MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019391	TAAT	2	8	6731	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019391	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019391	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019391	TTTC	2	8	17681	17688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019391	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019391	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019391	TTTC	2	8	31652	31659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019391	GCAG	2	8	32008	32015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019391	TCTA	2	8	32056	32063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019391	AATT	2	8	32380	32387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019391	TTAA	2	8	32420	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019391	TTAA	2	8	33510	33517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019391	AGAT	2	8	33553	33560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019391	TCAA	2	8	37775	37782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019391	AAAG	2	8	52608	52615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019391	TTTA	2	8	52618	52625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019391	GAAG	2	8	52721	52728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019391	AAAG	2	8	54786	54793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019391	GTTT	2	8	59892	59899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019391	TATG	2	8	59907	59914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019391	CTTT	2	8	64566	64573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019391	GATA	2	8	70214	70221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019391	TAAT	2	8	77659	77666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019391	TATT	2	8	77676	77683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019391	TTAA	2	8	77685	77692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019391	TAAA	2	8	77716	77723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019391	ATTA	2	8	77733	77740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019391	TAAA	2	8	80500	80507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019391	AAAG	2	8	83480	83487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019391	CAAG	2	8	84837	84844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019391	TTTA	2	8	87393	87400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019391	ATAA	2	8	87448	87455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019391	ATGT	2	8	93630	93637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019391	ATAC	2	8	99188	99195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019391	AACA	2	8	99359	99366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019391	TGAT	2	8	99627	99634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019391	TTAA	2	8	107108	107115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019391	ATTT	2	8	122753	122760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019391	AAAG	2	8	122928	122935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019391	TAAT	2	8	123097	123104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019391	TTAA	2	8	128512	128519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019391	CTGG	2	8	128663	128670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019391	TTTA	2	8	128689	128696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019391	TGAT	2	8	139120	139127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019391	TAGT	2	8	140248	140255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019391	TTAT	2	8	146089	146096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019391	TTTA	2	8	147419	147426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019391	AATA	2	8	147474	147481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019391	ATTT	3	12	147532	147543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019391	AAAG	2	8	148629	148636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019391	TAAA	2	8	164510	164517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019391	AAAT	2	8	164568	164575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019391	ACTT	2	8	164621	164628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019391	TAGT	2	8	170080	170087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019391	AAGA	2	8	173677	173684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019391	TAAA	2	8	179362	179369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019391	TTTA	2	8	179422	179429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019391	AACT	2	8	179438	179445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019391	AGGG	2	8	185866	185873	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019391	AACA	2	8	185979	185986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019391	GATT	2	8	187305	187312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019391	AGAT	2	8	191792	191799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019391	GTTT	2	8	193725	193732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019391	TATT	2	8	195451	195458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019391	TAAA	3	12	195482	195493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019391	GTTT	2	8	196532	196539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019391	CACT	2	8	198180	198187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019391	GCTT	2	8	198274	198281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019391	CTTT	2	8	198434	198441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019391	ATTA	2	8	198451	198458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019391	CTTT	2	8	198608	198615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019391	AATC	2	8	198616	198623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019391	ATTA	2	8	198753	198760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019391	TAAT	2	8	201081	201088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019391	TAAA	2	8	204094	204101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019391	CAAA	2	8	205217	205224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019391	TTTA	2	8	205663	205670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019391	GATT	2	8	210703	210710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019391	AAAG	2	8	210755	210762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019391	CTAA	2	8	210913	210920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019391	GTTT	2	8	211875	211882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019391	AAGA	2	8	222932	222939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019391	AACA	2	8	226750	226757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019391	ATTA	2	8	232255	232262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019391	CTTG	2	8	238181	238188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019391	GAAT	2	8	238232	238239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019391	AATT	2	8	238371	238378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019391	TTTC	2	8	238471	238478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019391	GTTT	2	8	240903	240910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019391	TCAT	2	8	241133	241140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019391	AGGA	2	8	244063	244070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019391	GTTT	2	8	247706	247713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019391	TAAA	2	8	263033	263040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019391	GTTC	2	8	266720	266727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019391	TAAT	2	8	266823	266830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019391	AATT	2	8	266838	266845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019391	TAAT	2	8	267915	267922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019391	TAAA	2	8	268029	268036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019391	TTGT	2	8	274657	274664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019391	AAAT	2	8	276702	276709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019391	CTAT	2	8	276829	276836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019391	TTTC	2	8	277413	277420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019391	TACT	2	8	280853	280860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019391	AATT	2	8	280874	280881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019391	TGTA	2	8	280917	280924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019391	GTTT	2	8	281826	281833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019391	ATTT	2	8	289480	289487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019391	TAAT	3	12	289527	289538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019391	TAGA	2	8	291364	291371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019391	TATT	2	8	291398	291405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019391	TATT	2	8	291447	291454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019391	AATG	2	8	299548	299555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019391	GTTT	2	8	299697	299704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019391	TGTT	2	8	301014	301021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019391	ATTG	2	8	301102	301109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019391	TTGA	2	8	301173	301180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019391	GATT	2	8	307429	307436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019391	GAAA	2	8	307561	307568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019391	CTAC	2	8	307629	307636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019391	AAAG	2	8	307941	307948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019391	GTTT	2	8	308424	308431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019391	TGAT	2	8	309312	309319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019391	ATAG	2	8	309636	309643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019391	GGGA	2	8	310296	310303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019391	AGGA	2	8	318933	318940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019391	AAAG	2	8	332538	332545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019391	CAGA	2	8	342834	342841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019391	TGAT	2	8	342860	342867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019391	TATT	2	8	345046	345053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019391	ATAA	2	8	348868	348875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019391	TCTT	2	8	349633	349640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019391	ATTT	2	8	354182	354189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019391	TAGT	2	8	354237	354244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019391	ATAC	2	8	356446	356453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019391	TTTG	2	8	361738	361745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019391	AGAA	2	8	361862	361869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019391	GCTT	2	8	363086	363093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019391	TTAA	2	8	371995	372002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019391	ATCT	2	8	375011	375018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019391	AACT	2	8	375855	375862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019391	TAAT	2	8	389540	389547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019391	AAGA	2	8	389575	389582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019391	ATTA	2	8	389600	389607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019391	AAAC	2	8	390912	390919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019391	GTTT	2	8	401257	401264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019391	TAAT	2	8	401298	401305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019391	AAAG	2	8	404288	404295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019391	ATTA	2	8	417522	417529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019391	CAAT	2	8	420173	420180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_019391	AATA	2	8	421347	421354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.