019393	TTTTGC	2	12	1811962	1811973	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861243
576	NC_019393	GAAGCG	2	12	1815016	1815027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861247
577	NC_019393	AATGGT	2	12	1815598	1815609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861247
578	NC_019393	GCTTTT	2	12	1816189	1816200	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861248
579	NC_019393	CAAATT	2	12	1817373	1817384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410861249
580	NC_019393	CATCAA	2	12	1823736	1823747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410861253
581	NC_019393	AGGGCC	2	12	1824235	1824246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410861253
582	NC_019393	TGCCGC	2	12	1826683	1826694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410861255
583	NC_019393	TACCGC	2	12	1827744	1827755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861256
584	NC_019393	AACCTG	2	12	1832022	1832033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861261
585	NC_019393	CATTGC	2	12	1833997	1834008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861263
586	NC_019393	TCGCCA	2	12	1834322	1834333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410861264
587	NC_019393	GACGCA	2	12	1835612	1835623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410861265
588	NC_019393	TTAAGT	2	12	1838733	1838744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019393	AAAGAA	2	12	1841936	1841947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410861271
590	NC_019393	TCCGTT	2	12	1842652	1842663	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861272
591	NC_019393	CGGAAG	2	12	1843728	1843739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410861273
592	NC_019393	CTTTCA	2	12	1845356	1845367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861274
593	NC_019393	GCAGGG	2	12	1847459	1847470	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410861277
594	NC_019393	ACGCCC	2	12	1848374	1848385	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410861277
595	NC_019393	CCGTTA	2	12	1851274	1851285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861280
596	NC_019393	CTAGTA	2	12	1855062	1855073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861283
597	NC_019393	TTTTCT	2	12	1856152	1856163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410861284
598	NC_019393	GCTACT	2	12	1856338	1856349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861284
599	NC_019393	AGATCT	2	12	1856383	1856394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861284
600	NC_019393	ATAAAA	2	12	1856853	1856864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410861284
601	NC_019393	TATTTG	2	12	1859472	1859483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019393	AGAAGC	2	12	1867700	1867711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861293
603	NC_019393	GTAGCG	2	12	1869579	1869590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861295
604	NC_019393	CGTTAA	2	12	1869980	1869991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861295
605	NC_019393	CTCGCG	2	12	1879860	1879871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410861303
606	NC_019393	CTCAAT	2	12	1883691	1883702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410861305
607	NC_019393	TAGCGG	2	12	1884324	1884335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861305
608	NC_019393	CCGTAT	2	12	1893729	1893740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861315
609	NC_019393	AAGTAA	2	12	1897197	1897208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410861318
610	NC_019393	TTGATT	2	12	1900493	1900504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410861322
611	NC_019393	GCTTTC	2	12	1905477	1905488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861326
612	NC_019393	TCATTT	2	12	1905864	1905875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861326
613	NC_019393	CAGCAC	2	12	1905919	1905930	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410861326
614	NC_019393	ACGTTA	2	12	1909698	1909709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_019393	AGCGTT	2	12	1911937	1911948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861331
616	NC_019393	CTCTAT	2	12	1912555	1912566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410861332
617	NC_019393	TGCTTA	2	12	1912758	1912769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861332
618	NC_019393	CAACTC	2	12	1922019	1922030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410861342
619	NC_019393	GCTTCG	2	12	1924602	1924613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410861346
620	NC_019393	TTTCGC	2	12	1924874	1924885	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861346
621	NC_019393	TGCTTC	2	12	1924988	1924999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410861346
622	NC_019393	ACTTTC	2	12	1926960	1926971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_019393	ATTTGA	2	12	1930773	1930784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861356
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630	NC_019393	TAACGT	2	12	1958286	1958297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410861397
631	NC_019393	GTATCG	2	12	1960112	1960123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861399
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633	NC_019393	TAAGGG	2	12	1962412	1962423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410861400
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638	NC_019393	GTAAAG	2	12	1968290	1968301	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410861407
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640	NC_019393	ACCAAA	2	12	1969750	1969761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410861407
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643	NC_019393	CATTTT	2	12	1976927	1976938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861408
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645	NC_019393	TTCATA	2	12	1981441	1981452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410861411
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650	NC_019393	GCTTTT	2	12	1996062	1996073	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
651	NC_019393	TATGGA	2	12	2003567	2003578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861426
652	NC_019393	GTTGGT	2	12	2003809	2003820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
653	NC_019393	CATGGC	2	12	2006773	2006784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861429
654	NC_019393	TATCGC	2	12	2006980	2006991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410861429
655	NC_019393	GGAAAG	2	12	2014763	2014774	50 %	0 %	50 %	0 %	410861433
656	NC_019393	CGTATT	2	12	2015409	2015420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
657	NC_019393	CGCAAG	2	12	2017433	2017444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410861436
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662	NC_019393	TGCTAT	2	12	2042800	2042811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861460
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670	NC_019393	TTTGAA	2	12	2068203	2068214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410861480
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678	NC_019393	TAGAAA	2	12	2089208	2089219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
679	NC_019393	CGTACG	2	12	2095543	2095554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410861501
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682	NC_019393	TTTCCC	2	12	2103436	2103447	0 %	50 %	0 %	50 %	410861509
683	NC_019393	CGATGG	2	12	2108365	2108376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410861512
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689	NC_019393	GTCTTT	2	12	2128939	2128950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410861533
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701	NC_019393	GTTACT	2	12	2169812	2169823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410861571
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706	NC_019393	TAGACG	2	12	2185962	2185973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410861588
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710	NC_019393	CTTGAG	2	12	2200168	2200179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861599
711	NC_019393	TTTTAA	2	12	2201630	2201641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
712	NC_019393	GCATTG	2	12	2202966	2202977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861602
713	NC_019393	TTTTCA	2	12	2205098	2205109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410861604
714	NC_019393	ACTGGT	2	12	2211736	2211747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410861611
715	NC_019393	GAACGA	2	12	2213072	2213083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861612
716	NC_019393	TGGTAA	2	12	2214867	2214878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410861613
717	NC_019393	AGCTGA	2	12	2217853	2217864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410861616
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719	NC_019393	CGAAAA	2	12	2220814	2220825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410861620
720	NC_019393	TTTATT	2	12	2221331	2221342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410861620
721	NC_019393	GCAAAC	2	12	2231738	2231749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
722	NC_019393	TTTTTA	2	12	2236891	2236902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410861637
723	NC_019393	TAGAAT	2	12	2241208	2241219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410861643
724	NC_019393	TTGTTT	2	12	2244880	2244891	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410861650
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733	NC_019393	GAGCAA	2	12	2256474	2256485	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410861664
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836	NC_019393	AGCTAC	2	12	2559049	2559060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410861916
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947	NC_019393	TACTGC	2	12	2905681	2905692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410862206
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