MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	ATTTAA	2	12	33592	33603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019391	ATTATA	2	12	77755	77766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019391	TTTCTT	2	12	123033	123044	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019391	ATAGGC	2	12	146927	146938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019391	TTCCGT	2	12	148022	148033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019391	AGAAAA	2	12	163057	163068	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019391	TTTTTA	2	12	210486	210497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019391	TAAAGA	2	12	226843	226854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019391	ATTATA	2	12	239714	239725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019391	TTGAAT	2	12	244027	244038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019391	ATATAA	2	12	261779	261790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019391	GGGAAA	2	12	267746	267757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019391	TAAGAA	2	12	277665	277676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019391	TGAAAA	2	12	336804	336815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019391	ATTTTT	2	12	371207	371218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019391	AAAATC	2	12	396214	396225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019391	GACTGT	2	12	424624	424635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019391	AAAAAT	2	12	470169	470180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019391	TATAAT	2	12	489517	489528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019391	TTAATT	2	12	507219	507230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019391	GCCATA	2	12	645768	645779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019391	CTTTTG	2	12	655956	655967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019391	AAATAC	2	12	661513	661524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019391	CAATCT	2	12	662099	662110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019391	TTAGGG	2	12	662461	662472	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019391	AAGGGA	2	12	703197	703208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019391	ATTAAT	2	12	705887	705898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019391	TCATAA	2	12	727870	727881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019391	TAACTG	2	12	728190	728201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019391	GGAAAA	2	12	728640	728651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019391	TAAAAG	2	12	739451	739462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019391	ATTTTA	2	12	752142	752153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019391	TAACCT	2	12	793526	793537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019391	CTATGT	2	12	813813	813824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019391	ATTTTA	2	12	950163	950174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019391	ATCTAT	2	12	965455	965466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019391	ATAAAA	2	12	981903	981914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019391	TGAGAA	2	12	994753	994764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019391	TTTTCT	2	12	1012842	1012853	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019391	AAATAA	2	12	1018065	1018076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019391	TCGCTT	2	12	1020924	1020935	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019391	TTATCC	2	12	1021827	1021838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019391	AAATTT	2	12	1023960	1023971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019391	CTTTGT	2	12	1035403	1035414	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019391	TAATTT	2	12	1102307	1102318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019391	AAAATA	2	12	1140805	1140816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019391	TACAGA	2	12	1153483	1153494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019391	GTTAAA	2	12	1166409	1166420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019391	CCTTCG	2	12	1169197	1169208	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.