MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12

Total Repeats: 14206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019391	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
2	NC_019391	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857989
3	NC_019391	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
4	NC_019391	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
5	NC_019391	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857989
6	NC_019391	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857989
7	NC_019391	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857989
8	NC_019391	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857989
9	NC_019391	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
10	NC_019391	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857989
11	NC_019391	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
12	NC_019391	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857989
13	NC_019391	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857989
14	NC_019391	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857989
15	NC_019391	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857989
16	NC_019391	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857989
17	NC_019391	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
18	NC_019391	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857990
19	NC_019391	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
20	NC_019391	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857990
21	NC_019391	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
22	NC_019391	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
23	NC_019391	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857990
24	NC_019391	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
25	NC_019391	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857990
26	NC_019391	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
27	NC_019391	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857990
28	NC_019391	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
29	NC_019391	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857990
30	NC_019391	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857990
31	NC_019391	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857990
32	NC_019391	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857990
33	NC_019391	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857990
34	NC_019391	AGT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857991
35	NC_019391	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
36	NC_019391	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857991
37	NC_019391	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857991
38	NC_019391	TTA	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
39	NC_019391	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857991
40	NC_019391	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
41	NC_019391	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857991
42	NC_019391	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
43	NC_019391	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
44	NC_019391	AGT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
45	NC_019391	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857992
46	NC_019391	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857992
47	NC_019391	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857992
48	NC_019391	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857992
49	NC_019391	AAG	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
50	NC_019391	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
51	NC_019391	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857992
52	NC_019391	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
53	NC_019391	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410857992
54	NC_019391	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857992
55	NC_019391	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
56	NC_019391	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857992
57	NC_019391	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
58	NC_019391	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857992
59	NC_019391	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857992
60	NC_019391	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
61	NC_019391	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
62	NC_019391	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857992
63	NC_019391	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
64	NC_019391	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857992
65	NC_019391	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857992
66	NC_019391	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857992
67	NC_019391	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857993
68	NC_019391	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857993
69	NC_019391	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857993
70	NC_019391	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
71	NC_019391	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
72	NC_019391	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
73	NC_019391	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
74	NC_019391	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857993
75	NC_019391	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
76	NC_019391	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
77	NC_019391	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
78	NC_019391	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
79	NC_019391	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
80	NC_019391	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857993
81	NC_019391	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857993
82	NC_019391	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857993
83	NC_019391	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857993
84	NC_019391	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857993
85	NC_019391	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857993
86	NC_019391	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857993
87	NC_019391	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857993
88	NC_019391	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857993
89	NC_019391	ACA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
90	NC_019391	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857993
91	NC_019391	CAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857993
92	NC_019391	GAA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857994
93	NC_019391	CAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857994
94	NC_019391	ACA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410857994
95	NC_019391	GTG	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410857994
96	NC_019391	TGT	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857994
97	NC_019391	TTC	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857994
98	NC_019391	GTT	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857994
99	NC_019391	CAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857994
100	NC_019391	AGA	2	6	7169	7174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857994
101	NC_019391	TAA	2	6	7252	7257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410857994
102	NC_019391	TTG	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857994
103	NC_019391	CTC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857994
104	NC_019391	GGA	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857994
105	NC_019391	TGA	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857994
106	NC_019391	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857994
107	NC_019391	TGC	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857994
108	NC_019391	TTC	2	6	7891	7896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857994
109	NC_019391	TTG	2	6	8053	8058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857995
110	NC_019391	TGC	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410857995
111	NC_019391	AAG	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
112	NC_019391	TTA	2	6	8252	8257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857995
113	NC_019391	CTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857995
114	NC_019391	GAA	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
115	NC_019391	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857995
116	NC_019391	TTC	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857995
117	NC_019391	AGG	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857995
118	NC_019391	CCT	2	6	8766	8771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410857995
119	NC_019391	AAG	2	6	8814	8819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
120	NC_019391	GTT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857995
121	NC_019391	GAA	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
122	NC_019391	CAT	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410857995
123	NC_019391	TTC	2	6	9022	9027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857995
124	NC_019391	GAA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
125	NC_019391	GAG	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410857995
126	NC_019391	AGT	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410857995
127	NC_019391	TTA	2	6	9441	9446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410857995
128	NC_019391	AGA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410857995
129	NC_019391	GTT	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410857995
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131	NC_019391	CTT	2	6	9975	9980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410857995
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257	NC_019391	AGA	2	6	20549	20554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858002
258	NC_019391	GAG	3	9	20602	20610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410858002
259	NC_019391	CCT	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410858002
260	NC_019391	GCA	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858002
261	NC_019391	TTC	2	6	20909	20914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858002
262	NC_019391	GTA	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858002
263	NC_019391	GCA	2	6	20979	20984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858002
264	NC_019391	ATT	2	6	21018	21023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858002
265	NC_019391	GTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858002
266	NC_019391	TAG	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858002
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281	NC_019391	GAA	2	6	22308	22313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858003
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285	NC_019391	ATA	2	6	22623	22628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858003
286	NC_019391	GCT	2	6	22692	22697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858003
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289	NC_019391	GTG	4	12	22747	22758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858003
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296	NC_019391	ACA	2	6	23036	23041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858003
297	NC_019391	AAG	2	6	23050	23055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858003
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378	NC_019391	AGA	2	6	29109	29114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858005
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499	NC_019391	CAA	2	6	39904	39909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858018
500	NC_019391	ATT	2	6	39953	39958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858019

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