MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 1462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019391	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019391	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019391	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019391	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019391	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019391	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019391	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019391	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019391	GAA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019391	AAT	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019391	TTA	2	6	16930	16935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019391	AAT	2	6	17008	17013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019391	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019391	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019391	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019391	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019391	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019391	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019391	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019391	TTC	2	6	23767	23772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019391	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019391	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019391	TAT	2	6	26613	26618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019391	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019391	AGG	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019391	AGA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019391	CTT	2	6	31984	31989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019391	AAT	2	6	32409	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019391	TTA	2	6	33430	33435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019391	AAG	2	6	33451	33456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019391	TGT	3	9	33524	33532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019391	AAG	2	6	33569	33574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019391	TGG	2	6	34226	34231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019391	TTC	2	6	37585	37590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019391	TTC	2	6	37626	37631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019391	TGC	2	6	37674	37679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019391	AGA	2	6	37864	37869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019391	TAT	2	6	38099	38104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019391	GAA	2	6	39475	39480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019391	TTA	2	6	42381	42386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019391	GAA	2	6	42403	42408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019391	GTT	2	6	43444	43449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019391	GAT	2	6	52227	52232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019391	TCG	2	6	52294	52299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019391	TTG	2	6	52309	52314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019391	GTC	2	6	52413	52418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019391	AAG	2	6	52513	52518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019391	CCT	2	6	52731	52736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019391	TGC	2	6	52809	52814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019391	CCT	2	6	52815	52820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019391	TGC	2	6	52821	52826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019391	AGG	2	6	52840	52845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019391	AAT	2	6	54529	54534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019391	TGG	2	6	57860	57865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019391	GGT	2	6	58089	58094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019391	GGC	2	6	59447	59452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019391	GAG	2	6	59506	59511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019391	ATT	2	6	59555	59560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019391	TTA	2	6	59582	59587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019391	TAA	2	6	59656	59661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019391	AGA	2	6	59732	59737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019391	CTA	2	6	59971	59976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019391	CAA	2	6	63295	63300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019391	TTG	2	6	64376	64381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019391	GAA	2	6	64403	64408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019391	TCC	2	6	64488	64493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019391	AAT	2	6	64634	64639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019391	GTC	2	6	70288	70293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019391	AGA	2	6	70332	70337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019391	ATA	2	6	71236	71241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019391	TTA	3	9	74088	74096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019391	ATC	2	6	76085	76090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019391	TCA	2	6	77410	77415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019391	TTC	2	6	77487	77492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019391	TAT	2	6	77519	77524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019391	TAT	2	6	77778	77783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019391	AGA	2	6	80494	80499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019391	AAT	2	6	80590	80595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019391	TGT	2	6	81811	81816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019391	CAA	2	6	81896	81901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019391	TCC	2	6	81911	81916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019391	TTA	2	6	83424	83429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019391	AAT	2	6	83431	83436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019391	AGT	2	6	83444	83449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019391	GTT	2	6	87382	87387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019391	AGA	2	6	93515	93520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019391	AAG	2	6	93552	93557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019391	TAA	2	6	93559	93564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019391	AAT	2	6	93638	93643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019391	TTG	2	6	93676	93681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019391	GGT	2	6	93685	93690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019391	GTT	2	6	93955	93960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019391	AAG	2	6	98667	98672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019391	TCT	2	6	98939	98944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019391	AAC	2	6	99037	99042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019391	GCT	2	6	99213	99218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019391	ACA	2	6	99269	99274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019391	ATG	2	6	99371	99376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019391	ATA	2	6	99424	99429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019391	GTT	2	6	99457	99462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019391	ACT	2	6	99529	99534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019391	ATC	2	6	99551	99556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019391	TAG	2	6	99585	99590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019391	TTC	2	6	99690	99695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019391	ACT	2	6	101728	101733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019391	CAA	2	6	101778	101783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019391	TTA	2	6	108233	108238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019391	TCT	2	6	108312	108317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019391	AAC	2	6	108432	108437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019391	AGA	2	6	109131	109136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019391	GAA	2	6	110182	110187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019391	ATT	2	6	112373	112378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019391	TAC	2	6	118333	118338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019391	GAG	2	6	119154	119159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019391	ACT	2	6	120755	120760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019391	TCT	2	6	122639	122644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019391	AGT	2	6	122668	122673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019391	AAT	2	6	122765	122770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019391	ATT	2	6	122785	122790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019391	TGG	2	6	122798	122803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019391	TCC	2	6	125287	125292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019391	TAC	2	6	125299	125304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019391	TGT	2	6	125306	125311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019391	AAT	2	6	125762	125767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019391	ATT	2	6	128305	128310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019391	TTA	2	6	128340	128345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019391	TGT	2	6	128536	128541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019391	ACA	2	6	128608	128613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019391	TAC	2	6	128624	128629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019391	CTT	2	6	130359	130364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019391	ATT	2	6	130466	130471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019391	AGG	2	6	130486	130491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019391	TAA	2	6	130645	130650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019391	TAA	2	6	130779	130784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019391	ATT	2	6	130795	130800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019391	TAA	2	6	130813	130818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019391	TGT	2	6	131444	131449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019391	CAA	2	6	131482	131487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019391	TAT	2	6	131489	131494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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