MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019391	ATAAA	2	10	34281	34290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019391	TTTTG	2	10	52484	52493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019391	TTAAT	2	10	57964	57973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019391	TCTTT	2	10	59408	59417	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019391	CACTT	2	10	71128	71137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019391	AATTT	2	10	77741	77750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019391	AGAAA	2	10	87353	87362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019391	AATTA	2	10	93962	93971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019391	ATTTG	2	10	98959	98968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019391	AAAAT	2	10	99680	99689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019391	CTTTT	2	10	108361	108370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019391	CTTTT	2	10	122875	122884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019391	TTCTT	2	10	131358	131367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019391	TTTTA	2	10	148186	148195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019391	TTTTC	2	10	169257	169266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019391	CAAAA	2	10	173577	173586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019391	AATGT	2	10	187386	187395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019391	TTTTA	2	10	193927	193936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019391	TTTAT	2	10	193994	194003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019391	CCCTA	2	10	195290	195299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019391	GTTTT	2	10	198641	198650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019391	ATTAA	2	10	201065	201074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019391	ATAAA	2	10	225901	225910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019391	ATTTT	2	10	226758	226767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019391	TAAAA	2	10	240131	240140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019391	TTTAA	2	10	255893	255902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019391	AAGAT	2	10	255967	255976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019391	GAAGA	2	10	267661	267670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019391	TAAAA	2	10	274676	274685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019391	CAGGA	2	10	277155	277164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019391	ATTTT	2	10	289544	289553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019391	AAAGG	2	10	301265	301274	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019391	ATAGG	2	10	307468	307477	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019391	TATTT	2	10	309000	309009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019391	ATGGT	2	10	309049	309058	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019391	CATAG	2	10	310209	310218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019391	CCTAC	2	10	321651	321660	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_019391	TGAAA	2	10	332497	332506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019391	ATTAT	2	10	342010	342019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019391	CTTTT	2	10	342892	342901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019391	TCTTG	2	10	348814	348823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019391	AATAA	2	10	350707	350716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019391	TGAAA	2	10	351936	351945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019391	GTATT	2	10	363069	363078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019391	GAATA	2	10	371147	371156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019391	CACTA	2	10	389798	389807	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019391	GTTTC	2	10	390897	390906	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019391	TTTAA	2	10	397043	397052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019391	AAGAG	2	10	427494	427503	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019391	GCTTC	2	10	455224	455233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_019391	ATAGA	2	10	463220	463229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019391	ATGTA	2	10	470109	470118	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019391	TAAAT	2	10	476752	476761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019391	AACTT	2	10	476765	476774	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019391	TGAGA	2	10	476873	476882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019391	GCAAA	2	10	480914	480923	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019391	AAATA	2	10	483322	483331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019391	TTTAC	2	10	493316	493325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019391	AAAAT	2	10	493373	493382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019391	AATCT	2	10	504163	504172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019391	TAGGG	2	10	504288	504297	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019391	TAAAA	2	10	548662	548671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019391	TTTCT	2	10	559252	559261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019391	AAATA	3	15	559265	559279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019391	TTATT	2	10	570557	570566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019391	ATTAA	2	10	570595	570604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019391	ATATA	2	10	585019	585028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019391	ACAAA	2	10	586277	586286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019391	CAATA	2	10	591882	591891	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019391	AATTA	2	10	592753	592762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019391	ATTTT	2	10	596688	596697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019391	ATTTA	2	10	597001	597010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019391	ATTTT	2	10	600871	600880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019391	TATCC	2	10	622327	622336	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019391	CAAAA	2	10	627929	627938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019391	CATTA	2	10	629659	629668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019391	AGGGG	2	10	630161	630170	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019391	ACTTC	2	10	645437	645446	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019391	AAATC	2	10	647567	647576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019391	CTCTT	2	10	648090	648099	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_019391	ATCAA	2	10	653840	653849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019391	TTTTA	2	10	656830	656839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019391	GTATT	2	10	657579	657588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019391	ATTCT	2	10	660658	660667	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019391	TTCCG	2	10	662224	662233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019391	GAGTA	2	10	662883	662892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019391	AAGAG	2	10	663047	663056	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019391	TCTTA	2	10	664195	664204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019391	AAATA	2	10	664226	664235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019391	CTAAG	2	10	667201	667210	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019391	AAAAT	2	10	669070	669079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019391	TTAAT	2	10	669087	669096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019391	TAAAA	2	10	675481	675490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019391	TAAAA	2	10	691793	691802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019391	AAGCA	2	10	704739	704748	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019391	CTTTG	2	10	710684	710693	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019391	GTCTT	2	10	710865	710874	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019391	TAACC	2	10	711130	711139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019391	CAGAG	2	10	726082	726091	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019391	CAATT	2	10	728139	728148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019391	GCAAA	2	10	729373	729382	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019391	GGCCT	2	10	758006	758015	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_019391	AATCA	2	10	759988	759997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019391	GAAAA	2	10	801633	801642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019391	AGCTA	2	10	804774	804783	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019391	TTTAC	2	10	806697	806706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019391	AAGAA	2	10	809391	809400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019391	TCTTT	2	10	834422	834431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019391	ATTTT	2	10	844382	844391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019391	AGAAC	2	10	854855	854864	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019391	TAAAA	2	10	864290	864299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019391	AAAAG	2	10	866004	866013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019391	TCAAA	2	10	867570	867579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019391	TTTCA	2	10	870151	870160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019391	TAAAA	2	10	873010	873019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019391	AAAAG	2	10	880960	880969	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019391	TTTTC	2	10	884097	884106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019391	AAGTT	2	10	893856	893865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019391	TCTAT	2	10	919527	919536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019391	AAAAG	2	10	919607	919616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019391	TTAAA	2	10	932552	932561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019391	TTCTT	2	10	945773	945782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019391	CTAAT	2	10	953304	953313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019391	ACTAG	2	10	953363	953372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019391	ACATC	2	10	981457	981466	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019391	AATTT	2	10	983138	983147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019391	TCTTT	2	10	994606	994615	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019391	TATTG	2	10	994801	994810	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019391	TAAAT	2	10	1012160	1012169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019391	AACCT	2	10	1020044	1020053	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_019391	TAACT	2	10	1020971	1020980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019391	ACATA	2	10	1021710	1021719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019391	CTTTC	2	10	1022789	1022798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_019391	CTTCT	2	10	1023888	1023897	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_019391	TTAAA	2	10	1030842	1030851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019391	AACAA	2	10	1031055	1031064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019391	TAAAA	2	10	1055655	1055664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019391	AGCCC	2	10	1069279	1069288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019391	TTAAT	2	10	1072217	1072226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019391	AAAAG	2	10	1153561	1153570	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.