MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	410857992
2	NC_019391	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	410857992
3	NC_019391	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019391	AACAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	410857994
5	NC_019391	AAGAA	2	10	9570	9579	80 %	0 %	20 %	0 %	410857995
6	NC_019391	ATAAA	2	10	13045	13054	80 %	20 %	0 %	0 %	410857996
7	NC_019391	AACTC	2	10	13489	13498	40 %	20 %	0 %	40 %	410857996
8	NC_019391	GTTTT	2	10	13559	13568	0 %	80 %	20 %	0 %	410857996
9	NC_019391	GAAAC	2	10	14327	14336	60 %	0 %	20 %	20 %	410857997
10	NC_019391	AACAA	2	10	15356	15365	80 %	0 %	0 %	20 %	410857997
11	NC_019391	AATAG	2	10	17068	17077	60 %	20 %	20 %	0 %	410857999
12	NC_019391	GCCGT	2	10	18926	18935	0 %	20 %	40 %	40 %	410858001
13	NC_019391	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	410858001
14	NC_019391	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	410858002
15	NC_019391	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	410858006
16	NC_019391	ATAAA	2	10	34281	34290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019391	AAGGA	2	10	38573	38582	60 %	0 %	40 %	0 %	410858016
18	NC_019391	CCATA	2	10	38780	38789	40 %	20 %	0 %	40 %	410858016
19	NC_019391	CTTTA	2	10	38946	38955	20 %	60 %	0 %	20 %	410858016
20	NC_019391	CTTTC	2	10	43209	43218	0 %	60 %	0 %	40 %	410858022
21	NC_019391	ACAAA	2	10	43871	43880	80 %	0 %	0 %	20 %	410858023
22	NC_019391	TATGG	2	10	44281	44290	20 %	40 %	40 %	0 %	410858024
23	NC_019391	TCTTT	2	10	46090	46099	0 %	80 %	0 %	20 %	410858026
24	NC_019391	AGCCC	2	10	47087	47096	20 %	0 %	20 %	60 %	410858027
25	NC_019391	TCAAA	2	10	47442	47451	60 %	20 %	0 %	20 %	410858027
26	NC_019391	TCTAT	2	10	49561	49570	20 %	60 %	0 %	20 %	410858029
27	NC_019391	TTTGG	2	10	51475	51484	0 %	60 %	40 %	0 %	410858029
28	NC_019391	TTTTG	2	10	52484	52493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019391	TTTTC	2	10	55344	55353	0 %	80 %	0 %	20 %	410858032
30	NC_019391	GTAAG	2	10	57392	57401	40 %	20 %	40 %	0 %	410858035
31	NC_019391	TTAAT	2	10	57964	57973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019391	TCTTT	2	10	59408	59417	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019391	AAAAT	2	10	60214	60223	80 %	20 %	0 %	0 %	410858037
34	NC_019391	TAGTT	2	10	62816	62825	20 %	60 %	20 %	0 %	410858037
35	NC_019391	GAATG	2	10	62832	62841	40 %	20 %	40 %	0 %	410858037
36	NC_019391	TCCTA	2	10	64881	64890	20 %	40 %	0 %	40 %	410858039
37	NC_019391	AGAAA	2	10	70137	70146	80 %	0 %	20 %	0 %	410858043
38	NC_019391	GGATA	2	10	70945	70954	40 %	20 %	40 %	0 %	410858044
39	NC_019391	CACTT	2	10	71128	71137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019391	ATAGC	2	10	74384	74393	40 %	20 %	20 %	20 %	410858048
41	NC_019391	GCACA	2	10	77217	77226	40 %	0 %	20 %	40 %	410858050
42	NC_019391	AATTT	2	10	77741	77750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019391	AAAGA	2	10	78170	78179	80 %	0 %	20 %	0 %	410858051
44	NC_019391	AGTTC	2	10	79175	79184	20 %	40 %	20 %	20 %	410858051
45	NC_019391	CGTAT	2	10	81547	81556	20 %	40 %	20 %	20 %	410858053
46	NC_019391	GAAAA	2	10	82757	82766	80 %	0 %	20 %	0 %	410858054
47	NC_019391	AGGAA	2	10	84756	84765	60 %	0 %	40 %	0 %	410858056
48	NC_019391	CTTTT	2	10	85645	85654	0 %	80 %	0 %	20 %	410858058
49	NC_019391	CAAAG	2	10	87116	87125	60 %	0 %	20 %	20 %	410858060
50	NC_019391	AACAA	2	10	87283	87292	80 %	0 %	0 %	20 %	410858060
51	NC_019391	AGAAA	2	10	87353	87362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019391	AAAGA	2	10	89189	89198	80 %	0 %	20 %	0 %	410858062
53	NC_019391	TTTTC	2	10	90204	90213	0 %	80 %	0 %	20 %	410858062
54	NC_019391	AGGAT	2	10	90727	90736	40 %	20 %	40 %	0 %	410858062
55	NC_019391	ATAAC	2	10	90813	90822	60 %	20 %	0 %	20 %	410858062
56	NC_019391	TGGCA	2	10	93298	93307	20 %	20 %	40 %	20 %	410858063
57	NC_019391	AATTA	2	10	93962	93971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019391	TGTTT	2	10	95023	95032	0 %	80 %	20 %	0 %	410858065
59	NC_019391	TCACC	2	10	96597	96606	20 %	20 %	0 %	60 %	410858066
60	NC_019391	AAAAT	2	10	96732	96741	80 %	20 %	0 %	0 %	410858066
61	NC_019391	TTAAT	2	10	97776	97785	40 %	60 %	0 %	0 %	410858067
62	NC_019391	ATTTG	2	10	98959	98968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019391	AAAAT	2	10	99680	99689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019391	ATTAC	2	10	102908	102917	40 %	40 %	0 %	20 %	410858074
65	NC_019391	CTACA	2	10	103282	103291	40 %	20 %	0 %	40 %	410858074
66	NC_019391	AATTA	2	10	104829	104838	60 %	40 %	0 %	0 %	410858076
67	NC_019391	CTATA	2	10	105819	105828	40 %	40 %	0 %	20 %	410858077
68	NC_019391	CTTTT	2	10	108361	108370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019391	AGCTT	2	10	108472	108481	20 %	40 %	20 %	20 %	410858080
70	NC_019391	GTTTG	2	10	108779	108788	0 %	60 %	40 %	0 %	410858080
71	NC_019391	AGTTA	2	10	115584	115593	40 %	40 %	20 %	0 %	410858095
72	NC_019391	AGTTT	2	10	116074	116083	20 %	60 %	20 %	0 %	410858096
73	NC_019391	TTTAC	2	10	119186	119195	20 %	60 %	0 %	20 %	410858101
74	NC_019391	AATTA	2	10	122079	122088	60 %	40 %	0 %	0 %	410858104
75	NC_019391	CTTTT	2	10	122875	122884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019391	AGATG	2	10	123432	123441	40 %	20 %	40 %	0 %	410858105
77	NC_019391	GTCAA	2	10	124750	124759	40 %	20 %	20 %	20 %	410858107
78	NC_019391	TAGGG	2	10	127222	127231	20 %	20 %	60 %	0 %	410858110
79	NC_019391	AACTT	2	10	128154	128163	40 %	40 %	0 %	20 %	410858110
80	NC_019391	TTCTT	2	10	131358	131367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019391	TGTCA	2	10	132039	132048	20 %	40 %	20 %	20 %	410858113
82	NC_019391	AAAAG	2	10	135445	135454	80 %	0 %	20 %	0 %	410858115
83	NC_019391	TAAAA	2	10	135726	135735	80 %	20 %	0 %	0 %	410858115
84	NC_019391	GATTT	2	10	137985	137994	20 %	60 %	20 %	0 %	410858117
85	NC_019391	TTGTT	2	10	138327	138336	0 %	80 %	20 %	0 %	410858117
86	NC_019391	AAGAA	2	10	138808	138817	80 %	0 %	20 %	0 %	410858117
87	NC_019391	TTCTT	2	10	139401	139410	0 %	80 %	0 %	20 %	410858118
88	NC_019391	CTTTG	2	10	141305	141314	0 %	60 %	20 %	20 %	410858120
89	NC_019391	AGAAA	2	10	143342	143351	80 %	0 %	20 %	0 %	410858123
90	NC_019391	AAAGA	2	10	146007	146016	80 %	0 %	20 %	0 %	410858125
91	NC_019391	TTTTA	2	10	148186	148195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019391	TACTC	2	10	149638	149647	20 %	40 %	0 %	40 %	410858128
93	NC_019391	CGTTT	2	10	149685	149694	0 %	60 %	20 %	20 %	410858128
94	NC_019391	ATTTT	2	10	149825	149834	20 %	80 %	0 %	0 %	410858128
95	NC_019391	ACCAT	2	10	151856	151865	40 %	20 %	0 %	40 %	410858129
96	NC_019391	CAGAA	2	10	152821	152830	60 %	0 %	20 %	20 %	410858130
97	NC_019391	TTCAT	2	10	153391	153400	20 %	60 %	0 %	20 %	410858130
98	NC_019391	AAAGG	2	10	154221	154230	60 %	0 %	40 %	0 %	410858131
99	NC_019391	ATAGG	2	10	155913	155922	40 %	20 %	40 %	0 %	410858133
100	NC_019391	TTTGA	2	10	155999	156008	20 %	60 %	20 %	0 %	410858133
101	NC_019391	AAGGT	2	10	160940	160949	40 %	20 %	40 %	0 %	410858137
102	NC_019391	TTTTG	2	10	161879	161888	0 %	80 %	20 %	0 %	410858139
103	NC_019391	GGGGC	2	10	162026	162035	0 %	0 %	80 %	20 %	410858139
104	NC_019391	AAATG	2	10	166433	166442	60 %	20 %	20 %	0 %	410858142
105	NC_019391	GGGGA	2	10	168208	168217	20 %	0 %	80 %	0 %	410858143
106	NC_019391	TTTTC	2	10	169257	169266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019391	CTGTT	2	10	169736	169745	0 %	60 %	20 %	20 %	410858145
108	NC_019391	AATGA	2	10	169771	169780	60 %	20 %	20 %	0 %	410858145
109	NC_019391	ATTTT	2	10	173230	173239	20 %	80 %	0 %	0 %	410858150
110	NC_019391	GAGAG	2	10	173247	173256	40 %	0 %	60 %	0 %	410858150
111	NC_019391	CAAAA	2	10	173577	173586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019391	CGCAT	2	10	173947	173956	20 %	20 %	20 %	40 %	410858151
113	NC_019391	CTAAG	2	10	181195	181204	40 %	20 %	20 %	20 %	410858157
114	NC_019391	TTTTC	2	10	181795	181804	0 %	80 %	0 %	20 %	410858157
115	NC_019391	GGTAC	2	10	183790	183799	20 %	20 %	40 %	20 %	410858159
116	NC_019391	AGGGA	2	10	186977	186986	40 %	0 %	60 %	0 %	410858162
117	NC_019391	AATGT	2	10	187386	187395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019391	AGGAA	2	10	188000	188009	60 %	0 %	40 %	0 %	410858163
119	NC_019391	TTCTT	2	10	188379	188388	0 %	80 %	0 %	20 %	410858163
120	NC_019391	GATAA	2	10	191022	191031	60 %	20 %	20 %	0 %	410858163
121	NC_019391	CCCTT	2	10	193226	193235	0 %	40 %	0 %	60 %	410858164
122	NC_019391	TTTTA	2	10	193927	193936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019391	TTTAT	2	10	193994	194003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019391	AGTTA	2	10	194217	194226	40 %	40 %	20 %	0 %	410858165
125	NC_019391	TTATT	2	10	194237	194246	20 %	80 %	0 %	0 %	410858165
126	NC_019391	CCCTA	2	10	195290	195299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_019391	AGGGT	2	10	197161	197170	20 %	20 %	60 %	0 %	410858167
128	NC_019391	TGGAT	2	10	197602	197611	20 %	40 %	40 %	0 %	410858167
129	NC_019391	CTAAA	2	10	197659	197668	60 %	20 %	0 %	20 %	410858167
130	NC_019391	CTTTA	2	10	197962	197971	20 %	60 %	0 %	20 %	410858167
131	NC_019391	AAAAT	2	10	198139	198148	80 %	20 %	0 %	0 %	410858167
132	NC_019391	GTTTT	2	10	198641	198650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019391	ATTAA	2	10	201065	201074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019391	TTGGT	2	10	201441	201450	0 %	60 %	40 %	0 %	410858170
135	NC_019391	AGCAA	2	10	203918	203927	60 %	0 %	20 %	20 %	410858172
136	NC_019391	ATGTG	2	10	204304	204313	20 %	40 %	40 %	0 %	410858173
137	NC_019391	TAATG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	410858173
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