MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 2434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019393	CTAAC	2	10	3786392	3786401	40 %	20 %	0 %	40 %	410862963
2002	NC_019393	ATTTT	2	10	3794427	3794436	20 %	80 %	0 %	0 %	410862967
2003	NC_019393	TATCG	2	10	3795000	3795009	20 %	40 %	20 %	20 %	410862967
2004	NC_019393	AATCA	2	10	3796787	3796796	60 %	20 %	0 %	20 %	410862970
2005	NC_019393	GAATT	2	10	3801005	3801014	40 %	40 %	20 %	0 %	410862972
2006	NC_019393	TTTAG	2	10	3801934	3801943	20 %	60 %	20 %	0 %	410862972
2007	NC_019393	CTGTG	2	10	3803700	3803709	0 %	40 %	40 %	20 %	410862974
2008	NC_019393	CAATA	2	10	3805549	3805558	60 %	20 %	0 %	20 %	410862975
2009	NC_019393	TTTTC	2	10	3807487	3807496	0 %	80 %	0 %	20 %	410862976
2010	NC_019393	ATGCC	2	10	3809081	3809090	20 %	20 %	20 %	40 %	410862977
2011	NC_019393	ACACT	2	10	3812271	3812280	40 %	20 %	0 %	40 %	410862981
2012	NC_019393	TGTAC	2	10	3813296	3813305	20 %	40 %	20 %	20 %	410862982
2013	NC_019393	CTTCT	2	10	3813455	3813464	0 %	60 %	0 %	40 %	410862982
2014	NC_019393	TTTCA	2	10	3825024	3825033	20 %	60 %	0 %	20 %	410862986
2015	NC_019393	CGATG	2	10	3826656	3826665	20 %	20 %	40 %	20 %	410862987
2016	NC_019393	AGAGA	2	10	3834058	3834067	60 %	0 %	40 %	0 %	410862993
2017	NC_019393	CGCTT	2	10	3838050	3838059	0 %	40 %	20 %	40 %	410862997
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2034	NC_019393	TTTTG	2	10	3871480	3871489	0 %	80 %	20 %	0 %	410863029
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2046	NC_019393	TAGCT	2	10	3900372	3900381	20 %	40 %	20 %	20 %	410863054
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2048	NC_019393	CTACG	2	10	3902213	3902222	20 %	20 %	20 %	40 %	410863057
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2055	NC_019393	CAAAC	2	10	3915625	3915634	60 %	0 %	0 %	40 %	410863073
2056	NC_019393	TACCT	2	10	3916762	3916771	20 %	40 %	0 %	40 %	410863074
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2244	NC_019393	TTTTC	2	10	4265297	4265306	0 %	80 %	0 %	20 %	410863360
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2424	NC_019393	TTCTT	2	10	4629398	4629407	0 %	80 %	0 %	20 %	410863681
2425	NC_019393	CAGGG	2	10	4629550	4629559	20 %	0 %	60 %	20 %	410863682
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2427	NC_019393	AAGAA	2	10	4631508	4631517	80 %	0 %	20 %	0 %	410863685
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2432	NC_019393	ATCTT	2	10	4635987	4635996	20 %	60 %	0 %	20 %	410863690
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.