MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12 plasmid p01DC12

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019392	GGT	2	6	12	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019392	GGT	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019392	GGT	2	6	56	61	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019392	GGT	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019392	CAC	3	9	165	173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858955
6	NC_019392	ATT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
7	NC_019392	AGC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858955
8	NC_019392	TAG	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858955
9	NC_019392	TGT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858955
10	NC_019392	AGC	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858955
11	NC_019392	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
12	NC_019392	GTT	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858955
13	NC_019392	ACA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858955
14	NC_019392	TAT	3	9	858	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
15	NC_019392	TCT	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858955
16	NC_019392	GAT	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019392	ATT	2	6	1135	1140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019392	TAG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858956
19	NC_019392	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858956
20	NC_019392	TTG	2	6	1483	1488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
21	NC_019392	TGT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
22	NC_019392	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858956
23	NC_019392	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858956
24	NC_019392	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858956
25	NC_019392	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858956
26	NC_019392	TGC	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858956
27	NC_019392	TGT	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
28	NC_019392	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858956
29	NC_019392	GTT	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
30	NC_019392	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019392	GAA	3	9	2283	2291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
32	NC_019392	ATT	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858957
33	NC_019392	TGT	3	9	2357	2365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
34	NC_019392	CAC	2	6	2382	2387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858957
35	NC_019392	AGA	2	6	2487	2492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
36	NC_019392	ATC	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858957
37	NC_019392	TTC	2	6	2882	2887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858957
38	NC_019392	TGT	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
39	NC_019392	TGC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858957
40	NC_019392	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858957
41	NC_019392	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
42	NC_019392	TGT	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
43	NC_019392	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858957
44	NC_019392	TAG	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858957
45	NC_019392	CAA	2	6	3583	3588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858957
46	NC_019392	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
47	NC_019392	AGA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
48	NC_019392	AGC	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858958
49	NC_019392	CAA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
50	NC_019392	AAG	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
51	NC_019392	GAA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
52	NC_019392	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
53	NC_019392	TCA	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858958
54	NC_019392	TAG	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858958
55	NC_019392	CAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
56	NC_019392	CAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
57	NC_019392	TTG	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019392	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
59	NC_019392	CAG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858959
60	NC_019392	CCA	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858959
61	NC_019392	AAG	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858959
62	NC_019392	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858959
63	NC_019392	CTG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858959
64	NC_019392	CAT	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858959
65	NC_019392	TCA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858959
66	NC_019392	ACA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
67	NC_019392	TGG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858959
68	NC_019392	GTG	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858959
69	NC_019392	ACA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
70	NC_019392	TAA	2	6	5529	5534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858959
71	NC_019392	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858960
72	NC_019392	GGT	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858961
73	NC_019392	AAC	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
74	NC_019392	GTA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
75	NC_019392	GAT	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
76	NC_019392	AGA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
77	NC_019392	AGA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
78	NC_019392	ATG	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
79	NC_019392	CCT	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410858961
80	NC_019392	AAG	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
81	NC_019392	CAA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
82	NC_019392	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
83	NC_019392	CAG	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858961
84	NC_019392	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858961
85	NC_019392	ATC	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858961
86	NC_019392	TAA	2	6	6635	6640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858961
87	NC_019392	AGC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858961
88	NC_019392	TGA	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
89	NC_019392	AAG	2	6	6757	6762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858962
90	NC_019392	TAG	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858962
91	NC_019392	GAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858962
92	NC_019392	ACA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858962
93	NC_019392	ACA	2	6	7050	7055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858962
94	NC_019392	CCT	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410858962
95	NC_019392	TCT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858962
96	NC_019392	TCT	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858962
97	NC_019392	CAG	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019392	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.